[صفحه اصلی ]   [Archive] [ English ]  
:: صفحه اصلي :: درباره نشريه :: آخرين شماره :: تمام شماره‌ها :: جستجو :: ثبت نام :: ارسال مقاله :: تماس با ما ::
:: دوره 8، شماره 1 - ( 1400 ) ::
جلد 8 شماره 1 صفحات 42-29 برگشت به فهرست نسخه ها
بررسی تنوع ژنتیکی ژن rbcL در برخی ارقام نخل خرمای استان سیستان و بلوچستان
فاطمه رئیسی، لیلا فهمیده*، براتعلی فاخری، مجتبی کیخاصابر
چکیده:   (2156 مشاهده)
با توجه به اهمیت تولید خرما در کشور، معرفی ارقام جدید، بهبود ارقام موجود و بررسی تنوع ژنتیکی موجود بین ارقام مختلف برای بهبود کمی و کیفی تولید خرما ضروری است. در این تحقیق تنوع ژنتیکی بین 15 رقم مختلف محلی خرما از شهرستان سراوان و بخش‌های جالق، ناهوک و سینوکان استان سیستان و بلوچستان بررسی شد. به این منظور DNA از بافت برگ نمونه‌ها با استفاده از روش دلاپورتا استخراج و کیفیت و کمیت DNA استخراجی با استفاده از ژل آگارز یک درصد و دستگاه اسپکتروفتومتر تعیین شد. واکنش PCR با استفاده از آغازگرهای اختصاصی ژن rbcL بر اساس شرایط مورد نیاز انجام شد و محصول‌های PCR جهت توالی‌یابی ارسال گردید. پس از تعیین توالی، تجزیه و تحلیل‌ها و ترسیم دندروگرام روابط فیلوژنتیک و ماتریس تشابه توالی‌ها با نرم‌افزارهای Bioedit و MEGA7 انجام شد تا روابط خویشاوندی و فاصله ژنتیکی بین ارقام تعیین شود. نتایج تحقیق حاضر نشان داد که برای این نشانگر در مجموع 553 جایگاه مختلف وجود دارد که 505 جایگاه دارای حذف و اضافه و 48 جایگاه بدون حذف و اضافه بود. فاصله ژنتیکی از 0 تا 0.037 و بیشترین تنوع درون منطقه‌ای مربوط به رقم Jm13_sabzoo بود. براساس دندروگرام حاصل از تجزیه خوشه‌ای، ارقام مورد بررسی به دو شاخه تقسیم شدند که در شاخه اول رقم سبزو از جالق قرار گرفت و سایر ارقام در زیرشاخه‌های مختلف شاخه دوم قرار گرفتند. اگرچه استفاده از نشانگر rbcL برای بررسی تنوع و روابط درون‌گونه‌ای مفید است اما در خصوص ارقام خرمای مورد آزمون در این تحقیق، فاصله ژنتیکی کمی برآورد شد. بنابراین پیشنهاد می‌شود در مطالعات آینده جهت بررسی تنوع ژنتیکی خرما از سایر بارکدهای DNA و همچنین سایر نشانگرهای مولکولی مناسب استفاده شود.
واژه‌های کلیدی: تنوع ژنتیکی، خرما، روابط فیلوژنتیک، نشانگر rbcL
متن کامل [PDF 904 kb]   (324 دریافت)    
نوع مطالعه: پژوهشي | موضوع مقاله: ژنتیک مولکولی
دریافت: 1399/1/31 | پذیرش: 1399/12/12
فهرست منابع
1. Akkak, A., Scariot, V., TorelloMarinoni, D., Boccacci, P., Beltramo, C. and Botta, R. (2009). Development and evaluation of microsatellite markers in Phoenix dactylifera and their transferability to other Phoenix species. Biologia Plant Arum, 53: 164-166.
2. Dellaporta, S.L., Wood, J. and Hicks, J.B. (1993). A plant DNA minipreparation: version II. Plant Molecular Biology Reporter, 1: 19-22.
3. Elmeer, K.H., Sarwath, J., Malek, J., Baum, M. and Hamwieh, A. (2011). New microsatellite markers for assessment of genetic diversity in date palm (Phoenix dactylifera L.). Biotechnology, 1: 91-97.
4. Geilly, L. and Taberlet P. (1994). The use of chloroplast DNA to resolve plant phylogenies: noncoding versus rbcL sequences. Molecular Biology and Evolution, 11: 769-777.
5. Ghahramanzadeh, R., Marashi S.H., Wael, C. and Malekzadeh, S. (2012). Separation of invasive species of aquatic herb Mriiophyllum (Myriophyllum spp.) From its native relatives using DNA barcode. Plant Protection Quarterly, 26: 101-109.
6. Gupta, P., Varshney, R., Sharma, P. and Ramesh, B. (1999). Molecular markers and their application in wheat breeding. Plant Breeding, 118: 360-390.
7. Hashempour, M. )1999.( Date Treasure. Agricultural Education affiliated with the Office of Educational Technology Services of the Ministry of Jihad Agriculture, Tehran, IR (In Persian).
8. Hashemi Sistani, M. )2018(. Molecular analysis of some Mango genotypes by using the sequencing of the rbcL gene. M.Sc. Thesis, Faculty of Agriculture, Higher Education Complex of Shirvan, Shirvan, Iran (In Persian).
9. Hosseini, S.Z., Shiran, B. and Ebrahimi M.A. (2018). Study on phylogenetic relationship among some of Iranian wild almond species using sequences of ITS1-5.8S rDNA-ITS2 Region and chloroplastic trnL. Plant Genetic Researches, 5(2):17-28 (In Persian).
10. Khan, S., Khan, Z., Ashfaq, M. and Nisa, Z. )2016(. Identification of the grass family (Poaceae) by using the plant dna barcodes rbcL and matK. Journal of Biodiversity and Environmental Sciences, 8: 175-186.
11. Lewin, G.R., Rueff, A. and Mendell, L.M. )1994(. Peripheral and central mechanisms of NGF‐induced hyperalgesia. European Journal of Neuroscience, 6: 1903-1912.‏
12. Li, J., Bi, H., Li, Z. and Feng, J. )2008(. Genetic analysis of Ziziphus Jujube Huizao using ISSR markers. 1th International Jujube Symposium, Baoding, China.
13. Marsefri, M. and Mehrabi, A. )2010(. Evaluation of Genetic diversity of some Iranian date populations using fingerprint identification (ISSR). National Conference and Iranian Scientific Date Festival, Kerman, Shahid Bahonar University of Kerman, Kerman, Iran (In Persian).
14. MirMohammadi Maibody, S.A.M. and Golkar, P. (2019). Application of DNA molecular markers in plant breeding. Plant Genetic Researches, 6(1):1-30 (In Persian).
15. Nejad Habib, R. )2013(. Evaluation of genetic diversity within and between male and female date palms using microsatellite markers. M.Sc. Thesis, Faculty of Agriculture, University of Zabol, Zabol, Iran (In Persian).
16. Pang, X., Luo, H. and Sun, C. )2012(. Assessing the potential of candidate DNA barcodes for identifying non-flowering seed plants. Plant Biology, 14: 839-844.
17. Pejman, H. (2001). Date Guide (Planting, Holding, Harvesting). Agricultural Education and Extension, Tehran, IR (In Persian).
18. Taghinejad, H., Fahmideh, L., Samsampoor, D. and Askaryesyahooi, M. (2018). Genetic diversity of date palm cultivars in Sistan and Baluchistan and Hormozgan provinces using microsatellite. Journal of Molecular and Cellular Research, 31: 221-231 (In Persian).
19. Tamura, K. and Nei, M. (1993). Estimation of the number of nucleotide substitutions in the control region of mitochondrial DNA in humans and chimpanzees. Molecular Biology Evolution, 10: 512-526.
20. Thakur, V., Tiwari, S.H.T., Tripathi, N., Tiwari, G. and Sapre, S. (2016). DNA barcoding and phylogenetic analyses of Mentha species using rbcL sequences. Annals of Phytomedicine, 5: 59-62.
21. Varma, P., Talwar, S. and Gary, G. (1980). Chemical investigation of Silybum marianum. Palm Medica, 38: 377-378.
ارسال پیام به نویسنده مسئول

ارسال نظر درباره این مقاله
نام کاربری یا پست الکترونیک شما:

CAPTCHA



XML   English Abstract   Print


Download citation:
BibTeX | RIS | EndNote | Medlars | ProCite | Reference Manager | RefWorks
Send citation to:

Raeisi F, Fahmideh L, Fakheri B A, Kikhasaber M. Studying of Genetic Diversity of rbcL Gene in Some Date Palm Cultivars in Sistan and Baluchistan Province, Iran. pgr. 2021; 8 (1) :29-42
URL: http://pgr.lu.ac.ir/article-1-185-fa.html

رئیسی فاطمه، فهمیده لیلا، فاخری براتعلی، کیخاصابر مجتبی. بررسی تنوع ژنتیکی ژن rbcL در برخی ارقام نخل خرمای استان سیستان و بلوچستان. پژوهش های ژنتیک گیاهی. 1400; 8 (1) :42-29

URL: http://pgr.lu.ac.ir/article-1-185-fa.html



بازنشر اطلاعات
Creative Commons License این مقاله تحت شرایط Creative Commons Attribution-NonCommercial 4.0 International License قابل بازنشر است.
دوره 8، شماره 1 - ( 1400 ) برگشت به فهرست نسخه ها
پژوهش های ژنتیک گیاهی Plant Genetic Researches
Persian site map - English site map - Created in 0.2 seconds with 30 queries by YEKTAWEB 4402