[صفحه اصلی ]   [Archive] [ English ]  
:: صفحه اصلي :: درباره نشريه :: آخرين شماره :: تمام شماره‌ها :: جستجو :: ثبت نام :: ارسال مقاله :: تماس با ما ::
:: دوره 8، شماره 2 - ( 1400 ) ::
جلد 8 شماره 2 صفحات 32-23 برگشت به فهرست نسخه ها
ارزیابی ساختار جمعیت و برآورد پارامترهای ژنتیکی در جمعیت‌های اصلاحی و بومی گندم دوروم با استفاده از نشانگرهای ISSR
محمود اصلان پرویز، ورهرام رشیدی، منصور امیدی*، علیرضا اطمینان، علیرضا احمدزاده
چکیده:   (1437 مشاهده)
ارزیابی تنوع ژنتیکی یکی از اصول اولیه برنامه های اصلاحی می باشد که شرایط مناسبی جهت بررسی ویژگی­ های ژنتیکی و شناسایی آلل های جدید برای به نژادگران گیاهی را فراهم می آورد. در این پژوهش تنوع ژنتیکی موجود در 69 ژنوتیپ بومی و لاین اصلاحی گندم دوروم با استفاده از آغازگرهای ISSR، مورد بررسی قرار گرفت. با استفاده از 16 آغازگر در مجموع 163 قطعه تکثیر شد که 160 قطعه از آن­ها چندشکل بودند. با توجه به میانگین شاخص­های محتوای چندشکلی (PIC)، قدرت تمایز (Rp) و شاخص نشانگر (MI)، مشخص شد که آغازگرهای استفاده شده کارایی لازم جهت بررسی روابط بین ژنوتیپ‌ها و ساختارهای ژنتیکی را دارند. تجزیه واریانس مولکولی (AMOVA) نشان داد که میزان تنوع درون جمعیت‌‌ها نسبت به بین جمعیت‌ها بیشتر است. بر اساس مقادیر شاخص های تنوع ژنتیکی مشخص شد که بیشترین تعداد آلل های مشاهده شده (Na)، بیشترین میزان شاخص شانون (I) و درصد مکان­های چندشکل (PPL) مربوط به ژنوتیپ های بومی است. تجزیه خوشه ای و بررسی ساختار جمعیت، تمامی ژنوتیپ های ارزیابی شده را به‌ترتیب در سه گروه اصلی و شش زیرجمعیت دسته‌بندی کردند. به‌طور کلی نتایج به‌دست آمده نشان داد که تنوع ژنتیکی بالایی در درون جمعیت های بومی گندم دوروم وجود دارد؛ بنابراین این مجموعه می تواند به‌عنوان یک منبع ژنی با ارزش جهت گزینش لاین های والدینی جهت استفاده در برنامه­ های اصلاحی گندم دوروم مورد استفاده قرار گیرد.
واژه‌های کلیدی: تجزیه خوشه‌ای، ساختار جمعیت، گندم دوروم، نشانگرهای مولکولی
متن کامل [PDF 706 kb]   (165 دریافت)    
نوع مطالعه: پژوهشي | موضوع مقاله: ژنتیک مولکولی
دریافت: 1400/3/12 | پذیرش: 1400/12/9
فهرست منابع
1. Anderson, J.A., Churchill, G.A., Autrique, J.E., Tanksley, S.D. and Sorrells, M.E. (1993). Optimizing parental selection for genetic linkage maps. Genome, 36: 181-186. [DOI:10.1139/g93-024]
2. Anonymous. (2018). Word wheat Production-North Dakota Wheat Commission. Access in: www.ndwheat.com/uploads/resources/546/world-web-charts.pdf
3. Collard, B.C.Y. and Mackill, D. (2008). Marker-assisted selection: an approach for precision plant breeding in the twenty-first century. Philosophical Transactions of the Royal Society B: Biological Sciences, 363: 557-572. [DOI:10.1098/rstb.2007.2170]
4. De Ponti, O. (2010). Germplasm Exploitation and Ownership: Who owns what? 2nd International Symposium on Genomics of Plant Genetic Resources, Bologna, Italy.
5. Doyle, J.J. and Doyle, J.L. (1987). A rapid DNA isolation procedure for small quantities of fresh leaf tissue. Phytochemical Bulletin, 19: 11-15.
6. Earl, D.A. and Holdt, B.M. (2012). Structure Harvester: a website and program for visualizing STRUCTURE output and implementing the Evanno method. Conservation Genetic Resource, 4: 359-361. [DOI:10.1007/s12686-011-9548-7]
7. Eghlima, G., Kheiry, A., Sanikhani, M., Hadian, J. and Aelaei, M. (2021). Study of genetic diversity of glycyrrizha glabra L. populations using ISSR molecular markers. Plant Genetic Researches, 8(1): 81-94 (In Persian). [DOI:10.52547/pgr.8.1.6]
8. Etminan, A., Pour-Aboughadareh, A., Mohammadi, R., Ahmadi-Rad, A.A., Moradi, Z. and Noori, A. (2017). Evaluation of genetic diversity in a mini core collection of Iranian durum wheat germplasms. Journal of Animal and Plant Science, 19: 943-956.
9. Etminan, A., Pour-Aboughadareh, A., Mohammadi, R., Ahmadi-Rad, A., Noori, A., Mahdavian, Z. and Moradi, Z. (2016). Applicability of start codon targeted (SCoT) and inter-simple sequence repeat (ISSR) markers for genetic diversity analysis in durum wheat genotypes. Biotechnology and Biotechnology Equipment, 30: 1075-1081. [DOI:10.1080/13102818.2016.1228478]
10. Fbriani, G. and Lintas, C. (1988). Durum wheat: Chemistry and Technology. American Association Cereal Chemist, Saint Paul, Minnesota, USA.
11. Garrido-Cardenas, J.A., Mesa-Valle, C. and Manzano-Agugliaro, F. (2018). Trends in plant research using molecular markers. Planta, 247(3): 543-557. [DOI:10.1007/s00425-017-2829-y]
12. Liu, B. and Wendel, J. (2001). Inter simple sequence repeat (ISSR) polymorphisms as a genetic marker system in cotton. Molecular Ecology Notes, 1: 205-208. [DOI:10.1046/j.1471-8278.2001.00073.x]
13. Mardi, M., Naghavi, M.R., Pirseyedi, S.M., Kazemi Alamooti, M., Rashidi Monfared, S., Ahkami, A.H., Omidbakhsh, M.A., Alavi, N.S., Salehi Shanjani, P. and Katsiotis, A. (2011). Comparative assessment of SSAP, AFLP and SSR markers for evaluation of genetic diversity of durum wheat (Triticum turgidum L. var. durum). Journal of Agricultural Science and Technology, 13: 905-920.
14. Maxted, N., Ford-Lloyd, B.V., Jury, S.L., Kell, S.P. and Scholten, M.A. (2006). Towards a definition of a crop wild relative. Biodiversity and Conservation, 15: 2673-2685. [DOI:10.1007/s10531-005-5409-6]
15. Peakall, R. and Smouse, P.E. (2006). GENALEX 6: genetic analysis in excel. Population genetic software for teaching and research. Molecular Ecology Notes, 6: 288-295. [DOI:10.1111/j.1471-8286.2005.01155.x]
16. Pour-Aboughadareh, A., Ahmadi, J., Mehrabi, A.A., Etminan, A. and Moghaddam, M. (2018). Insight into the genetic variability analysis and relationships among some Aegilops and Triticum species, as genome progenitors of bread wheat, using SCoT markers. Plant Biosystem, 152(4): 694-703. [DOI:10.1080/11263504.2017.1320311]
17. Pour-Aboughadareh, A., Mahmoudi, M., Moghaddam, M., Ahmadi, J., Mehrabi, A.A. and Alavikia, S.S. (2017). Agro-morphological and molecular variability in Triticum boeoticum accessions from Zagros Mountains, Iran. Genetics Resource and Crop Evolution, 64: 545-556. [DOI:10.1007/s10722-016-0381-4]
18. Powell, W., Morgante, M., Andre, C., Hanafey, M., Vogel, J., Tingey, S. and Rafalski, A. (1996). The comparison of RFLP, RAPD, AFLP and SSR (microsatellite) markers for germplasm analysis. Molecular Breeding, 2: 225-238. [DOI:10.1007/BF00564200]
19. Prevost, A. and Wilkinson, M.J. (1999). A new system of comparing PCR primers applied to ISSR fingerprinting of potato cultivars. Theoretical and Applied Genetics, 98: 107-112. [DOI:10.1007/s001220051046]
20. Rashidimonfared, S., Hosseinzadeh, A., Mardi, M., Naghavi, M. and Pirseyedi, S. (2008). Evaluation of diversity in durum wheat using retrotransposon markers SSAP (Sequence-Specific Amplification Polymorphism). Water and Soil Science, 12(45): 147-155.
21. Tamura, K., Peterson, D., Peterson, N., Stecher, G., Nei, M. and Kumar, S. (2011). MEGA5: molecular evolutionary genetics analysis using maximum likelihood, evolutionary distance, and maximum parsimony methods. Molecular Biology Evolution, 28: 2731-2739. [DOI:10.1093/molbev/msr121]
22. Varshney, R.K., Chabane, K., Hendre, P.S., Ramesh, K., Aggarwal, K. and Graner, A. (2007). Comparative assessment of EST-SSR, EST-SNP and AFLP markers for evaluation of genetic diversity and conservation of genetic resources using wild, cultivated and elite barleys. Plant Science, 173: 638-649. [DOI:10.1016/j.plantsci.2007.08.010]
23. Weide, A., Rieh, S., Zeidi, M. and Conard, N.J. (2013). Using new morphological criteria to identify domesticated emmer wheat at the aceramic neolithic site of Chogha Golan (Iran). Journal of Archaeological Science, 57: 109-118. [DOI:10.1016/j.jas.2015.01.013]
24. Zietkiewicz, E., Rafalski, A. and Labuda, D. (1994). Genome fingerprinting by simple sequence repeat (SSR) anchored polymerase chain reaction amplification. Genomics, 20: 176-183. [DOI:10.1006/geno.1994.1151]
ارسال پیام به نویسنده مسئول

ارسال نظر درباره این مقاله
نام کاربری یا پست الکترونیک شما:

CAPTCHA



XML   English Abstract   Print


Download citation:
BibTeX | RIS | EndNote | Medlars | ProCite | Reference Manager | RefWorks
Send citation to:

Aslanparviz M, Rashidi V, Omidi M, Etminan A, Ahmadzadeh A. Evaluation of Population Structure and Estimation of Genetic Parameters in Breeding Lines and Landraces Populations of Durum Wheat Using ISSR Markers. pgr. 2022; 8 (2) :23-32
URL: http://pgr.lu.ac.ir/article-1-217-fa.html

اصلان پرویز محمود، رشیدی ورهرام، امیدی منصور، اطمینان علیرضا، احمدزاده علیرضا. ارزیابی ساختار جمعیت و برآورد پارامترهای ژنتیکی در جمعیت‌های اصلاحی و بومی گندم دوروم با استفاده از نشانگرهای ISSR. پژوهش های ژنتیک گیاهی. 1400; 8 (2) :32-23

URL: http://pgr.lu.ac.ir/article-1-217-fa.html



بازنشر اطلاعات
Creative Commons License این مقاله تحت شرایط Creative Commons Attribution-NonCommercial 4.0 International License قابل بازنشر است.
دوره 8، شماره 2 - ( 1400 ) برگشت به فهرست نسخه ها
پژوهش های ژنتیک گیاهی Plant Genetic Researches
Persian site map - English site map - Created in 0.19 seconds with 30 queries by YEKTAWEB 4419