Plant Genetic Researches
پژوهش های ژنتیک گیاهی
pgr
Agriculture
http://pgr.lu.ac.ir
1
admin
2383-1367
2676-7309
10.22034/pgr
14
1206
fa
jalali
1396
12
1
gregorian
2018
3
1
4
2
online
1
fulltext
fa
بررسی تنوع ژنتیکی جمعیتهای کدوتخمکاغذی (Cucurbita pepo var. styriaca) با استفاده از نشانگرهای مولکولی ISSR
Evaluation of Genetic Diversity of Styrian Pumpkin (Cucurbita pepo var. styriaca) Populations, Using ISSR Molecular Markers
ژنتیک گیاهی
Plant genetics
پژوهشي
Research
<span dir="RTL"><span style="font-family:b lotus;"><span style="font-size:12.0pt;">مطالعه تنوع ژنتیکی در گیاهان دارویی، یکی از اهداف مهم بهنژادی است</span></span></span><span dir="RTL"><span style="font-family:b lotus;"><span style="font-size:12.0pt;">. پیشرفت</span></span></span> <span dir="RTL"><span style="font-family:b lotus;"><span style="font-size:12.0pt;">های</span></span></span> <span dir="RTL"><span style="font-family:b lotus;"><span style="font-size:12.0pt;">اخیر</span></span></span> <span dir="RTL"><span style="font-family:b lotus;"><span style="font-size:12.0pt;">در </span></span></span><span dir="RTL"><span style="font-family:b lotus;"><span style="font-size:12.0pt;">کاربرد</span></span></span> <span dir="RTL"><span style="font-family:b lotus;"><span style="font-size:12.0pt;">واکنش</span></span></span> <span dir="RTL"><span style="font-family:b lotus;"><span style="font-size:12.0pt;">زنجیر­ه­ای</span></span></span> <span dir="RTL"><span style="font-family:b lotus;"><span style="font-size:12.0pt;">پلیمراز،</span></span></span> <span dir="RTL"><span style="font-family:b lotus;"><span style="font-size:12.0pt;">امکان</span></span></span> <span dir="RTL"><span style="font-family:b lotus;"><span style="font-size:12.0pt;">بررسی</span></span></span> <span dir="RTL"><span style="font-family:b lotus;"><span style="font-size:12.0pt;">افراد</span></span></span> <span dir="RTL"><span style="font-family:b lotus;"><span style="font-size:12.0pt;">یک</span></span></span> <span dir="RTL"><span style="font-family:b lotus;"><span style="font-size:12.0pt;">جمعیت را</span></span></span> <span dir="RTL"><span style="font-family:b lotus;"><span style="font-size:12.0pt;">در</span></span></span> <span dir="RTL"><span style="font-family:b lotus;"><span style="font-size:12.0pt;">تعداد</span></span></span> <span dir="RTL"><span style="font-family:b lotus;"><span style="font-size:12.0pt;">مکانهای</span></span></span> <span dir="RTL"><span style="font-family:b lotus;"><span style="font-size:12.0pt;">ژنی</span></span></span> <span dir="RTL"><span style="font-family:b lotus;"><span style="font-size:12.0pt;">بیشتری</span></span></span> <span dir="RTL"><span style="font-family:b lotus;"><span style="font-size:12.0pt;">از</span></span></span> <span dir="RTL"><span style="font-family:b lotus;"><span style="font-size:12.0pt;">ژنوم</span></span></span> <span dir="RTL"><span style="font-family:b lotus;"><span style="font-size:12.0pt;">فراهم ساخته</span></span></span> <span dir="RTL"><span style="font-family:b lotus;"><span style="font-size:12.0pt;">است و از میان نشانگرهای مولکولی </span></span></span><span style="font-family:times new roman,serif;"><span style="font-size:10.0pt;">DNA</span></span><span dir="RTL"><span style="font-family:b lotus;"><span style="font-size:12.0pt;">، نشانگر</span></span></span><span style="font-family:times new roman,serif;"><span style="font-size:10.0pt;">ISSR</span></span> <span dir="RTL"><span style="font-family:b lotus;"><span style="font-size:12.0pt;"> نیز به طور موفقیت آمیزی در مطالعات مختلف تنوع ژنتیکی گیاهان استفاده شده است. در این پژوهش، تنوع ژنتیکی 43 نمونه از 5 جمعیت کدوتخم­کاغذی و 4 نمونه از 1 جمعیت کدوتنبل کشت شده در کلکسیون دانشگاه شهید بهشتی توسط 12 نشانگر </span></span></span> <span style="font-family:times new roman,serif;"><span style="font-size:10.0pt;">ISSR</span></span><span dir="RTL"><span style="font-family:b lotus;"><span style="font-size:12.0pt;">بررسی شد. در مجموع 83 نوار قابل امتیاز­دهی </span></span></span> <span dir="RTL"><span style="font-family:b lotus;"><span style="font-size:12.0pt;">به­دست آمد</span></span></span> <span dir="RTL"><span style="font-family:b lotus;"><span style="font-size:12.0pt;">و میانگین نوارهای تولیدی توسط نشانگرها 91/6 بود و 100 درصد نوار­های قابل امتیاز­دهی چند شکلی نشان دادند. دندروگرام بر اساس ضریب تشابه جاکارد و روش خوشه­بندی </span></span></span><span style="font-family:times new roman,serif;"><span style="font-size:10.0pt;">CLink</span></span><span dir="RTL"><span style="font-family:b lotus;"><span style="font-size:12.0pt;"> (</span></span></span><span style="font-family:times new roman,serif;"><span style="font-size:10.0pt;">Complete Linkage</span></span><span dir="RTL"><span style="font-family:b lotus;"><span style="font-size:12.0pt;">)، ترسیم گردید و پنج گروه اصلی به­دست آمد. نتایج به دست آمده از گروه­بندی با دو روش تجزیه به مختصات اصلی و تجزیه خوشه­ای نشان داد که گروه­بندی ارایه شده توسط دو روش مزبور با یکدیگر مشابه بودند. ضریب کوفنتیک محاسبه و 97/0 به­دست آمد. در مجموع نتایج نشان داد که برخی از نشانگرهای </span></span></span><span style="font-family:times new roman,serif;"><span style="font-size:10.0pt;">ISSR</span></span><span dir="RTL"><span style="font-family:b lotus;"><span style="font-size:12.0pt;"> استفاده شده در این تحقیق، برای مطالعات آینده تنوع ژنتیکی در گونه </span></span></span><em><span style="font-family:times new roman,serif;"><span style="font-size:10.0pt;">Cucurbita pepo </span></span></em><span dir="RTL"><span style="font-family:b lotus;"><span style="font-size:12.0pt;"> مفید است.</span></span></span>
Evaluation of genetic diversity in medicinal plants is one of the most important evolutionary and breeding goals. Recent developments in polymerase chain reaction brings the possibility of evaluation the individuals of a population in more sites of genome, and among different DNA molecular markers, the ISSR marker was successfully used in study of the genetic diversity of different plants. The genetic diversity of 43 individuals from five populations of Styrian Pumpkin (Cucurbita pepo var. styriaca) and 4 individuals from one population of <em>C. maxima</em> which cultivated in Shahid Beheshti University collection (Tehran, Iran) was investigated using 12 ISSR markers. Totally, 83 scorable bands were produced by ISSR markers and the mean for the produced band for each marker was 6.91 and 100% of scorable bands were polymorphic. Dendrogram was illustrated based on Jaccard coefficient similarity matric and algorithm of Complete Linkage. Based on cluster analysis, individuals of populations divided into five main groups. The results of the grouping through principal coordinate analysis and cluster analysis showed that groupings by the two mentioned methods were consonant with each other and have made a similarity grouping<span dir="RTL">.</span> The cophenetic coefficient was calculated as 0.97. Totally, the results of present study showed that the some of used ISSR markers could be useful for future study of genetic variation in <em>Cucurbita pepo</em>.
کدو تخم کاغذی, تجزیه خوشهای, تجزیه به مختصات اصلی, اطلاعات چندشکلی
Cucurbita pepo L., Cluster analysis, Principal coordinate analysis, Polymorphic information
17
28
http://pgr.lu.ac.ir/browse.php?a_code=A-10-25-41&slc_lang=fa&sid=1
پریا
امیری
10031947532846001288
10031947532846001288
No
احمد
اسماعیلی
ismaili.a@lu.ac.ir
10031947532846001289
10031947532846001289
Yes
جواد
هادیان
10031947532846001290
10031947532846001290
No