[صفحه اصلی ]   [Archive] [ English ]  
:: صفحه اصلي :: درباره نشريه :: آخرين شماره :: تمام شماره‌ها :: جستجو :: ثبت نام :: ارسال مقاله :: تماس با ما ::
:: دوره 8، شماره 1 - ( 1400 ) ::
جلد 8 شماره 1 صفحات 28-17 برگشت به فهرست نسخه ها
ارزیابی تنوع ژنتیکی در بین نمونه‌های مختلف گیاه استبرق با نشانگرهای مولکولی ISSR
سعید نواب پور*، احد یامچی، ساسان گل چشمه
چکیده:   (2497 مشاهده)
مطالعه حاضر جهت طبقه‌بندی و بررسی تنوع ژنتیکی بین نمونه­‌های استبرق مناطق مختلف استان کرمان با استفاده از نشانگرهای ISSR انجام شد. در مجموع DNA مربوط به 14 نمونه گیاهی با 9 آغازگر ISSR با استفاده از واکنش PCR تکثیر شد و الگوی باندی آن‌ها به‌دست آمد. آغازگرهای مورد استفاده چندشکلی قابل‌قبولی (35.93) را نشان دادند به‌نحوی‌که حداقل و حداکثر شاخص اطلاعات چندشکل آغازگرهای به‌کار رفته در این مطالعه به‌ترتیب 0.11 برای آغازگر ISSR9 و 0.41 برای آغازگرهای ISSR3 و ISSR8 بود. میزان شباهت ژنتیکی بر اساس شاخص نی از 0.405 تا 0.745 به‌دست آمد و کم‌ترین شباهت ژنتیکی بین نمونه‌های جیرفت 3 و دوساری 2 و بیشترین شباهت ژنتیکی بین نمونه‌های جیرفت 1 و جیرفت 2 بود. با استفاده از تجزیه خوشه‌ای به‌روش UPGMA، نمونه‌ها در چهار گروه قرار گرفتند که گروه‌های دوم و سوم نمونه‌های بیشتری را در خود جای دادند. از نظر نزدیکی ژنتیکی نیز دو نمونه جیرفت 1 و جیرفت 2 که در یک خوشه قرار داشتند، نزدیک‌تر بودند. همچنین نمونه‌های جمع‌آوری شده از عنبرآباد نسبت به سایر نمونه‌ها در فاصله ژنتیکی دورتری قرار داشت. تجزیه به مختصات اصلی نیز نشان داد مؤلفه‌های اول و دوم 67 درصد از تنوع به‌دست آمده را توجیه می‌کنند. به‌طور کلی نشانگرهای ISSR برای طبقه‌بندی نمونه‌های استبرق مفید بود و با توجه به اطلاعات به‌دست آمده مبنی بر وجود تنوع ژنتیکی در بین نمونه‌های استبرق استان کرمان، از این تنوع می‌توان در آینده در به‌نژادی و تولید استبرق زراعی بهره جست.
واژه‌های کلیدی: چندشکلی، ذخایر ژنتیکی، فاصله ژنتیکی، گیاه دارویی، نشانگر DNA
متن کامل [PDF 507 kb]   (451 دریافت)    
نوع مطالعه: پژوهشي | موضوع مقاله: ژنتیک مولکولی
دریافت: 1399/1/31 | پذیرش: 1400/1/15
فهرست منابع
1. Abbasi, H.A., Tasaodi, S., Mirsoleimani, M.A. and Masoudi, M. (2016). Study of milkweed (Calotropis procera) regeneration potential in vitro culture conditions. Journal of Plant Researches, 29: 833-842 (In Persian).
2. Agossou-Yao, D.A.R., Sprycha, Y., Porembski, S. and Horn, R. (2015). AFLP assessment of the genetic diversity of Calotropis procera (Apocynaceae) in the West Africa region (Benin). Genetic Resources and Crop Evolution, 62: 863-878.
3. Ahmadi-Khah, A. (2011). Advanced Genetic, 2nd. Gorgan University of Agricultural Sciences and Natural Resources, Gorgan, Iran (In Persian).
4. Ahmed, A., El-Bakry, A., Hammad, I.A. and Rafat, F.A. (2014). Polymorphism in Calotropis procera: preliminary genetic variation in plants from different phytogeographical regions of Egypt. Rendiconti Lincei Scienze Fisiche Naturali, 25: 471-477.
5. Al-Yemni, M.N., Sher, H., El-Sheikh, M.A. and Eid, E.M. (2011). Bioaccumulation of nutrient and heavy metals by Calotropis procera and Citrullus colocynthis and their potential use as contamination indicators. Scientific Research and Essays, 6: 966-976.
6. Amiri, P., Ismaili, A. and Hadian, J. (2017). Evaluation of genetic diversity of Styrian pumpkin (Cucurbita pepo var. styriaca) populations, using ISSR molecular markers. Plant Genetic Researches, 4(2): 17-28 (In Persian).
7. Anderson, J.A., Churchill, G.A., Autrique, J.E., Tanksley, S.D. and Sorrells, M.E. (1993). Optimizing parental selection for genetic linkage maps. Genome, 36: 181-186.
8. Ash, G.H., Raman, R. and Crump, N.S. (2002). An investigation of genetic variation in Carthamus lanatus in New South Wales, Australia, using inter simple sequence repeats (ISSR) analysis. European Weed Research Society, 43: 208-213.
9. Babakhani, M. and Yavari, A. (2018). Calotropis procera Willd. medicinal plant, ideal for afforestation in the Persian Gulf and Oman sea. 1st National Conference on Novel Ideas in Agriculture and Natural Resources, University of Mohaghegh Ardabili, Iran (In Persian).
10. Doyle, J. and Doyle, J. (1987). A rapid DNA isolation procedure for small quantities of fresh leaf tissue. Phytochemical Bulletin, 19: 11-15.
11. Farshadfar, E. (1998). Application of Biometrical Genetics in Plant Breeding (I and II), Razi University of Kermanshah, Kermanshah, Iran (In Persian).
12. Ghandehari, V., Ahmadi-Khah, A. and Payamnoor, V. (2013). Genetic diversity of Buxus hyrcana populations in north of Iran using ISSR markers. Iranian Journal of Rangelands and Forests Plant Breeding and Genetic Research, 21: 1-13 (In Persian).
13. Golcheshmeh, S., Pahlavani, M.H., Esmaeilzadeh-Moghaddam, M. and Zaynali-Nezhad, K. (2019). Morphological evaluation and marker assisted for tillering of wheat. Journal of Crop Breeding, 11: 153-160 (In Persian).
14. Hoisington, D., Khairallah, M., Reeves, T., Ribaut, J.M., Skovmand, M., Taba, S. and Warburton, M. (1999). Plant genetic resources: What can they contribute toward increased crop productivity? National Academy of Sciences, 96: 5937-5943.
15. Kakaei, M., Mazahery-Laghab, H. and Kahrizi, D. (2013). Study of morphological and biochemical to determine the genetic diversity of cultivated Oat (Avena sativa L.). Agricultural Biotechnology Journal, 5: 119-138 (In Persian).
16. Khorshidi, J., Shokrpour, M. and Nazeri, V. (2018). Assessment of genetic diversity in different populations of Thymus daenensis Celak. using ISSR marker. Journal of Agricultural Biotechnology, 10: 59-74 (In Persian).
17. Krasteva, L. (2000). Organization of Melon plant genetic resources in Bulgaria. Acta Horticulturae, 510: 247-25.
18. Mondak, B. (2013). Study of hybridization, genetic and phytochemical diversity in native Thyme of Iran. M.Sc. Thesis, University of Tehran, Tehran, Iran.
19. Nei, M. (1978). Estimation of average heterozygosity and genetic distance from a small number of individuals. Center for Demographic and Population Genetics, 89: 583-590.
20. Padhy, B.M., Srivastava, A. and Kumar, V.L. (2007). Calotropis procera latex affords protection against carbon tetrachloride induced hepatotoxicity in rats. Journal of Ethnopharmacology, 113: 498-502.
21. Raghavan, R.S. (1957). Chromosome number in Indian medicinal plants. In Proceedings of the Indian Academy of Sciences-Section B, 45: 294-298.
22. Rahmati, H. and Shirvani, H. (2018). The study of genetic diversity Dactylis glumerata ecotype using ISSR molecular marker. Iranian Journal of Biology, 31: 1-9 (In Persian).
23. Ramezani, M. and Rahimi, M. (2017). Grouping and estimation of genetic diversity of different ecotypes of medicinal plant of Plantago psyllium using ISSR marker. Journal of Cellular and Molecular Researches, 30: 141-151 (In Persian).
24. Reddy, M.P., Sarla, N. and Siddiq, E.A. (2002). Inter simple sequence repeat (ISSR) polymorphism and its application in plant breeding. Euphytica, 128: 9-17.
25. Ribaut, J.M., Banziger, M. and Hoisington, D. (2002). Use of Molecular Markers in Plant Breeding: Drought Tolerance Improvement in Tropical Maize. In: Kang, M.S., Ed., Quantitative Genetics, Genomics and Plant Breeding, pp. 85-100. Louisiana State University, Baton Rouge, USA.
26. Sabzalian, M.R., Mirlohi, A., Saeidi, G. and Rabbani, M.T. (2009). Genetic variation among population of wild safflower, Carthamus oxyacanthus analyzed by agro-morphological traits and ISSR markers. Genetic Resources and Crop Evolution, 56: 1057-1064.
27. Salami, A., Pahlevani, M., Zaynali-Nezhad, K. and Esmaeilzadeh Moghaddam, M. (2018). Genetic variation pattern of Iranian wheat landraces based on ISSR molecular markers and morphological traits. Plant Genetic Researches, 5: 87-100 (In Persian).
28. Soltani-Eini, M., Razmi, G.H., Afkhami, A. and Ahmadi, A. (2012). Therapeutic effects of liquid, hydro alcohol extracts of Calotropis spp. and Butalex, against Haemoproteus spp. infection in Pigeons. Journal of Veterinary Microbiology, 8: 101-107 (In Persian).
29. Yang, B.C., Xiao, B.G., Chen, X.J. and Shi, C.H. (2005). Genetic diversity of flue-cured tobacco varieties based on ISSR markers. Yi Chuan Hereditas, 27: 753-758.
30. Yang, Y.X., Wu, W., Zheng, Y.L., Chen, L., Liu, R.J. and Huang, C.Y. (2007). Genetic diversity and relationships among safflower (Carthamus tinctorius L.) analyzed by inter-simple sequence repeats (ISSRs). Genetic Resources and Crop Evolution, 54: 1043-1051.
31. Ying-Ben, L., Yang, L., Yi-Chun, T.I., Li-Yuang, W., Hao, C. and Ping-Seng, W. (2010). Assessment of genetic diversity and relationship of Tea germplasm in Yunnan as revealed by ISSR markers. Acta Agronomica Sinica, 36: 391-400.
32. Zamani, Z., Sarkhosh, A., Fattahi-Moghaddam, M.R. and Ebadi, A. (2005). Comparison of six genomic DNA extraction methods from pomegranate (Punica granatum L.). Iranian Journal of Horticultural Science and Technology, 6: 99-110 (In Persian).
ارسال پیام به نویسنده مسئول

ارسال نظر درباره این مقاله
نام کاربری یا پست الکترونیک شما:

CAPTCHA



XML   English Abstract   Print


Download citation:
BibTeX | RIS | EndNote | Medlars | ProCite | Reference Manager | RefWorks
Send citation to:

Navabpour S, Yamchi A, Golcheshmeh S. Assessment of Genetic Diversity between Different Accessions of Calotropis Procera with ISSR Molecular Markers. pgr. 2021; 8 (1) :17-28
URL: http://pgr.lu.ac.ir/article-1-183-fa.html

نواب پور سعید، یامچی احد، گل چشمه ساسان. ارزیابی تنوع ژنتیکی در بین نمونه‌های مختلف گیاه استبرق با نشانگرهای مولکولی ISSR. پژوهش های ژنتیک گیاهی. 1400; 8 (1) :28-17

URL: http://pgr.lu.ac.ir/article-1-183-fa.html



بازنشر اطلاعات
Creative Commons License این مقاله تحت شرایط Creative Commons Attribution-NonCommercial 4.0 International License قابل بازنشر است.
دوره 8، شماره 1 - ( 1400 ) برگشت به فهرست نسخه ها
پژوهش های ژنتیک گیاهی Plant Genetic Researches
Persian site map - English site map - Created in 0.19 seconds with 30 queries by YEKTAWEB 4402