[صفحه اصلی ]   [Archive] [ English ]  
:: صفحه اصلي :: درباره نشريه :: آخرين شماره :: تمام شماره‌ها :: جستجو :: ثبت نام :: ارسال مقاله :: تماس با ما ::
بخش‌های اصلی
صفحه اصلی::
اطلاعات نشریه::
آرشیو مجله و مقالات::
برای نویسندگان::
برای داوران::
ثبت نام و اشتراک::
تماس با ما::
تسهیلات پایگاه::
بایگانی مقالات زیر چاپ::
فهرست داوران همکار::
::
جستجو در پایگاه

جستجوی پیشرفته
..
دریافت اطلاعات پایگاه
نشانی پست الکترونیک خود را برای دریافت اطلاعات و اخبار پایگاه، در کادر زیر وارد کنید.
..
ISSN
شاپای آنلاین: ISSN 2676-7309
شاپای چاپی: ISSN 2383-1367
..




 
..
:: دوره 11، شماره 1 - ( 1403 ) ::
جلد 11 شماره 1 صفحات 46-37 برگشت به فهرست نسخه ها
غربالگری ژنوتیپ‌های مختلف برنج با استفاده از نشانگرهای عملکردی مرتبط با ژن Gn1a
اسمعیل طالبی کویخی ، بهرام ملکی زنجانی ، مصطفی مدرسی* ، علیرضا ترنگ
مؤسسه تحقیقات برنج کشور، سازمان تحقیقات، آموزش وترویج کشاورزی، رشت ، m.modaresi@areeo.ac.ir
چکیده:   (719 مشاهده)
موضوع امنیت غذایی متأثر از عوامل متعددی است که از مهم‌ترین آن‌ها می‌توان به افزایش کمی و کیفی محصولات کشاورزی اشاره نمود. با توجه به نقش برنج در تغذیه روزانه ایرانیان و لزوم افزایش بهره‌وری از منابع محدود سرزمینی برای تأمین نیاز به این محصول مهم، ناچار به افزایش عملکرد در واحد سطح می‌باشیم. شناسایی ژنوتیپهایی که حاوی آللهای ژنهای مرتبط با بهبود عملکرد هستند یکی از روش‌های به‌نژادی گیاهی برنج برای تولید ارقام پرمحصول است. با توجه به اهمیت صفت تعداد دانه در خوشه و اثر آن در افزایش عملکرد در واحد سطح،  در این پژوهش، از میان چندین ژن مرتبط با عملکرد، جداسازی ژنوتیپ‌های برنج با استفاده از نشانگر عملکردی مرتبط با ژن Gn1a (Grain number 1a) مورد بررسی قرار گرفت. بدین منظور 52 ژنوتیپ محلی و اصلاح شـده برنج از کلکسیون مؤسسه تحقیقات برنج کشور تهیه و صفت تعداد دانه بر اساس ارزیابیهای فنوتیپی در مزرعه و آزمایش مولکولی مبتنی بر الگوی باندی ایجاد شده با آغازگر اختصاصی ژن Gn1a مورد بررسی قرار گرفت. نتایج ارزیابی ژنتیکی ارقام منجر به شناسایی 15 رقم دارای آلل‌های مرتبط با صفت تعداد زیاد دانه و 37 رقم فاقد این آلل‌ها گردید. ارزیابی‌های فنوتیپی نیز اطمینان و دقت نشانگر مورداستفاده برای پیش‌بینی و متمایز کردن ارقام جهت برنامه‌های اصلاحی آتی را تأیید نمود.
واژه‌های کلیدی: برنج، صفت تعداد دانه در خوشه، غربالگری ژنتیکی، کارایی نشانگر عملکردی
متن کامل [PDF 625 kb]   (138 دریافت)    
نوع مطالعه: پژوهشي | موضوع مقاله: به‌نژادی گیاهی
فهرست منابع
1. Andersen, J.R. and Lübberstedt, T. (2003). Functional markers in plants. Trends in Plant Science, 8: 554-560. [DOI:10.1016/j.tplants.2003.09.010]
2. Ashikari, M., Sakakibara, H., Lin, S., Yamamoto, T., Takashi, T., Nishimura, A., Angeles, E.R., Qian, Q., Kitano, H. and Matsuoka, M. (2005). Cytokinin oxidase regulates rice grain production. Science, 309: 741-745. [DOI:10.1126/science.1113373]
3. Doyle, J. and Doyle, J.L. (1990). Isolation of plant DNA from faesh tissue. Focus, 12: 13-15. [DOI:10.2307/2419362]
4. Fernando, A., Selvaraj, M., Chavarriaga, P., Valdes, S. and Tohme, J. (2021). A clearinghouse for genome-edited crops and field testing. Molecular Plant, 14: 3-5. [DOI:10.1016/j.molp.2020.12.010]
5. Gouda, G., Parida, M., Donde, R., Gupta, M.K., Kumar, J., Mohanty, S., Panda, R., Dash, S., Pradhan, S., Mohapatra, T. and Behera, L. (2019). Identification of high grain number genes and assessment of genetic diversity in high and low grain number rice genotypes useful for marker-assisted selection breeding programs. Annals of Plant and Soil Research, 21(4): 301-311.
6. Gouda, G., Gupta, M.K., Donde, R., Kumar, J., Parida, M., Mohapatra, T., Dash, S.K., Pradhan, S.K. and Behera, L. (2020). Characterization of haplotypes and single nucleotide polymorphisms associated with Gn1a for high grain number formation in rice plant. Genomics, 112(3): 2647-2657. [DOI:10.1016/j.ygeno.2020.02.016]
7. Halilu, Z., Rabi'u Aliyu Umar, R.A., Shehu, A.A,. Turaki, A.A., Balarabe, A.H. and Gumi, A.M. (2020). Studies on some major yield responsive genes in selected rice (Oryza species) cultivars grown in Nigeria using candidate gene SSR-based markers approach. African Journal of Biotechnology, 19: 33-42. [DOI:10.5897/AJB2018.16567]
8. Ikeda, M., Miura, K., Aya, K., Kitano, H. and Matsuoka, M. (2013). Genes offering the potential for designing yield-related traits in rice. Current opinion in Plant Biology, 16: 213-220. [DOI:10.1016/j.pbi.2013.02.002]
9. Huang, Y., Dong, H., Shang, M. and Wang, K. (2021). CRISPR/Cas systems: the link between functional genes and genetic improvement. The Crop Journal, 9(3): 678-687. [DOI:10.1016/j.cj.2021.03.004]
10. Jiang, S., Sun, S., Bai, L., Ding, G., Wang, T., Xia, T., Jiang, H., Zhang, X. and Zhang, F. (2017). Resequencing and variation identification of whole genome of the japonica rice variety" Longdao24" with high yield. PLoS One, 12: e0181037. [DOI:10.1371/journal.pone.0181037]
11. Kaab Omeyr, A., PourMohammadi, P., Gilani, A., Alami-Saeid, K. and Fakhari, M. (2022). Investigation of genetic diversity and classification of aerobic and local rice genotypes in Khuzestan province. Plant Genetic Researches, 8(2):103-116 (In Persian). [DOI:10.52547/pgr.8.2.8]
12. Li, G., Xu, B., Zhang, Y., Xu, Y., Khan, N.U., Xie, J., Sun, X., Guo, H., Wu, Z.and Wang, X. (2022a). RGN1 controls grain number and shapes panicle architecture in rice. Plant Biotechnology Journal, 20: 158-167. [DOI:10.1111/pbi.13702]
13. Li, M., Pan, X. and Li, H. (2022b). Pyramiding of gn1a, gs3, and ipa1 exhibits complementary and additive effects on rice yield. International Journal of Molecular Sciences, 23: 12478. [DOI:10.3390/ijms232012478]
14. Liu, M., Fan, F., He, S., Guo, Y., Chen, G., Li, N., Li, N., Yuan, H., Si, F. and Yang, F. (2022). Creation of elite rice with high-yield, superior-quality and high resistance to brown planthopper based on molecular design. Rice, 15: 1-13. [DOI:10.1186/s12284-022-00563-7]
15. Liu, X., Zhou, S., Wang, W., Ye, Y., Zhao, Y., Xu, Q., Zhou, C., Tan, F., Cheng, S. and Zhou, D.X. (2015). Regulation of histone methylation and reprogramming of gene expression in the rice inflorescence meristem. The Plant Cell, 27: 1428-1444. [DOI:10.1105/tpc.15.00201]
16. Lübberstedt, T., Melchinger, A.E., Fähr, S., Klein, D., Dally, A. and Westhoff, P. (1998). QTL mapping in testcrosses of flint lines of maize: III. Comparison across populations for forage traits. Crop Science, 38: 1278-1289. [DOI:10.2135/cropsci1998.0011183X003800050027x]
17. Lübberstedt, T., Zein, I., Andersen, J.R., Wenzel, G., Krützfeldt, B., Eder, J., Ouzunova, M. and Chun, S. (2005). Development and application of functional markers in maize. Euphytica, 146: 101-108. [DOI:10.1007/s10681-005-0892-0]
18. Ma, F., Zhu, X., Wang, H., Wang, S., Cui, G., Zhang, T., Yang, Z., He, G., Ling, Y. and Wang, N. (2019). Identification of QTL for kernel number-related traits in a rice chromosome segment substitution line and fine mapping of qSP1. The Crop Journal, 7: 494-503. [DOI:10.1016/j.cj.2018.12.009]
19. MirMohammadi Maibody, S.A.M. and Golkar, P. (2019). Application of DNA molecular markers in plant breeding Plant Genetic Researches, 6(1):1-30 (In Persian). [DOI:10.29252/pgr.6.1.1]
20. Nellemann, C. (2009). The Environmental Food Crisis: The Environment's Role In Averting Future Food Crises: A UNEP Rapid Response Assessment. UNEP/Earthprint, United Nations Avenue, Gigiri Nairobi, KENY.
21. Nishimura, C., Ohashi, Y., Sato, S., Kato, T., Tabata, S. and Ueguchi, C. (2004). Histidine kinase homologs that act as cytokinin receptors possess overlapping functions in the regulation of shoot and root growth in Arabidopsis. The Plant Cell, 16: 1365-1377. [DOI:10.1105/tpc.021477]
22. Qian, Q., Guo, L., Smith, S.M. and Li, J. (2016). Breeding high-yield superior quality hybrid super rice by rational design. National Science Review, 3: 283-294. [DOI:10.1093/nsr/nww006]
23. Riefler, M., Novak, O., Strnad, M. and SchmüLling, T. (2006). Arabidopsis cytokinin receptor mutants reveal functions in shoot growth, leaf senescence, seed size, germination, root development, and cytokinin metabolism. The Plant Cell, 18: 40-54. [DOI:10.1105/tpc.105.037796]
24. Salami, H. and Bastani, M. (2017). Is rice import unjustified in Iran?. Journal of Agricultural Economics and Development, 31(3): 268-278 (In Persian).
25. Sharifi, P. and Aminpanah, H. (2017). Evaluation of genotype × environment interactions, stability and a number of genetic parameters in rice genotypes. Plant Genetic Researches, 3(2): 25-42 (In Persian). [DOI:10.29252/pgr.3.2.25]
26. Shen, L., Wang, C., Fu, Y., Wang, J., Liu, Q., Zhang, X., Yan, C., Qian, Q. and Wang, K (2018). QTL editing confers opposing yield performance in different rice varieties. Journal of Integrative Plant Biology, 60: 89-93. [DOI:10.1111/jipb.12501]
27. Varshney, R.K., Singh, V.K., Kumar, A., Powell, W. and Sorrells, M.E. (2018). Can genomics deliver climate-change ready crops? Current Opinion in Plant Biology, 45: 205-211. [DOI:10.1016/j.pbi.2018.03.007]
28. Xu, Z., Miao, Y., Chen, Z., Gao, H., Wang, R., Zhao, D., Zhang, B., Zhou, Y., Tang, S. and Zhang, H. (2019). Identification and fine mapping of qGN1c, a QTL for grain number per panicle, in rice (Oryza sativa). Molecular Breeding, 39: 1-12. [DOI:10.1007/s11032-019-1039-7]
29. Yan, C.J., Yan, S., Yang, Y.C., Zeng, X.H., Fang, Y.W., Zeng, S.Y., Tian, C.Y., Sun, Y.W., Tang, S.Z. and Gu, M.H. (2009). Development of gene-tagged markers for quantitative trait loci underlying rice yield components. Euphytica, 169: 215-226. [DOI:10.1007/s10681-009-9937-0]
30. Yang, Y., Shen, Z., Xu, C., Guo, M., Li, Y., Zhang, Y., Zhong, C., Sun, S. and. Yan, C. (2020). Genetic improvement of panicle-erectness japonica rice toward both yield and eating and cooking quality. Molecular Breeding, 40: 1-12. [DOI:10.1007/s11032-020-01127-7]
31. Zeng, D., Tian, Z., Rao, Y., Dong, G., Yang, Y., Huang, L., Leng, Y., Xu, J., Sun, C., Zhang, G. and Hu, J. (2017). Rational design of high-yield and superior-quality rice. Nature plants, 3(4): 1-5. [DOI:10.1038/nplants.2017.31]
32. Zhang, G.H., Li, S.Y., Wang, L., Ye, W.J., Zeng, D.L., Rao, Y.C., Peng, Y.L., Hu, J., Yang, Y.L., Xu, J. Ren, D.Y., Gao, Z.Y., Zhu, L., Dong, G.J., Hu, X.M., Yan, M.X., Guo, L.B. , Li, C.Y. and Qian, Q. (2014). LSCHL4 from japonica cultivar, which is allelic to NAL1, increases yield of indica super rice 93-11. Molecular Plant, 7: 1350-1364. [DOI:10.1093/mp/ssu055]
ارسال پیام به نویسنده مسئول

Research code: 17-04-04-005-00180



XML   English Abstract   Print


Download citation:
BibTeX | RIS | EndNote | Medlars | ProCite | Reference Manager | RefWorks
Send citation to:

Talebi Kouyakhi S, Maleki Zanjani B, Modarresi M, Tarang A. Screening of Different Rice Genotypes Using Functional Markers Related to Gn1a gene. pgr 2024; 11 (1) :37-46
URL: http://pgr.lu.ac.ir/article-1-299-fa.html

طالبی کویخی اسمعیل، ملکی زنجانی بهرام، مدرسی مصطفی، ترنگ علیرضا. غربالگری ژنوتیپ‌های مختلف برنج با استفاده از نشانگرهای عملکردی مرتبط با ژن Gn1a. پژوهش های ژنتیک گیاهی. 1403; 11 (1) :37-46

URL: http://pgr.lu.ac.ir/article-1-299-fa.html



بازنشر اطلاعات
Creative Commons License این مقاله تحت شرایط Creative Commons Attribution-NonCommercial 4.0 International License قابل بازنشر است.
دوره 11، شماره 1 - ( 1403 ) برگشت به فهرست نسخه ها
پژوهش های ژنتیک گیاهی Plant Genetic Researches
Persian site map - English site map - Created in 0.07 seconds with 40 queries by YEKTAWEB 4657