[صفحه اصلی ]   [Archive] [ English ]  
:: صفحه اصلي :: درباره نشريه :: آخرين شماره :: تمام شماره‌ها :: جستجو :: ثبت نام :: ارسال مقاله :: تماس با ما ::
:: دوره 5، شماره 1 - ( 1397 ) ::
جلد 5 شماره 1 صفحات 54-39 برگشت به فهرست نسخه ها
شناسایی آلل‌های حاوی اطلاعات در کنترل صفات برنج تحت شرایط غرقاب و تنش خشکی‌‌
حال بی بی بایردست، سید یحیی صالحی لیسار، حسین صبوری*، علی موافقی، ابراهیم غلامعلی‌پور علمداری
چکیده:   (11616 مشاهده)
تعیین ‌رابطه ‌بین ‌ژنوتیپ‌ ‌و ‌فنوتیب ‌یکی ‌از ‌اهداف ‌اصلی ‌پروژه‌های ‌به‌نژادی ‌است. ‌امروزه ‌نشانگرهای ‌مولکولی ‌ابزارهای ‌قدرتمندی ‌برای ‌ارزیابی ‌این ‌ارتباط ‌در ‌اختیار ‌به‌نژادگران ‌قرار ‌می‌دهند. ‌در ‌این ‌بررسی ‌تنوع ‌ژنتیکی 112 ‌لاین ‌برنج ‌با ‌استفاده ‌از 20 ‌جفت ‌نشانگر ‌ریزماهواره ‌پیوسته ‌با ‌آلل‌های ‌تحمل ‌به ‌خشکی ‌مورد ‌بررسی ‌قرار ‌گرفت ‌که ‌درمجموع 77 ‌آلل ‌چند ‌شکل ‌با ‌میانگین 3.85 ‌آلل ‌به ‌ازای ‌هر ‌جفت ‌آغازگر ‌تکثیر ‌شد. ‌کم‌ترین ‌تعداد ‌آلل ‌مربوط ‌به ‌نشانگرهای ‌RM28199 ‌و ‌RM212 ‌با ‌2 ‌آلل ‌و ‌بیشترین ‌آن ‌مربوط ‌به ‌نشانگر ‌RM72 ‌با ‌6 ‌آلل ‌بود. ‌میزان ‌اطلاعات ‌چندشکلی ‌برای ‌نشانگرهای ‌مورد ‌بررسی ‌بین ‌0.30 تا 0.72 ‌با ‌میانگین ‌0.58 ‌بود ‌که ‌بیشترین ‌مقدار ‌مربوط ‌به ‌نشانگر ‌RM85 ‌و ‌RM20A ‌و ‌کم‌ترین ‌آن ‌مربوط ‌به ‌نشانگر ‌RM28099 ‌بود. ‌از ‌نظر ‌تنوع ‌ژنی، ‌نشانگرهای ‌RM28099 ‌و ‌RM85 ‌به ‌ترتیب ‌کم‌ترین ‌(0.33) ‌و ‌بیشترین ‌(0.76) ‌تنوع ‌را ‌داشتند. ‌نتایج ‌تجزیه ‌رگرسیون ‌گام‌به‌گام ‌داده‌های ‌ریز‌ماهواره ‌و ‌صفات ‌مورفولوژیک ‌در ‌شرایط ‌غرقاب ‌62 ‌آلل ‌و ‌در ‌شرایط ‌تنش ‌خشکی ‌54 ‌آلل ‌آگاهی‌بخش ‌را ‌برای ‌صفات ‌ارزیابی‌شده، ‌شناسایی ‌نمود. ‌تجزیه ‌خوشه‌ای ‌بر ‌اساس ‌داده‌های ‌مولکولی ‌ژنوتیپ‌ها ‌را ‌به ‌7 ‌گروه ‌تقسیم ‌نمود. ‌با ‌توجه ‌به ‌توزیع ‌مناسب ‌DNA ‌تکثیرشده ‌توسط ‌نشانگرهای ‌مورد ‌بررسی ‌در ‌این ‌تحقیق، ‌از ‌نشانگرهایی ‌که ‌قدرت ‌تفکیک ‌و ‌پیوستگی ‌بالایی ‌با ‌صفات ‌مهم ‌زراعی ‌در ‌شرایط ‌تنش ‌خشکی ‌دارند ‌(و ‌درصورتی‌که ‌در ‌آزمایش‌های ‌بعدی ‌به ‌تأیید ‌برسند)، ‌می‌توان ‌در ‌برنامه‌های ‌به‌نژادی ‌تنش ‌خشکی ‌استفاده ‌نمود. 
 
واژه‌های کلیدی: برنج، تجزیه خوشه‌ای، تنش خشکی، تنوع ژنتیکی، نشانگر‌ ریزماهواره
متن کامل [PDF 1173 kb]   (786 دریافت)    
نوع مطالعه: پژوهشي | موضوع مقاله: ژنتیک گیاهی
دریافت: 1398/1/11 | پذیرش: 1398/1/11
فهرست منابع
1. Aalami, A. and Karami, K. (2016). The study of genetic diversity in iranian rice cultivars using ISSR, IRAP and REMAP markers. Journal of Crop Breeding, 20: 41-51 (In Persian).
2. Amini Nasab, R., Ebrahimi M.A., Ebadi, A.A. and Ghodsi, M. (2012). Study of genetic variation in Iranian rice (Oryza sativa L.) varieties by using molecular markers linked with drought resistance genes. Crop Biotechnology, 2: 15-2 (In Persian).
3. Amiri, P., Ismaili, A. and Hadian, J. (2017). Evaluation of Genetic Diversity of Styrian Pumpkin (Cucurbita pepo var. styriaca) Populations, Using ISSR Molecular Markers. Plant Genetic Researches, 4: 17-28 (In Persian). [DOI:10.29252/pgr.4.2.17]
4. Anandan, A., Anumalla, M., Pradhan, Sh.K. and Ali, J. (2016). Population structure, diversity and trait association analysis in rice (Oryza sativa L.) germplasm for early seedling vigor (ESV) using trait linked SSR markers. PLOS ONE, DOI:10.1371/journal.pone.0152406. [DOI:10.1371/journal.pone.0152406]
5. Awasthi, S. and Lal, J.P. (2014). Marker assisted selection for the improvement of Sarjoo-52 for drought tolerance by introgression of MQTL1.1 from the source Nagina-22. Journal of Plant Molecular Breeding, 2: 43-55.
6. Azizi, H., Aalami, A., Esfahani, M. and Ebadi, A.K. (2017). Association and structure analysis of some of rice (Oryza sativa L.) genetic resources based on microsatellite markers. Cereal Research, 7: 1-16 (In Persian).
7. Fazeli, F. and Cheghamirza, K. (2011). Investigation of genetic diversity in iranian landrace chickpea bulks using ISSR marker. Seed and Plant Improvement Journal, 6: 97-104 (In Persian).
8. Jahani, M., Nematzadeh, G.H. and Mohammadi-Nejad, G.H. (2016). Genetic diversity analysis in a global panel of rice genotypes by microsatellites. Journal of Agricultural Biotechnology, 8: 20-32 (In Persian).
9. Jedari Kouhi, B., Garoosi, G.H. and Hosseini, R. (2011). Investigation on genetic variation in seedless grapevine cultivars, using RAPD molecular marker. Cell & Tissue Journal, 2: 99-106 (In Persian).
10. Haussmann, B.I., Parzies, H.K., Presterl, T., Susic, Z. and Miedaner, T. (2004). Plant genetic resources in crop improvement. Plant Genetic Resources, 2: 3-21. [DOI:10.1079/PGR200430]
11. Honarvar, F., Saoburi, H. and Dadras, A.M. (2016). Study of genetic diversity of rice genotypes by SSR markers and association analysis for related traits to cold tolerance. Journal of Agricultural Biotechnology, 8: 166-173 (In Persian). [DOI:10.18869/acadpub.jcb.8.17.173]
12. Gharekhani, M., Navabpour, S., Sabouri, H. and Ramezanpour, S.S. (2016). Study of genetic variation in Iranin rice (Oryza sativa L.) using SSR Markers. Journal of Agricultural Biotechnology, 8: 107-115 (In Persian).
13. Ghiasy, M., Farahbakhsh, H., Sabouri, H. and Mohamadi Nejad, G.H. (2013). Evaluation of rice cultivars in drought and normal conditions based on sensitive and tolerance indices. Electronic Journal of Crop Production, 6: 55-75 (In Persian).
14. Masoudi, M., Sabouri, H., Taliey, F. and Jafarby, J.A. (2017). Genetic diversity and association analysis for morphophenolgic traits and resistance to Powdery mildew using ISSR, IRAP and iPBS markers. Crop Biotechnology, 18: 41-56 (In Persian).
15. Matus, I.A. and Hayes, P.M. (2002). Genetic diversity in three groups of barley germplasm assessed by simple sequence repeats. Genome, 45: 1095-1106. [DOI:10.1139/g02-071]
16. Miah, G., Rafii, M.Y., Ismailm M.R., Puteh, A.B., Rahim, H.A., Nurul Islam, Kh. and Abdul Latif, M. (2013). A review of microsatellite markers and their applications in rice breeding programs to improve blast disease resistance. International Journal of Molecular Sciences, 14: 22499-22528. [DOI:10.3390/ijms141122499]
17. Mishra, K.K., Vikram, P., Yadaw, R.B., Swamy, B.M., Dixit, SH., Cruz, M.T.S., Maturan, P., Marker, S.H. and Kumar, A. (2013). qDTY12.1: a locus with a consistent effect on grain yield under drought in rice. BMC Genetics, 14: 1-10. [DOI:10.1186/1471-2156-14-12]
18. Mohammadi, S.A. and Prasanna, B.M. (2003). Analysis of genetic diversity in crop plant- salient statistical tools and consideration. Crop Science, 43: 1235-1248. [DOI:10.2135/cropsci2003.1235]
19. Nikzade Talebi, S., Aalami, A., Esfahani, M. and Ebadi, A.A. (2016). Evaluation of allic frequency and association analysis of microsatellite markers with some traits related to pre-harvest sprouting in rice (Oryza sativa L.) cultivars. Iranian Journal of Crop Sciences, 18: 49-62 (In Persian).
20. Park, G.H, Kim, J.H. and Kim, K.M. (2014). QTL analysis of yield components in rice using acheongcheong/nagdong doubled haploid genetic map. American Journal of Plant Sciences, 5: 1174-1180. [DOI:10.4236/ajps.2014.59130]
21. Raiesi, T. and Sabouri, A. (2015). Validation and association analysis of microsatellite markers related to drought and salinity tolerance in aerobic and Iranian rice under osmotic stress. Crop Biotechnology 10: 57-72 (In Persian).
22. Ranjbar, M., Naghavi, M.R., Zali, A., Aghaei, M.J. and Mardi, M. (2009). Identification of informative markers of SSR in Aegilops crassa accessions of Iran. Journal of Agriculture, 11: 48-57 (In Persian).
23. Ribeiro-Carvalho, C., Guedes-Pinto, P., Igrejas, G., Stephenson, P., Schwaraacher, T. and Heslop-Harrison, J.S. (2004). High levels of genetic diversity throughout the range of the Portuguese wheat landrace 'Barbela. Annals of Botany, 94: 699-705. [DOI:10.1093/aob/mch194]
24. Roldan-Ruiz, F.A., Gilliland, T.J., Dubreuil, P., Dillmann, C. and Lallemand, J. (2001). A comparative study of molecular and morphological methods of describing relationships between perennial ryegrass (Lolium perenne L.) varieties. Theoretical and Applied Genetics, 103: 1138-1150. [DOI:10.1007/s001220100571]
25. Saghai Mroof, M.A., Biyashev, R.M., Yang, G.P., Zhang, Q. and Allard, R.W. (1994). Extraordinarily polymorphic DNA in barely species diversity, chromosomal location, and population dynamics, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America, 91: 5466-5570.‌ [DOI:10.1073/pnas.91.12.5466]
26. Salehi Lisar, S.Y. and Bakhshayeshan Agdam, H. (2016). Drought Stress in Plants: Causes, Consequences, and Tolerance. Springer, Cham, CH. [DOI:10.1007/978-3-319-28899-4_1]
27. Shayan, S., Moghaddam Vahed, M., Norouzi, M., Mohammadi, S.A., Toorchi, M. and Molaei, B. (2017). Inheritance of Agronomical and Physiological Traits in the Progeny of Moghan3 and Arg Bread Wheat Varieties Cross. Plant Genetic Researches, 4: 43-60 (In Persian). [DOI:10.29252/pgr.4.2.43]
28. Switzer, R.C., Merril, C.R. and Shifrin, S. (1979). A highly sensitive silver stain for detecting proteins and peptides in polyacrylamide gel. Analytical Biochemistry, 98: 231-237. [DOI:10.1016/0003-2697(79)90732-2]
29. Tavala, R., Aalami, A., Sabouri, H. and Sabouri, A. (2015). Evaluation of haplotype and allelic diversity of SSR markers linked to major effect QTL on chromosome 9 controlling drought tolerance in rice. Cereal Research, 5: 107-119 (In Persian).
30. Valizadeh Soumeh, Z., Samizadeh Lahiji, H. and Rabiei, B. (2014). Assessment of morphologic and genetic diversity of rice varieties using SSR markers associated with drought tolerance characteristics. Cereal Research, 4: 89-101 (In Persian).
31. Vikram, P., Swamy, B.P.M., Dixit, S.H., Trinidad, J., Cruz, M.T.S., Maturan, P.C., Amante, M. and Kumar, A. (2016). Linkages and Interactions Analysis of Major Effect Drought Grain Yield QTLs in Rice. PLOS ONE, DOI:10.1371/journal.pone.0151532. [DOI:10.1371/journal.pone.0151532]
32. Vikram, P., Swamy, B.M., Dixit, S.H., Ahmed, H.U., Cruz, M.T.S., Singh, A.K. and Kumar, A. (2011). qDTY1.1, a major QTL for rice grain yield under reproductive-stage drought stress with aconsistent effect in multiple elite genetic backgrounds. BMC Genetics, 12: 1-15. [DOI:10.1186/1471-2156-12-89]
33. Yashitol, T.M., Sandarm, R., biradar, S. and Thirumuragau, K. (2004). Sequence specific PCR marker for disting uishing rmice line at the basis of wild abortive cytoplasm for their congatc maintir lin. Crop Science, 44: 920-924. [DOI:10.2135/cropsci2004.9200]
34. Zali, H., Hasanloo, T., Sofalian, O., Asghari, A. and Zeinalabedini, M. (2016). Drought stress effect on physiological parameter and amino acids accumulations in canola. Journal of Crop Breeding, 8: 191-203 (In Persian). [DOI:10.29252/jcb.8.18.191]
ارسال پیام به نویسنده مسئول

ارسال نظر درباره این مقاله
نام کاربری یا پست الکترونیک شما:

CAPTCHA



XML   English Abstract   Print


Download citation:
BibTeX | RIS | EndNote | Medlars | ProCite | Reference Manager | RefWorks
Send citation to:

Badirdast H, Salehi-Lisar S Y, Sabouri H, Movafeghi A, Gholamalalipour Alamdari E. Identification of Informative Alleles Controlling Rice Traits under Flooding and Drought Stress Conditions‌‌. pgr. 2018; 5 (1) :39-54
URL: http://pgr.lu.ac.ir/article-1-121-fa.html

بایردست حال بی بی، صالحی لیسار سید یحیی، صبوری حسین، موافقی علی، غلامعلی‌پور علمداری ابراهیم. شناسایی آلل‌های حاوی اطلاعات در کنترل صفات برنج تحت شرایط غرقاب و تنش خشکی‌‌. پژوهش های ژنتیک گیاهی. 1397; 5 (1) :54-39

URL: http://pgr.lu.ac.ir/article-1-121-fa.html



بازنشر اطلاعات
Creative Commons License این مقاله تحت شرایط Creative Commons Attribution-NonCommercial 4.0 International License قابل بازنشر است.
دوره 5، شماره 1 - ( 1397 ) برگشت به فهرست نسخه ها
پژوهش های ژنتیک گیاهی Plant Genetic Researches
Persian site map - English site map - Created in 0.14 seconds with 30 queries by YEKTAWEB 4419