نظر به اینکه کشور ایران در جنوب شرق هلال حاصلخیزی قرار گرفته و به‌عنوان یکی از نخستین مراکز اصلی احتمالی تنوع و اهلی سازی جو زارعی در دنیا می‌باشد، لذا داشتن اطلاعات کافی از وضعیت تنوع ژنتیکی این گونه در کشور از اهمیت بالایی برخوردار است. به‌منظور ارزیابی ساختار و تنوع ژنتیکی جمعیت­های Hordeum vulgare L. کاشته شده در ایران، 14 نمونه جمعیتی شامل هفت نمونه جمعیتی از جو زراعی دو‌ردیفه و هفت نمونه جمعیتی جو زراعی شش‌ردیفه از مناطق مختلف کشور و یک نمونه رقم تجاری ‘Morex’ با استفاده از 20 جفت نشانگر ریزماهوارک (SSRs) مورد بررسی مولکولی قرار گرفت. داده‌های ریزماهوارک­ها با استفاده از نرم‌افزار PowerMarker ver. 3.25 مورد آنالیز قرار گرفتند. نتایج حاصل نشان­دهنده وجود تنوع بالای ژنتیکی در نمونه­های بررسی شده بود (متوسط محتوای اطلاعات چندشکلی = 670/0 و متوسط تعداد آلل = 65/6). وجود تنوع آللی بیشتر جو دو‌ردیفه نسبت به جو شش‌ردیفه، احتمالاً به‌دلیل این است که بیشتر ارقام اصلاح‌شده جو زراعی در ایران جو شش‌ردیفه است. نتایج این تحقیق بیانگر تنوع بین جمعیتی بالاست که دلیل اصلی آن می­تواند درون­زادگیر بودن این تاکسون باشد.