Plant Genetic Researches
پژوهش های ژنتیک گیاهی
pgr
Agriculture
http://pgr.lu.ac.ir
1
admin
2383-1367
2676-7309
10.22034/pgr
14
1206
fa
jalali
1399
12
1
gregorian
2021
3
1
7
2
online
1
fulltext
fa
بررسی تنوع ژنتیکی و تجزیه ساختار ژنوتیپهای مختلف مرکبات با استفاده از آغازگرهای ISSR
Investigation of Genetic Diversity and Structure Analysis of Different Citrus Genotypes Using ISSR Markers
ژنتیک مولکولی
Molecular genetics
پژوهشي
Research
<div style="text-align: justify;"><span style="font-family:IRANsans;"><span style="font-size:12.0pt;">در برنامههای اصلاحی به آگاهی از قرابت و تنوع ژنتیکی موجود در ذخایر ژرمپلاسمی نیاز است. گستردگی کشت و میزان بالای تولید مرکبات بیانگر اهمیت آن در اقتصاد جهانی است. در این تحقیق 110 ژنوتیپ مرکبات با استفاده از 12 آغازگر </span><span dir="LTR"><span style="font-size:10.0pt;">ISSR</span></span><span style="font-size:12.0pt;"> مورد ارزیابی قرار گرفتند. در مجموع 154 نوار چندشکل با میانگین 8/12 آلل امتیازدهی شد. درصد چندشکلی از 57 درصد برای آغازگر </span><span dir="LTR"><span style="font-size:10.0pt;">ISSR1</span></span><span style="font-size:12.0pt;"> تا 82 درصد برای آغازگر </span><span dir="LTR"><span style="font-size:10.0pt;">ISSR9</span></span><span style="font-size:12.0pt;"> متغیر بود. متوسط محتوای اطلاعات چندشکلی (</span><span dir="LTR"><span style="font-size:10.0pt;">PIC</span></span><span style="font-size:12.0pt;">)، میزان متوسط شاخص نشانگر (</span><span dir="LTR"><span style="font-size:10.0pt;">MI</span></span><span style="font-size:12.0pt;">)، شاخص</span> <span style="font-size:12.0pt;">تنوع ژنی (</span><span dir="LTR"><span style="font-size:10.0pt;">Nei</span></span><span style="letter-spacing:-.3pt;"><span style="font-size:12.0pt;">)، شاخص شانون (</span></span><span dir="LTR" style="letter-spacing:-.3pt;"><span style="font-size:10.0pt;">I</span></span><span style="letter-spacing:-.3pt;"><span style="font-size:12.0pt;">) و تعداد آلل مؤثر (</span></span><span dir="LTR" style="letter-spacing:-.3pt;"><span style="font-size:10.0pt;">Ne</span></span><span style="letter-spacing:-.3pt;"><span style="font-size:12.0pt;">) بهترتیب 002/0</span></span><span dir="LTR" style="letter-spacing:-.3pt;"><span style="font-size:10.0pt;"> ± </span></span><span style="letter-spacing:-.3pt;"><span style="font-size:12.0pt;">48/0، 17/1</span></span><span dir="LTR" style="letter-spacing:-.3pt;"><span style="font-size:10.0pt;"> ± </span></span><span style="letter-spacing:-.3pt;"><span style="font-size:12.0pt;">14/6، 11/0</span></span><span dir="LTR" style="letter-spacing:-.3pt;"><span style="font-size:10.0pt;"> ± </span></span><span style="letter-spacing:-.3pt;"><span style="font-size:12.0pt;"> 42/0، 12/0</span></span><span dir="LTR" style="letter-spacing:-.3pt;"><span style="font-size:10.0pt;"> ± </span></span><span style="letter-spacing:-.3pt;"><span style="font-size:12.0pt;">61/0 و 27/0</span></span><span dir="LTR" style="letter-spacing:-.3pt;"><span style="font-size:10.0pt;"> ± </span></span><span style="letter-spacing:-.3pt;"><span style="font-size:12.0pt;"> 78/1 برآورد شد. بر اساس آمارههای تنوع ژنتیکی</span></span><span style="font-size:12.0pt;">، جمعیت مورد مطالعه تنوع ژنتیکی بالایی داشت و چهار آغازگر </span><span dir="LTR"><span style="font-size:10.0pt;">ISSR11</span></span><span style="font-size:12.0pt;">، </span><span dir="LTR"><span style="font-size:10.0pt;">ISSR9</span></span><span style="font-size:12.0pt;">، </span><span dir="LTR"><span style="font-size:10.0pt;">ISSR4</span></span><span style="font-size:12.0pt;"> و </span><span dir="LTR"><span style="font-size:10.0pt;">ISSR5</span></span><span style="font-size:12.0pt;"> از پتانسیل بیشتری جهت تمایز ژنوتیپها برخوردار بودند. تجزیه خوشهای و تجزیه ساختار بهترتیب بر اساس روش اتصال همسایگی (</span><span dir="LTR"><span style="font-size:10.0pt;">NJ</span></span><span style="font-size:12.0pt;">) و روش بیزی ژنوتیپها را به پنج گروه و چهار زیرجمعیت تقسیم کرد. بر مبنای هر دو تجزیه، قرار گرفتن ژنوتیپهای ناشناخته با ارقام شاهد در یک گروه، فرض زمینه ژنتیکی مشترک بین این ژنوتیپها را تقویت نمود. در گروهبندی ژنوتیپها، سه گونه حقیقی پوملو (</span><em><span dir="LTR"><span style="font-size:10.0pt;">C.</span></span></em><span dir="LTR"><span style="font-size:10.0pt;"> <em>maxima</em></span></span><span style="font-size:12.0pt;">)، ماندارین (</span><em><span dir="LTR"><span style="font-size:10.0pt;">C.</span></span></em><span dir="LTR"><span style="font-size:10.0pt;"> <em>reticulate</em></span></span><span style="font-size:12.0pt;">) و سیترون (</span><em><span dir="LTR"><span style="font-size:10.0pt;">C.</span></span></em><span dir="LTR"><span style="font-size:10.0pt;"> <em>medica</em></span></span><span style="font-size:12.0pt;">) در گروههای مجزا قرار گرفتند. بر اساس نتایج، علاوهبر سه گونه حقیقی، حداقل یک گونه یا جنس دیگر از خویشاوندان مرکبات در ریخته ارثی جمعیت مورد مطالعه سهم داشت. در این تحقیق اگرچه هر دو تجزیه مورد استفاده در تکمیل اطلاعات هم کارآمد بودند، امّا با لحاظ نمودن میزان اختلاط ژنتیکی و اطلاعات منشأ ژنوتیپها، شاید بتوان بر اثربخشی بیشتر تجزیه ساختار مبتنی بر مدل در ارزیابی روابط ژنتیکی دست یافت.</span></span></div>
<div style="text-align: justify;">In breeding programs, it is necessary having knowledge of the relatedness and genetic diversity in germplasm pools. The spread of cultivated regions and the high levels of production indicates citrus importance in the global economy. Therefore, 110 citrus genotypes were evaluated using 12 ISSR markers. Overall, 154 polymorphic bands were scored with an average of 12.8 alleles per primer. The polymorphism percentage ranged from 57 for the ISSR1 to 82 for the ISSR9. Averages of polymorphic information content (PIC), marker index (MI), gene diversity index (Nei), Shannon index (I) and number of effective alleles (Ne) were 0.48 ± 0.002, 6.14 ± 1.17, 0.42 ± 0.11, 0.61 ± 0.12 and 1.78 ± 0.27, respectively. Based on genetic diversity statistics, the studied population had high genetic diversity, and four markers (ISSR11, ISSR9, ISSR4, and ISSR5) had more potential for differentiation of genotypes. Cluster analysis and model-based structure analysis, divided the genotypes into five groups and four subpopulations based on the Neighbor-Joining method (NJ) and Bayesian approach, respectively. Based on both analyses, grouping of unknown genotypes and control cultivars in the same group probably confirms the assumption of a common genetic background between these genotypes. Results from the two analyses showed that Pummelo (<em>C. maxima</em>), Mandarin (<em>C. reticulate</em>), and Citron (<em>C. medica</em>), as three true citrus species, separated in different groups. In addition to the three true species, at least one species or another genus of citrus relatives is involved in the genetic makeup of the studied population. In this study, although both used analyses were effective in completing each other's information, by considering the degree of genetic mixing and the information of the origin of the genotypes, the effectiveness of model-based structure analysis in evaluating genetic relationships could be achieved.<br>
<span dir="RTL"></span><span dir="RTL"></span></div>
آغازگر ISSR, تجزیه ساختار جمعیت, مرکبات, روابط فیلوژنی
ISSR markers, Population structure analysis, Citrus, Phylogenetic relationships
13
24
http://pgr.lu.ac.ir/browse.php?a_code=A-10-390-1&slc_lang=fa&sid=1
Abouzar
Abouzari
ابوذر
ابوذری
a.abouzari@areeo.ac.ir
10031947532846002778
10031947532846002778
Yes
Crop and Horticultural Science Research Department, Mazandaran Agricultural Resources Research and Education Center, Agricultural Research, Education and Extension Organization (AREEO), Sari, Iran
بخش تحقیقات علوم زراعی و باغی، مرکز تحقیقات کشاورزی و منابع طبیعی استان مازندران، سازمان تحقیقات، آموزش و ترویج کشاورزی، ساری
Ahmad Reza
Dadras
احمد رضا
دادرس
a.dadras@yahoo.com
10031947532846002779
10031947532846002779
No
Zanjan Agricultural Resources Research and Education Center, Agricultural Research,Education and Extension Organization (AREEO)
سازمان تحقیقات آموزش و ترویج کشاورزی
Behrouz
Golein
بهروز
گلعین
bgoleincitrus@yahoo.com
10031947532846002780
10031947532846002780
No
Agricultural Research,Education and Extension Organization (AREEO)
سازمان تحقیقات آموزش و ترویج کشاورزی
Yahya
Tajvar
یحیی
تاجور
y.tajvar@areeo.ac.ir
10031947532846002781
10031947532846002781
No
Agricultural Research,Education and Extension Organization (AREEO)
سازمان تحقیقات آموزش و ترویج کشاورزی