fa
jalali
1393
2
1
gregorian
2014
5
1
1
1
online
1
fulltext
fa
شناسایی نواحی ژنومی کنترل کننده غلظت و محتوای آهن در بخش هوایی جو با استفاده از جمعیت لاینهای هاپلوئید مضاعف جو(Sahara3771 × Clipper)
Identification of Genomic Oregions Controlling Iron Concentration and Content in Shoot of Barley in A × B Doubled Hoploid Mapping Population
آهن یکی از عناصر ضروری و کم مصرف برای اکثر گیاهان میباشد که نقش مهمی در تثبیت ازت و فعالیت برخی از آنزیم-ها مانند کاتالاز، پراکسیداز و سیتوکروم اکسیداز دارد. بهمنظور مکانیابی QTLهای مرتبط با میزان و غلظت آهن در قسمت هوایی جو طی مراحل پنج برگی و رسیدگی کامل، 148 لاین هاپلوئید مضاعف حاصل از تلاقی ارقام Sahara3771 و Clipper در شرایط گلخانهای ارزیابی و صفات غلظت و محتوای آهن در مراحل پنج برگی و رسیدگی کامل اندازهگیری شد. برای تجزیه QTL از نقشه پیوستگی مشتمل بر 26 نشانگر رتروترانسپوزونی IRAP و REMAP، 246 نشانگر SSR و EST-SSR، 238 نشانگر RFLP و یک نشانگر مورفولوژیک استفاده شد. از نظر کلیه صفات، تفاوت معنیدار بین لاینها مشاهده گردید و وجود تفکیک متجاوز برای تمامی صفات نشاندهنده وجود ترکیبات آللی والدینی تکمیلکننده در نتاج بود. در مجموع، 511 نشانگر در هفت گروه پیوستگی 09/1099 سانتیمورگان از ژنوم جو را با متوسط فاصله بین دو نشانگر مجاور برابر 37/2 سانتیمورگان پوشش دادند. برای غلظت آهن هشت و چهار، محتوای آهن تک بوته شش و سه QTL بهترتیب در مراحل پنج برگی و رسیدگی کامل شناسایی شدند. اثر افزایشی منفی اغلب QTLهای شناسایی شده برای غلظت و محتوای آهن تک بوته نشاندهنده نقش آللهای والد Sahara3771 در افزایش تجمع آهن در نتاج بود. یک ناحیه ژنومی مشترک برای QTLهای صفات غلظت و محتوای آهن تک بوته در مرحله رسیدگی کامل شناسایی گردید که ممکن است ناشی از پیوسته بودن QTLها یا اثر پلیوتروپیک آنها باشد.
Iron is one of the essential micronutrient, which has an important role in nitrogen fixation and activity of some enzymes such as catalase, peroxidase and cytochrome oxidase. To map QTLs related to accumulation of iron in shoot of barley at five leaves and maturity stages, 148 doubled haploid lines derived from a cross between Clipper and Sahara3771 varieties were evaluated under greenhouse condition and single plant iron concentration and content were measured. For QTL analysis by linkage map including, 26 retrotransposone markers IRAP and REMAP, 246 SSR and EST-SSR, 238 RFLP and one morphological markers was used. Analysis of variance revealed significant difference between lines for all the studies traits and presence of trangreesive segregation for all the traits and indicated presence of desirable parental allele combinations in the progenies. In total, 511 markers in 7 linkage covered 1099.09 cM of barley genome with an average distance of 2.37 cM between two adjacent markers. For single plant iron concentration, eight and four, iron content in single plant, six and three QTLs were identified at vegetative and maturity stages, respectively. Negative additive effects of the most QTLs indicate the role of Sahara3771 alleles in increased iron accumulation in offspring. One common genomics regions was detected for QTLs of single plant iron concentration and content at maturity which could be due to linkage between the QTLs or the pleiotropic effect of a single QTL.
Barley, Doubled haploid lines, Gene linkage, Iron accumulation, Pleiotropic effect
اثر پلیوتروپیک, تجمع آهن, جو, لاینهای هاپلوئید مضاعف, پیوستگی ژنی
1
12
http://pgr.lu.ac.ir/browse.php?a_code=A-10-25-1&slc_lang=fa&sid=1
2014/07/13
1393/4/22
2014/07/13
1393/4/22
Shiva
Gheitaran Poorsahrigh
Former M.Sc. Student, Department of Plant Breeding and Biotechnology, Faculty of Agriculture, Tabriz University, Tabriz, Iran
شیوا
قیطران پورسهریق
003194753284600683
003194753284600683
No
دانشگاه تبریز
Seyed
Abolghasem Mohammadi
Professor, Department of Plant Breeding and Biotechnology, Faculty of Agriculture, Tabriz University, Tabriz, Iran
سید ابوالقاسم
محمدی
mohammadi@tabrizu.ac.ir
003194753284600684
003194753284600684
Yes
دانشگاه تبریز
Behzad
Sadeghzadeh
- Assistant Professor, Dry land Agricultural Research Institute, Maragheh, Iran
بهزاد
صادق زاده
003194753284600685
003194753284600685
No
مؤسسه تحقیقات دیم کشور
fa
بررسی ساختار تنوع ژنتیکی جمعیتهای گندم نیای وحشی Aegilops cylindrica با استفاده از لوکوسهای بین ریزماهواره ژنومی
Genetic Diversity Structure of Aegilops cylindrica Accessions Revealed by Genomic ISSR Markers
به منظور بررسی تنوع ژنتیکی 35 جمعیت Aegilops cylindrica با استفاده از 17 آغازگر ISSR، در مجموع 190 آلل تکثیر شدند که از این تعداد، 188 آلل (95/98 درصد)، بهعنوان آلل چندشکل تشخیص داده شدند. تعداد آللهای تکثیر شده از 6 تا 20 با میانگین 18/11 آلل متغیر بود. محتوای اطلاعات چندشکلی از 10/0 در آغازگر UBC841 تا 35/0 برای آغازگر UBC836 متفاوت بود. همچنین شاخص نشانگر از 6/0 برای آغازگر UBC841 تا 6 برای آغازگر 15 متفاوت بود. روشهای گروهبندی خوشهای و تجزیه به مختصات اصلی نتوانست جمعیتها را بهطور کامل از هم تفکیک کند و عدم ارتباط بین تنوع مولکولی و تنوع جغرافیایی را نشان داد که نشاندهنده تنوع ژنتیکی بالای این جمعیتها میباشد. در مجموع جمعیتهای غرب و جنوب غرب کشور، تنوع بیشتری نسبت به جمعیتهای شمال و شمال غرب کشور نشان دادند، بنابراین مرکز تنوع و پیدایش گونه Ae. cylindrica احتمالاً غرب و جنوب غرب کشور بوده و از این مناطق به سمت شمال کشور انتقال یافتهاند. نتایج این تحقیق نشان داد که نشانگرهای ISSR ابزار مفیدی برای مدیریت منابع ژنتیکی خویشاوندان وحشی گندم میباشد.
Genetic diversity among 35 accessions of Ae. cylindrica using 17 ISSR primers were investigated. Totally, 190 alleles were amplified and 188 alleles (98.95%) o were polymorphic. Number of Amplified alleles ranged from 6 to 20 with average 11.18 alleles for each primer. Polymorphic information content (PIC) varied from 0.10 (primer UBC841) to 0.35 (primer UBC836). Marker index criterion ranged from 0.6 (primer UBC841) to 6 (primer 15). Cluster and Principal Coordinate Analysis could not completely separate accessions and showed no association between molecular diversity and geographic diversity of genotypes, indicating that there is high genetic diversity among accessions. West and south-west genotypes showed more diversity than genotypes from north and north-west of the country. Therefore, the center of diversity and origin of Aegilops cylindrica might be the western and south-western regions of country and this species might transferred from these regions to the northern parts of the country. Results of this study showed that ISSR markers are useful tools for management of genetic resources of wheat and their wild relative species.
Aegilops cylindrica, Cluster analysis, Genetic diversity, ISSR marker, Principal coordinate analysis
Aegilops cylindrica, تجزیه به مختصات اصلی, تجزیه خوشهای, تنوع ژنتیکی, نشانگر ISSR
13
26
http://pgr.lu.ac.ir/browse.php?a_code=A-10-25-2&slc_lang=fa&sid=1
2014/07/132014/07/13
1393/4/22
2014/07/132014/07/13
1393/4/22
Samira
Mohammadi
Former M.Sc. Student, Department of Agronomy and Plant Breeding, Faculty of Agriculture, Ilam University, Ilam
سمیرا
محمدی
003194753284600686
003194753284600686
No
دانشگاه ایلام
Ali
Ashraf Mehrabi
Assistant Professor, Department of Agronomy and Plant Breeding, Faculty of Agriculture, Ilam University, Ilam
علی
اشرف مهرابی
a.mehrabi@mail.ilam.ac.ir
003194753284600687
003194753284600687
Yes
دانشگاه ایلام
Ali
Arminian
Assistant Professor, Department of Agronomy and Plant Breeding, Faculty of Agriculture, Ilam University, Ilam
علی
آرمینیان
003194753284600688
003194753284600688
No
دانشگاه ایلام
Arash
Fazeli
Assistant Professor, Department of Agronomy and Plant Breeding, Faculty of Agriculture, Ilam University, Ilam
آرش
فاضلی
003194753284600689
003194753284600689
No
دانشگاه ایلام
fa
همسانهسازی، انتقال و بیان دائم فیوژن ژنهای اینترفرون گامای انسانی و bar در گیاه توتون
Cloning, Transformation and Stable Expression of a Fusion of Human Interferon Gamma and bar Genes in Tobacco Plant (Nicotiana tobaccum cv. xanthi)
تولید پروتئین اینترفرون گامای انسانی در سیستمهای بیانی یوکاریوتی، بهعنوان یک پروتئین نوترکیب درمانی، در مطالعات پزشکی اهمیت بسیاری دارد. ویژگیهای اینترفرون گاما، آن را به یک فاکتور ضد سرطانی مناسب تبدیل کرده است. فسفینوتریسین (PPT) مهارکننده گلوتامین سینتاز است و از گروه علفکشهای غیرانتخابی بیالافوس میباشد. ژن bar کد کننده آنزیم فسفینوتریسین استیل ترانسفراز (PAT) است. این آنزیم باعث ایجاد مقاومت به علفکش فسفینوتریسین میشود و میتواند بهعنوان یک نشانگر انتخابی در گیاهان استفاده شود. در این پژوهش، ژن اینترفرون گامای انسانی و ژن bar بهصورت فیوژن در ناقل بیانی گیاهی pCAMBIA 1305.1 تحت کنترل پیشبرنده CaMV35S و خاتمه دهنده NoS همسانهسازی شد. صحت همسانهسازی فیوژن IFNγ- Barدر ناقل بیانی حاضر با استفاده از تکنیکهای مختلفColony PCR، هضم آنزیمی و توالییابی تأیید شد. سازهی تهیه شده (pCAMBIA1305.1- IFNγ- Bar) با استفاده از روش انجماد و ذوب به اگروباکتریوم سویهی LBA4404 انتقال داده شد و با استفاده از روش دیسک برگی در ژنوم گیاه توتون ادغام شد. گیاهان تراریخته احتمالی در محیط گزینشگر، حاوی 30 میلیگرم در لیتر هیگرومایسین انتخاب شدند. پس از ریشهدار شدن به خاک انتقال یافتند و حضور فیوژن IFNγ- Barدر ژنوم این گیاهان با استفاده از تکنیک PCR تأیید شد. در آنالیز داتبلات نیز حضور پروتئینIFNγ-bar در گیاهان تراریخت توتون تأیید شد.
The production of human gamma interferon in eukaryote expression systems refers as a therapeutic recombinant protein which has significant impact in medical studies. Unique com position of gamma interferon makes such protein as a suitable tool against cancer. It is documented that phosphinothricin (PPT) classified as non-selective herbicide group of bialaphos acts an inhibitor for glutamine synthetase. The bar gene is encoding the phosphinothricin-N-acetyltransferase (PAT) enzyme. This enzyme capable of boosting resistance against PPT herbicide, thus it can be selected as a selective marker within plant population. Then various colony PCR techniques, enzymatic digestion and sequencing were used to confirm the accuracy of fusion of IFNγ-bar gens within expression transporter. Using freezing and thawing method to transfer the pCAMBIA1305.1- IFNγ-bar construction into strain of LBA4404 of agrobacterium, then disc leaves was used to integrate into the genomic of tobacco plant. The transgenic plants were selected under selector condition which possess 30 mg/l of hygromycin. After the developed roots were transferred into soil, and PCR technique was used to confirm the presence of IFNγ-bar in the genomic of plants. Dot blot analysis was applied to detect IFNγ-bar protein in transgenic of to tobacco plants.
Human interferon gamma, Stable expression, Tobacco plant, bar gene
اینترفرون گامای انسانی, بیان دائم, گیاه توتون, ژن bar
27
36
http://pgr.lu.ac.ir/browse.php?a_code=A-10-25-4&slc_lang=fa&sid=1
2014/07/132014/07/132014/07/20
1393/4/29
2014/07/132014/07/132014/07/20
1393/4/29
Bahareh
Zakerghoran
M.Sc. Student, Department of Agronomy and Plant Breeding, Faculty of Agriculture, Shahid Chamran University, Ahwaz
بهاره
ذاکر قرآن
003194753284600690
003194753284600690
No
دانشگاه شهید چمران اهواز
Hamid
Rajabi Memari
Assistant Professor, Department of Agronomy and Plant Breeding, Faculty of Agriculture, Shahid Chamran University, Ahwaz
حمید
رجبی معماری
003194753284600691
003194753284600691
Yes
دانشگاه شهید چمران اهواز
Daryoosh
Nabati Ahmadi
Assistant Professor, Department of Agronomy and Plant Breeding, Faculty of Agriculture, Shahid Chamran University, Ahwaz
داریوش
نباتی احمدی
003194753284600692
003194753284600692
No
دانشگاه کشاورزی و منابع طبیعی رامین
Marzieh
Siahmard
M.Sc. Student, Department of Agronomy and Plant Breeding, Ramin Agriculture and Natural Resources University, Ahwaz
مرضیه
سیا مرد
003194753284600693
003194753284600693
No
دانشگاه کشاورزی و منابع طبیعی رامین
fa
بررسی ایزوزیمهای استراز و پراکسیداز در جمعیتهای بومی و اصلاح شده یونجه و ارتباط آنها با صفات زراعی و مورفولوژیکی
Investigation of Esterase and Peroxidase Isozymes in Improved and Iranian Landraces of Alfalfa and Their Relationships with Agronomic and Morphological Traits
بهمنظور ارزیابی تنوع ژنتیکی ارقام اصلاح شده و بومی یونجه، 12 رقم یونجه شامل پنج رقم اصلاح شده (کایساری، کدی، رنجر، مسمیر و سی ریور) و هفت رقم بومی (همدانی، قره یونجه، یزدی، تازه کند دیم، شازند، عمو زینالدین و رهنانی) از طریق صفات زراعی و نشانگرهای آنزیمی مورد مطالعه قرار گرفتند. تعداد 35 بذر از هر رقم در گلدانهای مجزا بهصورت طرح کاملاً تصادفی نامتعادل، کشت شدند. تجزیه واریانس صفات مختلف نشان داد که بین ارقام بومی و اصلاح شده یونجه از لحاظ اکثر صفات اختلاف معنیدار وجود ندارد. در مورد آنزیمهای استراز و پراکسیداز، دادهها بر اساس وجود و عدم وجود نوار آنزیمی (1 و 0) در 11 نوار ایزوزیمی پلیمورف مورد تجزیه و تحلیل قرار گرفتند. ارقام بومی و اصلاح شده بهترتیب با میانگین 246/0 ± 48/0 و 193/0 ±519/0 برای شاخص شانون و میانگین 181/0 ± 327/0 و 148/0± 352/0 برای شاخص تنوع ژنتیکی نی، تفاوت چشمگیری نشان ندادند. بررسی رابطهی بین دادههای ایزوزیمی و صفات مورد بررسی نشان داد که بین ایزوزیم 4POX- و عملکرد تک بوته تر و خشک در ارقام اصلاح شده ارتباط معنیدار وجود دارد.
For evaluation of genetic diversity among improved alfalfa varieties and Iranian landraces, 12 populations including five improved varieties (Kaysari, Kadi, Ranger, Mesmir, Seariver) and seven landraces (Gharayonje, Amozeynadin, Rahnani, Tazekand, Shazand, Hamedani, Yazdi) were evaluated using agronomic traits and enzyme markers. Thirty-five individuals of each variety were grown and analyzed in separate pots in a unbalanced completely randomized design (CRD). Analysis of variance for agronomic traits showed significant differences for most of the traits among improved and landrace varieties. For esterase and peroxidase enzymes based on presence or absence of enzyme bands (1, 0) eleven polymprphic isozyme bands were detected. For improved and landrace varieties Shanon index mean was 0.48 ± 0.246 and 0.519 ± 0.193, respectively, furthermore Nei genetic diversity index mean for improved and landraces was 0.327 ± 0.181 and 0.352 ± 0.148 respectively, suggesting no difference between improved and landrace varieties was found. Analysis of relation between isozyme markers and agronomic traits showed that there are significant differences between the presence of POX-4 and wet and dry yield in improved varieties.
Alfalfa, Genetic diversity, Isozyme markers, Polymorphism
یونجه, تنوع ژنتیکی, نشانگرهای ایزوزیمی, چندشکلی
37
50
http://pgr.lu.ac.ir/browse.php?a_code=A-10-25-5&slc_lang=fa&sid=1
2014/07/132014/07/132014/07/202014/07/20
1393/4/29
2014/07/132014/07/132014/07/202014/07/20
1393/4/29
Maryam
Ahmadi
Former M.Sc. Student, Department of Plant Breeding and Biotechnology, Agriculture Faculty, University of Tabriz, Tabriz
مریم
احمدی
003194753284600694
003194753284600694
Yes
دانشگاه تبریز
Mustafa
Valizadeh
Professor, Department of Plant Breeding and Biotechnology, Agriculture Faculty, University of Tabriz, Tabriz
مصطفی
ولیزاده
003194753284600695
003194753284600695
No
دانشگاه تبریز
Mahmoud
Tourchi
Professor, Department of Plant Breeding and Biotechnology, Agriculture Faculty, University of Tabriz, Tabriz
محمود
تورچی
003194753284600696
003194753284600696
No
دانشگاه تبریز
Mohammad
Moghaddam Vahed
Professor, Department of Plant Breeding and Biotechnology, Agriculture Faculty, University of Tabriz, Tabriz
محمد
مقدم واحد
003194753284600697
003194753284600697
No
دانشگاه تبریز
Hossein
Mohammadzadeh Jalaly
Professor, Department of Plant Breeding and Biotechnology, Agriculture Faculty, University of Tabriz, Tabriz
حسین
محمدزاده جلالی
003194753284600698
003194753284600698
No
دانشگاه تبریز
fa
تجزیه مولکولی تنوع و روابط ژنتیکی ژنوتیپهای بومی جو بر اساس نشانگرهای ریزماهواره
Molecular Analysis of Genetic Diversity and Relationships of Barley Landraces Based on Microsatellite Markers
ژنوتیپهای بومی بهدلیل تطابق و سازگاری با شرایط محیطی مختلف، ذخایر ژنتیکی با ارزشی برای افزایش تنوع ژرمپلاسمهای اصلاحی و نیز منابع بالقوه برای ژنهای مقاومت به تنشهای زیستی و غیرزیستی بشمار میروند. در این مطالعه، تنوع و ساختار ژنتیکی 119 ژنوتیپ بومی جو از کشورهای مختلف و 25 رقم تجاری و لاین اصلاحی با استفاده از 45 جفت آغازگر ریزماهواره مورد ارزیابی قرار گرفت. در مجموع 225 آلل با دامنه 2 تا 14 و میانگین 5 آلل به ازای هر جایگاه تکثیر شدند. میزان اطلاعات چندشکلی برای نشانگرها بین 05/0 تا 90/0 با میانگین 51/0 متغیر بود. کمترین و بیشترین فراوانی آلل شایع بهترتیب مربوط به نشانگرهای EBMAC0788 (13/0) و GBM1411 (97/0) بود. تجزیه واریانس مولکولی نشان داد که واریانس درونگروهی (94 درصد) سهم بیشتری در تبیین واریانس مولکولی کل در مقایسه با واریانس بین گروهی داشت. حداکثر و حداقل شاخصهای شانون و تنوع ژنی نی بهترتیب به ژنوتیپهای بومی ایران و مصر تعلق داشت. تجزیه خوشهای با استفاده از الگوریتم Minimum Evolution و ضریب فاصله P-distance ژنوتیپها را به سه گروه منتسب کرد. این گروهبندی تا حدودی با مناطق جغرافیایی ژنوتیپها مطابقت داشت.
Due to their adaptation to different environment conditions, landraces are valuable genetic resurces for incresing diversity of breeding germplasms and are potential resources for biotic and abiotic stress resistant genes. In the present study, genetic diversity and relationships of 119 barely landraces from different countries along with 25 commerical varieties and breeding lines were assessed, using 45 microsatellite primer pairs. In total, 225 alleles range from 2 to 14 and an average of 5 alleles per locus were amplified. Polymorphic information contenet (PIC) varied from 0.05 to 0.90 with a mean of 0.51. The minimum and maximum frequency of common allele belonged to EBMAC0788 (0.13) and GBM1411 (0.97) markers, respectively. Analysis of molecular variance (AMOVA) revealed a higher within group variation (94%) than between group. Maximum and minimum Shannon’s and Nei gene diversity indices were observed in Iranian and Egyptian landraces, respectively. Cluster analysis using Minimum Evolution algorithm and P-distance coefficient assigned the studied genotypes into three groups. This grouping was partly consistent with geographical origins of the genotypes.
Genetic diversity, Germplasms, Barley Landraces, Population structure
تنوع ژنتیکی, ژرمپلاسم, ژنوتیپهای بومی جو, ساختار جمعیت
51
64
http://pgr.lu.ac.ir/browse.php?a_code=A-10-25-6&slc_lang=fa&sid=1
2014/07/132014/07/132014/07/202014/07/202014/07/20
1393/4/29
2014/07/132014/07/132014/07/202014/07/202014/07/20
1393/4/29
Ali
Shuorvazdi
Former M.Sc. Student, Department of Plant Breeding and Biotechnology, University of Tabriz, Tabriz, Iran
علی
شوروزدی
003194753284600699
003194753284600699
No
دانشگاه تبریز
Seyed Abuolghasem
Mohammadi
Professor, Department of Plant Breeding and Biotechnology, University of Tabriz, Tabriz, Iran
سید ابوالقاسم
محمدی
003194753284600700
003194753284600700
Yes
دانشگاه تبریز
Majid
Norozi
Assistant Professor, Department of Plant Breeding and Biotechnology, University of Tabriz, Tabriz, Iran
مجید
نوروزی
003194753284600701
003194753284600701
No
دانشگاه تبریز
Behzad
Sadeghzadeh
Assistant Professor, Dryland Agriculture Research Institute of Iran, Maragheh, Iran
بهزاد
صادق زاده
003194753284600702
003194753284600702
No
مؤسسه تحقیقات دیم کشور
fa
بررسی تنوع کاریوتیپی گونههای جنس Thymus از نقاط مختلف ایران
Investigation of Thymus spp. Karyotypic Diversity in Different Regions of Iran
آویشن (Thymus)، یک گیاه دارویی معطر، گیاهی شناخته شده، چندساله و خشبی از تیره لامیاسه است. جنس Thymus بهدلیل فراوانی بالای هیبریداسیون و اینتروگرسیون بین گونههای همناحیه، از لحاظ ردهبندی بسیار پیچیده است و برخی از گونههای این گیاه دارویی بومی ایران هستند. در مطالعه حاضر، هفت اکوتیپ Thymus جمعآوری شده از نواحی مختلف ایران به همراه گونه زراعی لندن با استفاده از مشخصات کاریوتیپی جهت شناسایی تنوع ژنتیکی در این گیاه دارویی مورد مطالعه قرار گرفتند. تعداد پایه ثانویه در پنج اکوتیپ 15= x و در سه اکوتیپ دیگر 30 =x بود که احتمالاً از یک تعداد پایه اولیه 7 = x نشأت گرفتهاند. سطوح پلوئیدی این اکوتیپها شامل دیپلوئید و تتراپلوئید بود. اکوتیپهای مورد مطالعه Thymus در طبقهبندی Stebbins رده A1 و B1 را اشغال کردند که این مطلب دلالت بر وجود تقارن کاریوتیپی ابتدایی در این اکوتیپها میباشد. میانگین طول کروموزوم از 03/1 تا 52/1 میکرون متغیر بود. تمام کروموزومها از نوع متاسانتریک (m) بودند. همچنین تجزیه خوشهای با استفاده از پارامترهای کروموزومی و بر اساس UPGMA، اکوتیپها را در چهار گروه قرار داد.
Thymus, an aromatic medicinal plant, is a well-known, perennial and woody herb from Lamiaceae family. Thymus is taxonomically a very complex genus with a high frequency of hybridization and introgression among sympatric species, and some species of this herb are endemic to Iran. In the present study, in order to identification genetic variability in this medicinal plant seven Thymus spp. accessions collected from different regions of Iran along with London agricultural species were studied by karyotypic characteristics. The secondary basic numbers in all ecotypes was x = 15 that probably originate from a primary basic number x = 7. The ploidy levels of these ecotypes were diploid and tetraploid. The Thymus ecotypes under study occupied classes 1A and 1B of Stebbins’ karyotype classification, indicating the presence of a primitive symmetrical karyotype in these ecotypes. The mean chromosome length ranged from 1.03 to 1.53 µm. chromosome types were detected as metacentric “m”. Furthermore, the cluster analysis using chromosomal parameters and based on UPGMA assigned the ecotypes into four groups.
Chromosome, Cytogenetic, Genetic diversity, Medicinal plant, Thymus
آویشن, سیتوژنتیک, تنوع ژنتیکی, گیاه دارویی, کروموزوم
65
76
http://pgr.lu.ac.ir/browse.php?a_code=A-10-25-7&slc_lang=fa&sid=1
2014/07/132014/07/132014/07/202014/07/202014/07/202014/07/20
1393/4/29
2014/07/132014/07/132014/07/202014/07/202014/07/202014/07/20
1393/4/29
Valiollah
Yousefi
Former M.Sc. of Plant Breeding, Razi University and Ph.D. Student, Department of Plant Production and Breeding, Faculty of Technology and Engineering, Imam Khomeini International University, Qazvin
ولی اله
یوسفی
003194753284600703
003194753284600703
No
دانشگاه بین المللی امام خمینی (ره)
Abdollah
Najaphy
Assistant Professor, Department of Agronomy and Plant Breeding, Campus of Agriculture and Natural Resources, Razi University, Kermanshah
عبدالله
نجفی
003194753284600704
003194753284600704
No
دانشگاه رازی
Alireza
Zebarjadi
Associate Professor, Department of Agronomy and Plant Breeding, Campus of Agriculture and Natural Resources, Razi University, Kermanshah
علیرضا
زبرجدی
003194753284600705
003194753284600705
Yes
دانشگاه رازی
Hooshmand
Safari
Ph.D. Student, Department of Agronomy and Plant Breeding, Campus of Agriculture and Natural Resources, Razi University, Kermanshah
هوشمند
صفری
003194753284600706
003194753284600706
No
دانشگاه رازی
fa
بیان فاکتورهای اصلی نوترکیب EspA-Intiminاز باکتری E. coli O157:H7 در گیاه تنباکو به منظور تولید واکسن خوراکی
Expression of Recombinant Chimeric EspA-intimin Protein in Nicotiana tobaccum for Oral Vaccine Development
یکی از پاتوژنهای مهم ایجادکننده کولیت هموراژیک و نشانگان همولیتیک اورمیک در انسان باکتری اشرشیاکلی هموراژیک سویه O157H7 میباشد. دامها اصلیترین مخزن این باکتری میباشند. دو فاکتور پروتئینی با اهمیت در کلونیزاسیون باکتری در اپیتلیوم روده EspA و Intimin هستند که باعث ایجاد آسیبهای تخریبی بهواسطه اتصال میگردند. این پروتئینها توسط جزایر بیماریزایی LEE (Locus of Enterocyte Effacement) کد میشوند. EspA بخشی از سیستم ترشحی نوع III می-باشد که موجب انتقال پروتئین Tir به سلول میزبان و ورود آن به غشا سلول میشود. اینتیمین توسط ژن eae کد شده و به Tir متصل میگردد. این تحقیق بر این اساس است که ژن کایمریک و نوترکیب EI شامل EspA و Intimin که بهواسطه یک لینکر به یکدیگر اتصال یافتهاند میتواند بهعنوان کاندیدای ایمنیزایی خوراکی در نظر گرفته شود و موجب کاهش کلونیزاسیون O157:H E. coli در مدل حیوانی گردد. بدین منظور ژن سنتتیک EspA (120) و Intimin (282) که توسط توالی 4(EAAAK) به یکدیگر متصل شده بود ساخته شد. ژن ساختهشده بر اساس کدونهای گیاه توتون بهینهسازی و سپس تحت کنترل پروموتر Camv35s در ناقل بیانی گیاه کلون و پس از آن بهواسطه انتقال توسط آگروباکتریوم به گیاه توتون منتقل گردید. ورود ساختار ژنی نوترکیب در برگهای گیاه توتون توسط آزمون PCR تأیید شد. در مرحله بعد بیان ژن مورد نظر به روش RT-PCR بررسی و تأیید گردید. در نهایت میزان پروتئین EI در برگهای توتون تراریخته توسط روش الیزا تخمین زده شد که برابر با 1/0 درصد از کل پروتئین محلول در برگ گیاه بود.
One of the important pathogens which cause hemorrhagic colitis and hemolytic uremic syndrome in humans is enterohemorrhagic Escherichia coli (EHEC) O157:H7. Cattle are the most important reservoir of this bacterium. EspA and Intimin are two protein factors for bacteria colonization on intestinal epithelium and cause attaching/effacing lesion. The LEE pathogenicity islands code these proteins. EspA is part of type III secretion systems which delivers Tir to the host cell and integrate to membrane. Intimin encoded by eae gene and fused to Tir. In this research we supposed that chimeric recombinant form of EI gene containing EspA and Intimin were fused with a linker as an edible candidate vaccine would reduce colonization of E. coli O157:H7 in animal model. We constructed a synthetic gene EspA (E120) and intimin (Int282) fused by (EAAAK)4 sequence. The synthetic gene (EI) was codon optimized and subcloned into plant expression vector (PBI121) under CaMV35S promoter and then transferred to tobacco plant by agrobacterium mediated protocol. The presence of inserted gene in plant genome was documented by PCR and RT-PCR methods. The amount of EI protein in transgenic tobacco leaves were estimated 0.1% of the total soluble protein (TSP) by ELISA method.
E. coli O157:H7, Edible vaccine, EspA, Intimin, Transgenic plant
EspA-Intimin, گیاه تراریخت, E. coli O157:H7, واکسن خوراکی
77
94
http://pgr.lu.ac.ir/browse.php?a_code=A-10-25-8&slc_lang=fa&sid=1
2014/07/132014/07/132014/07/202014/07/202014/07/202014/07/202014/07/20
1393/4/29
2014/07/132014/07/132014/07/202014/07/202014/07/202014/07/202014/07/20
1393/4/29
Mahdieh
Sahshorpour
Former M.Sc. Student, Department of Plant Biotechnology, National Institute of Genetic Engineering and Biotechnology, Tehran
مهدیه
ساشورپور
003194753284600707
003194753284600707
No
پژوهشگاه ملی مهندسی ژنتیک و زیست فناوری
Jafar
Amani
Assistant Professor, Applied Microbiology Research Center, Baqiyatallah University of Medical Sciences, Tehran
جعفر
امانی
003194753284600708
003194753284600708
No
دانشگاه علوم پزشکی بقیه الله (عج)
Mahyat
Jafari
Former M.Sc. Student, Department of Plant Biotechnology, National Institute of Genetic Engineering and Biotechnology, Tehran
مهیات
جعفری
003194753284600709
003194753284600709
No
پژوهشگاه ملی مهندسی ژنتیک و زیست فناوری
Ali Hatef
Salmanian
Associate Professor, Department of Plant Biotechnology, National Institute of Genetic Engineering and Biotechnology, Tehran
علی هاتف
سلمانیان
003194753284600710
003194753284600710
Yes
پژوهشگاه ملی مهندسی ژنتیک و زیست فناوری