Plant Genetic Researches
پژوهش های ژنتیک گیاهی
pgr
Agriculture
http://pgr.lu.ac.ir
1
admin
2383-1367
2676-7309
10.22034/pgr
14
1206
fa
jalali
1397
6
1
gregorian
2018
9
1
5
1
online
1
fulltext
fa
مقایسه تنوع DNA کلروپلاستی برخی ژنوتیپهای سیب ایرانی، ارقام تجاری و برخی پایههای متداول
Comparison of Chloroplast DNA Diversity in Some Iranian Apple Genotypes, Commercial Cultivars and Rootstocks
ژنتیک گیاهی
Plant genetics
پژوهشي
Research
<div style="text-align: justify;"><span style="font-size:14px;"><span dir="LTR"><span style="color:black;"><span style="font-family:times new roman,serif;">DNA</span></span></span><span style="color:black;"><span style="font-family:b lotus;"> کلروپلاستی </span></span><span dir="LTR"><span style="color:black;"><span style="font-family:times new roman,serif;">64</span></span></span><span style="color:black;"><span style="font-family:b lotus;"> نمونه سیب (.</span></span><span style="color: rgb(0, 0, 0); font-family: "times new roman", serif; text-align: justify;">spp </span><em><span dir="LTR"><span style="color:black;"><span style="font-family:times new roman,serif;">Malus</span></span></span></em><span style="color:black;"><span style="font-family:b lotus;">) (</span></span><span dir="LTR"><span style="color:black;"><span style="font-family:times new roman,serif;">54</span></span></span><span style="color:black;"><span style="font-family:b lotus;"> ژنوتیپ</span></span><span style="color:black;"><span style="font-family:b lotus;"> بومی ایران، پنج رقم تجاری و پنج پایه) برای مشخص کردن هاپلوتایپهای آنها با کاربرد روش واکنش زنجیرهای پلیمراز-تفاوت طول قطعات حاصل از هضم (</span></span><span dir="LTR"><span style="color:black;"><span style="font-family:times new roman,serif;">PCR-RFLP</span></span></span><span style="color:black;"><span style="font-family:b lotus;">) بررسی شد. تقریبا </span></span><span dir="LTR"><span style="color:black;"><span style="font-family:times new roman,serif;">4320 bp</span></span></span><span style="color:black;"><span style="font-family:b lotus;"> از ژنوم کلروپلاست با کاربرد دو جفت آغازگر عمومی کلروپلاست و دو آنزیم برشی محدودگر (</span></span><em><span dir="LTR"><span style="color:black;"><span style="font-family:times new roman,serif;">Mse</span></span></span></em><span dir="LTR"><span style="color:black;"><span style="font-family:times new roman,serif;">I</span></span></span><span style="color:black;"><span style="font-family:b lotus;"> و </span></span><em><span dir="LTR"><span style="color:black;"><span style="font-family:times new roman,serif;">Ec</span></span></span></em><span dir="LTR"><span style="color:black;"><span style="font-family:times new roman,serif;">oRI</span></span></span><span style="color:black;"><span style="font-family:b lotus;">) بررسی گردید. تمام جهشهای شناسایی شده، حذف-اضافه در محدوده </span></span><span dir="LTR"><span style="color:black;"><span style="font-family:times new roman,serif;">bp</span></span></span> <span dir="LTR"><span style="color:black;"><span style="font-family:times new roman,serif;"> 40</span></span></span><span style="color:black;"><span style="font-family:b lotus;">- </span></span><span dir="LTR"><span style="color:black;"><span style="font-family:times new roman,serif;">10</span></span></span><span style="color:black;"><span style="font-family:b lotus;"> بودند. ترکیب تمام جهشها، شش هاپلوتایپ (</span></span><span dir="LTR"><span style="color:black;"><span style="font-family:times new roman,serif;">H1, H2, H3, H4, H5, H6</span></span></span><span style="color:black;"><span style="font-family:b lotus;">) را در نمونههای مورد بررسی معرفی نمود. مشخص شد که پایه سیب بومی رقم گمی آلماسی هاپلوتایپ اختصاصی خود را دارا بوده و از تمامی نمونههای مورد بررسی منطقه خود (آذربایجان) متفاوت است. اطلاعات تنوع </span></span><span dir="LTR"><span style="color:black;"><span style="font-family:times new roman,serif;">DNA</span></span></span><span style="color:black;"><span style="font-family:b lotus;"> کلروپلاستی میتواند برای مطالعات فیلوژنتیکی در این گیاه به کار رود و چند شکلیهای مشخص شده در ژنوم سیتوپلاسمی با روش </span></span><span dir="LTR"><span style="color:black;"><span style="font-family:times new roman,serif;">PCR-RFLP</span></span></span><span style="color:black;"><span style="font-family:b lotus;"> میتواند به درک وراثت مادری سیب کمک کند.</span></span> </span></div>
<div style="text-align: justify;">The chloroplastic DNA of 64 accessions of apple (<em>Malus</em> spp.) (54 Iranian genotypes, five commercial cultivars and five rootstocks) were analyzed to reveal their haplotypes by using Polymerase Chain Reaction-Restriction Fragment Length Polymorphism (PCR-RFLP) method. Approximately 4320 bp of the chloroplast genome was analyzed, by using two chloroplast universal primer pairs and two restriction enzymes (<em>Ec</em>oRI and <em>Mse</em>I). All the mutations detected were insertion-deletions been in the range between 10-40 bp. The combination of all the mutations resulted to six haplotypes (H1, H2, H3, H4, H5 and H6) in the studied apple accessions. It was defined that the Iranian apple rootstock 'Gami-Almasi' had a specific haplotype form all the other studied accessions. It was approved that cpDNA diversity data can be considered for phylogenetic studies in this plant and the polymorphism determined in cytoplasmic genome by PCR-RFLP method can help to understand the maternal inheritance in apple.</div>
آغازگر عمومی کلروپلاست, آنزیم برشی محدودگر, سیب, هاپلوتایپ, PCR-RFLP
Chloroplast universal primer, Restriction enzyme, Malus Spp, Haplotype, PCR-RFLP
77
86
http://pgr.lu.ac.ir/browse.php?a_code=A-10-145-2&slc_lang=fa&sid=1
Shahin
Jahangirzadeh Khiavi
شاهین
جهانگیرزاده خیاوی
sh.jahangirzadeh@ areeo.ac.ir
10031947532846001229
10031947532846001229
Yes
Tea Research Center, Horticultural Sciences Research Institute, Agricultural Research, Education and Extension Organization (AREEO), Lahijan, Iran
پژوهشکده چای، مؤسسه تحقیقات علوم باغبانی، سازمان تحقیقات، آموزش و ترویج کشاورزی لاهیجان
Zabihollah
Zamani
ذبیح اله
زمانی
10031947532846001230
10031947532846001230
No
Department of Horticulture science, Faculty of Agriculture, University of Tehran
گروه علوم باغبانی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه تهران
Mohamadreza
Fatahi
محمدرضا
فتاحی
10031947532846001231
10031947532846001231
No
Department of Horticulture science, Faculty of Agriculture, University of Tehran
گروه علوم باغبانی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه تهران
Masoumeh
Ashourpour
معصومه
عاشورپور
10031947532846001232
10031947532846001232
No
Organization of Agriculture - Guilan branch
سازمان جهاد کشاورزی گیلان