[صفحه اصلی ]   [Archive] [ English ]  
:: صفحه اصلي :: درباره نشريه :: آخرين شماره :: تمام شماره‌ها :: جستجو :: ثبت نام :: ارسال مقاله :: تماس با ما ::
:: دوره 6، شماره 2 - ( 1398 ) ::
جلد 6 شماره 2 صفحات 182-173 برگشت به فهرست نسخه ها
qGW، یک QTL پایدار و بزرگ اثر برای افزایش وزن دانه برنج (Oryza sativa L)
محمدرضا جعفرزاده رزمی، سعید نواب پور، حسین صبوری*، سیده ساناز رمضان‌پور
چکیده:   (5909 مشاهده)
به‌‌منظور تجزیه ژنتیکی صفات زراعی در برنج، آزمایشی با 116 رگه خویش آمیخته‌‌ نوترکیب F9 حاصل از تلاقی ارقام اهلمی‌طارم × سپیدرود در مزرعه تحقیقاتی دانشکده کشاورزی دانشگاه گنبدکاووس با سه تکرار در سال‌‌های 1395 و 1396 اجرا شد. نقشه پیوستگی جمعیت با 80 نشانگر SSR، 28 آلل چندشکل iPBS (79 آلل چند‌شکل)، 7نشانگر IRAP (17 آلل) و 26 نشانگر ISSR (70آلل) تهیه شد که 1275.4 سانتی مورگان از ژنوم برنج را پوشش داد. تجزیه QTL به روش مکان‌یابی فاصله‌‌ای مرکب (CIM) انجام شد و در مجموع دو سال، پانزده QTL برای صفات مورد مطالعه مکان‌‌یابی شد. اثر افزایشی QTLهای ردیابی شده بین 6.725 گرم برای وزن دانه تا 85.626- گرم برای وزن دانه متغیر بود. واریانس فنوتیپی توجیه شده توسط این QTLها نیز از 11.3تا 20 درصد متغیر بود. بیشترین میزان توجیه، مربوط به QTL وزن دانه در سال اول آزمایش بود. از بین QTLهای ردیابی شده، qGWهای روی کروموزوم یک به‌‌عنوان QTLهای پایدار و بزرگ اثر برای افزایش وزن دانه برنج (Oryza sativa L.) شناسایی شد که پس از تعیین اعتبار می‌‌تواند در برنامه‌‌های اصلاحی و انتخاب به کمک نشانگر مورد استفاده قرار گیرد.
واژه‌های کلیدی: برنج، نشانگرهای مولکولی، نقشه لینکاژی، وزن دانه، وزن ساقه، QTL
متن کامل [PDF 1328 kb]   (664 دریافت)    
نوع مطالعه: كاربردي | موضوع مقاله: ژنتیک مولکولی
دریافت: 1398/7/15 | پذیرش: 1398/10/21
فهرست منابع
1. Ahmadi, J., Fotukian, M.H. and Fabriki Urang, S. (2009). Study of the association between microsatellite markers (SSRs) and yield components QTLs in rice (Oryza sativa L.). Modern Genetics, 3(4): 45-55 (In Persian).
2. Ahmadizadeh, M., Babaeian-Jelodar, N., Mohammadi-Nejad, G.H., Bagheri, N. and Singh, R.K. (2017). Identification of QTLs for rice yield and yield-related traits using high density SNPs linkage map. Journal of Agricultural Biotechnology, 9(3): 1-24 (In Persian).
3. Allagholipor, M. and Mohamadsalehi, M.S. (2015). Characteristics of Some Local Rice Cultivars in Guilan Province conditions. Ministry of Jihad-Agriculture, Agricultural Research, Education and Extension Organization, Rice Research Institute of Iran. Tehran, IR (In Persian).
4. Bai, X., Luo, L., Yan, W., Kovi, M.R., Zhan, W. and Xing, Y. (2010). Genetic dissection of rice grain shape using a recombinant inbred line population derived from two contrasting parents and fine mapping a pleiotropic quantitative trait locus qGL7. BMC Genetics, 11: 1-16. [DOI:10.1186/1471-2156-11-16]
5. Basten, C.J., Weir, B.S. and Zeng, Z.B. (2001). QTL Cartographer: A Reference Manual and Tutorial for QTL Mapping. North Carolina State University Press, Rigley, North Carolina, USA.
6. Bian, J.M., He, H.H., Li, C.J., Shi, H., Zhu, C.L., Peng, X.S., Fu, J.R., He, X.P., Chen, X.R., Hu, L.F. and Ouyang, L.J. (2013). Identification and validation of a new grain weight QTL in rice. Genetics Molecular Research, 12(4): 5623-5633. [DOI:10.4238/2013.November.18.11]
7. Courtois, B., Ahmadi, N., Khowaja, F., Price, A.H., Rami, J.F., Frouin, J., Hamelin, C.H. and Ruiz, M. (2009). Rice root genetic architecture: meta-analysis from a drought QTL database. Rice, 2: 115-128. [DOI:10.1007/s12284-009-9028-9]
8. Ebadi, A.A., Farshadfar, E. and Rabiei, B. (2013). Analysis of quantitative trait loci for rice cooking and eating quality based on an Iranian RILs population. Crop Biotechnology, 3(2): 59-72 (In Persian).
9. Fan, C., Xing, Y., Mao, H., Lu, T., Han, B. and Xu, C. (2006). GS3, a major QTL for grain length and weight and minor QTL for grain width and thickness in rice, encodes a putative transmembrane protein. Theoretical and Applied Genetics, 112: 1164-1171. [DOI:10.1007/s00122-006-0218-1]
10. Fotokian, M.H., Ahamadi, G., Amiri Oghan, H., Sadatnori, A., Naji, A.M., Mohammadinejad, G., Mohaddes, A. and Agahi, K. (2009). Introduction of quantitative trait loci related to plant height, number of tiller and flag leaf length and width in rice (Oryza sativa L.) using microsattelite markers. Iranian Journal of Biology, 23(2): 488-497 (In Persian).
11. Ishimaru, K., Hirotsu, N., Madoka, Y., Murakami, N., Hara, N. and Onodera, H. (2013). Loss of V function of the IAAglucose hydrolase gene TGW6 enhances rice grain weight and increases yield. Nature Genetics, 45: 707-711. [DOI:10.1038/ng.2612]
12. Kaviani Charati, A., Sabouri, H., Fallahi, H.A. and Jorjani, E. (2016). QTL mapping of spike characteristics in barley using F3 and F4 families derived from Badia × Komino cross. Plant Genetic Researches, 3(1): 13-28 (In Persian). [DOI:10.29252/pgr.3.1.13]
13. Kosambi, D.D. (1944). The estimation of map distances from recombination values. Annual Eugen, 12: 172-175. [DOI:10.1111/j.1469-1809.1943.tb02321.x]
14. Kwon, S.J., Cho, Y.C., Kwon, S.W., Oh, C.S., Suh, J.P., Shin, Y.S., Kim, Y.J., Holligan, D., Wessler, S.R., Hwang, H.G. and Ahn, S.N. (2008). QTL mapping of agronomic traits using an RIL population derived from a cross between temperate japonica cultivars in rice (Oryza sativa L.). Breeding Science, 58: 271-279. [DOI:10.1270/jsbbs.58.271]
15. Li, S.B., Zhang, Z.H., Hu, Y., Li, C.Y., Jiang, X., Mao, T., Li, Y.S. and Zhu, Y.G. (2006). Genetic dissection of developmental behavior of crop growth rate and its relationships with yield and yield related traits in rice. Plant Science, 170: 911-917. [DOI:10.1016/j.plantsci.2005.12.005]
16. Li, Y., Fan, C., Xing, Y., Jiang, Y., Luo, L. and Sun, L. (2011). Natural variation in GS5 plays an important role in regulating grain size and yield in rice. Nature Genetics, 43: 1266-1269. [DOI:10.1038/ng.977]
17. Lin, H.X., Zhu, M.Z., Yano, M., Gao, J.P., Liang, Z.W., Su, W.A., Hu, X.H., Ren, Z.H. and Chao, D.Y. (2004). QTLs for Na and K uptake of the shoots and roots controlling rice salt tolerance. Theoretical and Applied. Genetics, 108: 253-260. [DOI:10.1007/s00122-003-1421-y]
18. Liu, B.H. (1998). Statistical Genomics; Linkage, Mapping and QTL Analysis. CRC Press, Florida, USA.
19. Manly, K.F. and Olson, J.M. (1999). Overview of QTL mapping software an introduction to map manager QT. Mammalian Genome, 10: 327-334. [DOI:10.1007/s003359900997]
20. Mc Couch, S.R., Teytelman, L., Xu, Y., Lobos, K., Clare, K. and Walton, M. (2002). Development of 2243 new SSR markers for rice by the international rice microsatellite initiative. Proceeding of the First International Rice Congress, Shanghai, China.
21. Movafegh, S., Rabiee, B., Zare Feizabadi, A. and Taheri, G. (2009). Mapping QTLs controlling yield in two Iranian rice cultivars-F2 populations. Iranian Journal of Agricultural Research, 7(2): 673-683 (In Persian).
22. Nelson, J.C. (1997). QGENE: software for marker-based genomic analysis and breeding. Molecular Breeding, 3(3): 239-245. [DOI:10.1023/A:1009604312050]
23. Ni, J.J., Wu, P., Senadhira, D. and Huang, N. (1998). Mapping QTLs for phosphorus deficiency tolerance in rice. Theoretical and Applied Genetics, 97: 1361-1369. [DOI:10.1007/s001220051030]
24. Qi, P., Lin, Y., Song, X., Shen, J., Huang, W. and Shan, J. (2012). The novel quantitative trait locus GL3. 1 controls rice grain size and yield by regulating Cyclin-T1;3. Cell Research, 22: 1666-1680. [DOI:10.1038/cr.2012.151]
25. Rabiei, B. and Sabouri, H. (2008). Mapping Genes Controlling Quantitative Traits. University of Guilan Press, Guila, IR (In Persian).
26. Rabiei, B., Masaeli, M. and Torang, A.R. (2013). Identification Loci for controlling of seed yield and yield components of rice. Iranian Journal of Crop Science, 44(2): 293-304 (In Persian).
27. Sabouri, H. and Katouzi, M. (2014). Detection of chromosomal regions controlling drought osmotic stress in rice. Journal of Agricultural Biotechnology, 6(2): 91-100 (In Persian).
28. Sabouri, H., Katouzi, M. and Khataminejad, R. (2011). Role of 1 and 6 chromosomes in genetic control of farm traits in rice. Modern science of Sustainable Agriculture, 7(3): 29-35 (In Persian).
29. Sabouri, H., Sabouri, A. and Khataminejad, R. (2012). QTL locating of some traits related to drought tolerance in rice. Production and Processing of Agricultural and Horticultural Products, 2(4): 1-11 (In Persian).
30. Saghai Maroof, M.A., Biyashev, R.M., Yang, G.P., Zhang, Q. and Allard, R.W. (1994). Extraordinarily polymorphic microsatellites DNA in barely species diversity, chromosomal location, and population dynamics. Proceeding of National Academy Science USA, 91: 5466-5570. [DOI:10.1073/pnas.91.12.5466]
31. Sheykhpour Ahandani, M., Rabiee, B. and Shirzadian Khoramabad, R. (2013). Identification of QTLs linked to plant height and maturity time in rice. Iranian Journal of Crop Sciences, 15(2): 107-120 (In Persian).
32. Shomura, A., Izawa, T., Ebana, K., Ebitani, T., Kanegae, H. and Konishi, S. (2008). Deletion in a gene associated with grain size increased yields during rice domestication. Nature Genetics, 40: 1023-1028. [DOI:10.1038/ng.169]
33. Song, X.J., Huang, W., Shi, M., Zhu, M.Z. and Lin, H.X. (2007). A QTL for rice grain width and weight encodes a previously unknown RING-type E3 ubiquitin ligase. Nature Genetics, 39: 623-630. [DOI:10.1038/ng2014]
34. Thomson, M.J., Tai, T.H., McClung, A.M., Lai, X.H., Hinga, M.E., Lobos, K.B., Xu, Y., Martinez, C.P. and McCouch, S.R. (2003). Mapping quantitative trait loci for yield, yield components and morphological traits in an advanced backcross population between Oryza rufipogon and the Oryza sativa cultivar Jefferson. Theoretical and Applied Genetics, 107: 479-493. [DOI:10.1007/s00122-003-1270-8]
35. Tian, R., Jiang, G.H., Shen, L.H., Wang, L.Q. and He, Y.Q. (2005). Mapping quantitative trait loci underlying the cooking and eating quality of rice using a DH population. Molecular Breeding, 15: 117-124. [DOI:10.1007/s11032-004-3270-z]
36. Wang, E., Wang, J., Zhu, X., Hao, W., Wang, L. and Li, Q. (2008). Control of rice grain-filling and yield by a gene with a potential signature of domestication. Nature Genetics, 40: 1370-1374. [DOI:10.1038/ng.220]
37. Wang, S., Wu, K., Yuan, Q., Liu, X., Liu, Z. and Lin, X. (2012). Control of grain size, shape and quality by OsSPL16 in rice. Nature Genetics, 44: 950-954. [DOI:10.1038/ng.2327]
38. Xing, Y. and Zhang, Q. (2010). Genetic and molecular bases of rice yield. Annual Review Plant Biology, 61: 421-442. [DOI:10.1146/annurev-arplant-042809-112209]
39. Xu, F., Sun, X., Chen, Y., Huang, Y., Tong, C. and Bao, J. (2015). Rapid identification of major QTLs associated with rice grain weight and their utilization. PLoS ONE, 10(3): e0122206. [DOI:10.1371/journal.pone.0122206]
ارسال پیام به نویسنده مسئول

ارسال نظر درباره این مقاله
نام کاربری یا پست الکترونیک شما:

CAPTCHA



XML   English Abstract   Print


Download citation:
BibTeX | RIS | EndNote | Medlars | ProCite | Reference Manager | RefWorks
Send citation to:

Jafarzadeh Razmi M R, Navabpour S, Sabouri H, Ramezanpour S S. qGW, a Stable and Major QTL for Increasing of Grain Weight in Rice (Oryza sativa L.). pgr. 2020; 6 (2) :173-182
URL: http://pgr.lu.ac.ir/article-1-138-fa.html

جعفرزاده رزمی محمدرضا، نواب پور سعید، صبوری حسین، رمضان‌پور سیده ساناز. qGW، یک QTL پایدار و بزرگ اثر برای افزایش وزن دانه برنج (Oryza sativa L). پژوهش های ژنتیک گیاهی. 1398; 6 (2) :182-173

URL: http://pgr.lu.ac.ir/article-1-138-fa.html



بازنشر اطلاعات
Creative Commons License این مقاله تحت شرایط Creative Commons Attribution-NonCommercial 4.0 International License قابل بازنشر است.
دوره 6، شماره 2 - ( 1398 ) برگشت به فهرست نسخه ها
پژوهش های ژنتیک گیاهی Plant Genetic Researches
Persian site map - English site map - Created in 0.17 seconds with 30 queries by YEKTAWEB 4419