[صفحه اصلی ]   [Archive] [ English ]  
:: صفحه اصلي :: درباره نشريه :: آخرين شماره :: تمام شماره‌ها :: جستجو :: ثبت نام :: ارسال مقاله :: تماس با ما ::
:: دوره 5، شماره 2 - ( 1397 ) ::
جلد 5 شماره 2 صفحات 54-41 برگشت به فهرست نسخه ها
ارزیابی تنوع ژنتیکی سنجد با استفاده از نشانگرهای مرفولوژیکی و مولکولی AFLP
رویا زیرک، علی سلیمانی*، مهرشاد زین‌العابدینی، حمید حاتمی ملکی، عزیزاله خیری
چکیده:   (10169 مشاهده)
در ‌‌این ‌‌تحقیق ‌‌تنوع ‌‌ژنتیکی ‌‌تعداد ‌‌30 ‌‌ژنوتیپ ‌‌سنجد ‌‌متعلق ‌‌به ‌‌زیستگاه‌‌های ‌‌استان ‌‌آذربایجان ‌‌شرقی ‌‌(مناطق ‌‌تبریز، ‌‌مراغه ‌‌و ‌‌ملکان) ‌‌با ‌‌استفاده ‌‌از ‌‌نشانگرهای ‌‌مرفولوژیکی ‌‌و ‌‌ملکولی ‌‌AFLP ‌‌ارزیابی ‌‌شد. ‌‌نتایج ‌‌آماره‌‌های ‌‌توصیفی ‌‌صفات ‌‌کمی ‌‌و ‌‌کیفی ‌‌بیانگر ‌‌وجود ‌‌تنوع ‌‌در ‌‌ژرم ‌‌پلاسم ‌‌مورد ‌‌ارزیابی ‌‌بود. ‌‌با ‌‌استفاده ‌‌از ‌‌الگوریتم ‌‌UPGMA ‌‌بر ‌‌پایه ‌‌صفات ‌‌کمی ‌‌و ‌‌کیفی، ‌‌ژنوتیپ‌‌ها ‌‌در ‌‌5 ‌‌گروه ‌‌قرار ‌‌گرفتند. ‌‌در ‌‌گروه ‌‌اول ‌‌بیشتر ‌‌ژنوتیپ‌‌های ‌‌منطقه ‌‌مراغه ‌‌و ‌‌در ‌‌گروه ‌‌سوم ‌‌بیشتر ‌‌ژنوتیپ‌‌های ‌‌منطقه ‌‌تبریز ‌‌قرار ‌‌گرفتند. ‌‌از ‌‌تعداد ‌‌14 ‌‌ترکیب ‌‌آغازگر ‌‌EcoRI-MseI ‌‌برای ‌‌انگشت‌‌نگاری ‌‌ژنوتیپ‌‌ها ‌‌استفاده ‌‌شد ‌‌و ‌‌در ‌‌مجموع ‌‌تعداد ‌‌439 ‌‌نوار ‌‌چند ‌‌شکل ‌‌تکثیر ‌‌شد. ‌‌براساس ‌‌معیار ‌‌تشابه ‌‌جاکارد، ‌‌کمترین ‌‌شباهت ‌‌ژنتیکی ‌‌(25‌‌ درصد) ‌‌بین ‌‌‌‌ژنوتیپ‌‌های ‌‌19 ‌‌(منطقه ‌‌ملکان) ‌‌و ‌‌27 ‌‌(منطقه ‌‌مراغه) ‌‌مشاهد ‌‌شد. ‌‌نتایج ‌‌تجزیه ‌‌به ‌‌مختصات ‌‌اصلی ‌‌بیانگر ‌‌پوشش ‌‌ژنومی ‌‌مناسب ‌‌نشانگرهای ‌‌AFLP ‌‌انتخاب ‌‌شده ‌‌در ‌‌این ‌‌مطالعه ‌‌بود. ‌‌بیشترین ‌‌مقدار ‌‌محتوای ‌‌اطلاعات ‌‌چندشکل ‌‌(0.83‌‌ درصد) ‌‌مربوط ‌‌به ‌‌ترکیب ‌‌آغازگری ‌‌MTTT-EGA ‌‌و ‌‌کمترین ‌‌مقدار ‌‌آن ‌‌(0.33‌‌ درصد) ‌‌مربوط ‌‌به ‌‌ترکیب ‌‌آغازگری MGT- ‌‌ETA بود. ‌‌تجزیه ‌‌خوشه‌‌ای ‌‌با ‌‌استفاده ‌‌از ‌‌داده‌های ‌‌ملکولی ‌‌ژنوتیپ‌‌ها ‌‌را ‌‌در ‌‌3 ‌‌گروه ‌‌قرار ‌‌داد. ‌‌بر ‌‌ ‌‌این ‌‌اساس ‌‌توده‌‌هایی ‌‌با ‌‌توزیع ‌‌مناطق ‌‌جغرافیایی ‌‌مشابه ‌‌در ‌‌کنار ‌‌هم ‌‌قرار ‌‌نگرفتند، ‌‌لیکن ‌‌گروه‌بندی ‌‌بر ‌‌اساس ‌‌صفات ‌‌مرفولوژیکی ‌‌کمی ‌‌و ‌‌کیفی ‌‌تا ‌‌حدود ‌‌زیادی ‌‌با ‌‌توزیع ‌‌جغرافیایی ‌‌ژنوتیپ‌‌ها ‌‌همخوانی ‌‌نشان ‌‌داد. ‌‌این ‌‌نتایج ‌‌بر ‌‌اساس ‌‌نظریه ‌‌تکامل ‌‌همگرا ‌‌و ‌‌تا ‌‌حدودی ‌‌بدلیل ‌‌تکثیر ‌‌غیرجنسی ‌‌سنجد ‌‌از ‌‌ژنوتیپ‌‌های ‌‌مادری ‌‌محدود ‌‌و ‌‌توزیع ‌‌آنها ‌‌در ‌‌مناطق ‌‌جغرافیایی ‌‌مورد ‌‌مطالعه، ‌‌قابل ‌‌تفسیر ‌‌می‌‌باشد. 
 
واژه‌های کلیدی: تنوع ژنتیکی، سنجد، صفات کمی، AFLP
متن کامل [PDF 1336 kb]   (922 دریافت)    
نوع مطالعه: پژوهشي | موضوع مقاله: ژنتیک گیاهی
دریافت: 1398/3/6 | پذیرش: 1398/3/6
فهرست منابع
1. Arohonka, T. and Rousi, A. (1980). Karyotypes and C-bands in Shepherdia and Elaeagnus. Annales Botanici Fennici. 17: 258-263.
2. Asadiar, L.S., Rahmani, F. and Siami, A. (2012). Assessment of genetic diversity in the Russian olive (Elaeagnus angustifolia) based on ISSR genetic markers. Revista Ciencia Agronomica, 44: 310-316. [DOI:10.1590/S1806-66902013000200013]
3. Doveri, S., Sabino Gil, F., Diaz, A., Reale, S., Busconi, M., Camara Machado, A., Martin, A., Fogher, C., Donini, P. and Lee, D. (2008). Standardization of a set of microsatellite markers for use in cultivar identification studies in olive (Olea europaea L.). Science Horticulture (Amsterdam), 116: 367-373. [DOI:10.1016/j.scienta.2008.02.005]
4. Elmi, F., Dehghan, G. and Beigzadeh, B. (2016). Qualitative and quantitative changes of essential composition in the flowers of some populations of Elaeagnus angustifolia. Advanced Herbal Medicine, 2(1): 1-6.
5. Fan, Y., Zhang, C., Wu, W., He, W., Zhang, L. and Ma, X. (2017). Analysis of Genetic Diversity and Structure Pattern of Indigofera pseudotinctoria in Karst Habitats of the Wushan Mountains Using AFLP Markers. Molecules, 22: 1734. [DOI:10.3390/molecules22101734]
6. Fufa, H.P., Baenizger, S., Beecher, B.S., Dweikat, I., Graybosch, R.A. and Eskridge, K.M. (2005). Comparison of phenotypic and molecular marker-based classifications of hard red winter wheat cultivars. Euphytica, 145: 133-146. [DOI:10.1007/s10681-005-0626-3]
7. Guo, Y.P., Saukel, J., Mittermayr, R., Ehrendorfer, F. (2005). AFLP analysis demonstrates genetic divergence hybridization, and multiple polyploidizations in the evolution of Achilla (Asteraceae-Anthemideae). New Phytologist, 166: 273-290. [DOI:10.1111/j.1469-8137.2005.01315.x]
8. Kim, W.J., Kim, D.S., Kim, S.H., Kim, J.B., Goh, E.J. and Kang, S.I. (2010). Analysis of genetic similarity detected by AFLP and PCoA among genotypes of kenaf (Hibiscus cannabinus L.). Journal of Crop Science and Biotechnology, 13: 243-249. [DOI:10.1007/s12892-010-0092-x]
9. Pan, C., Zhao, H., Zhao, X. Liu, J., Liu, L., Hou, Y. and Zhang, L. (2011). Pollination ecology and breeding system of Elaeagnus angustifolia. IEEE Conferences. The 2nd international conference on multimedia technology, July 26-28, Hangzhou, CH.
10. Sun, M., Lin, Q. (2010). A revision of Elaeagnus L. (Elaeagnaceae) in mainland China. Journal of Systematics and Evolution, 48: 356-390. [DOI:10.1111/j.1759-6831.2010.00085.x]
11. Taghipour, N. (2013). The study of genetic diversity among Elaegnus angostifolia L. genotypes using morphological and molecular markers (SRAP). MSc. thesis. University of Orumiyeh, Orumiyeh, Iran (In Persian).
12. Talebi-Rad, H., Onsori, H. and Akrami, S. (2015). Genetic diversity among Elaeagnus angustifolia L. population based on some morphological traits and random amplified polymorphic DNA markers. Iranian Journal of Genetics and Plant Breeding, 4: 17-24.
13. Vaishnaw, V., Mohammad, N., Wali, S.A., Kumar, R., Tripathi, S.B., Negi, M.S. and Ansari, S.A. (2018). AFLP markers for analysis of genetic diversity and structure of teak (Tectona grandis L.) in India. Canadian Journal of Forest Research, 45(3): 297-30. [DOI:10.1139/cjfr-2014-0279]
14. Vos, P., Hogers, R., Bleeker, M., Reijans, M., Lee, T.v.d., Hornes, M., Friters, A., Pot, J., Paleman, J. and Kuiper, M. (1995). AFLP: a new technique for DNA fingerprinting. Nucleic Acids Research, 23: 4407-4414. [DOI:10.1093/nar/23.21.4407]
15. Vroh, B.I., Hravetg, L., Chandelier, A., Mergiai, G. and Dujardin, P. (1996). Improved RAPD amplification of recalcitrant plant DNA by use of activated charcoal during DNA extraction. Plant Breeding, 115: 205-206. [DOI:10.1111/j.1439-0523.1996.tb00905.x]
16. Uzun, A., Celik, B., Karadeniz, T., Yilmaz, K.U. and Altintas, G. (2015). Assessment of fruit haracteristics and genetic variation among naturally growing wild fruit Elaeagnus angustifolia accessions. Turkish Journal of Agriculture and Forestry, 39: 286-294. [DOI:10.3906/tar-1408-88]
17. Zhang, C., Sun, M., Zhang, X., Chen, S., Nie, G., Peng, Y. Huang, L. and Ma, X. (2018). AFLP-based genetic diversity of wild orchardgrass germplasm collections from Central Asia and Western China, and the relation to environmental factors. PLoS ONE, | https://doi.org/10.1371/journal.pone.0195273 [DOI:10.1371/ journal. pone.0195273.]
ارسال پیام به نویسنده مسئول

ارسال نظر درباره این مقاله
نام کاربری یا پست الکترونیک شما:

CAPTCHA



XML   English Abstract   Print


Download citation:
BibTeX | RIS | EndNote | Medlars | ProCite | Reference Manager | RefWorks
Send citation to:

Zirak R, Soleimani A, Zeinolabedini M, Hatami Maleki H, Kheiri A. Morphological and AFLP-Based Genetic Diversity Assessment of Elaeagnus angustifolia L.. pgr. 2019; 5 (2) :41-54
URL: http://pgr.lu.ac.ir/article-1-129-fa.html

زیرک رویا، سلیمانی علی، زین‌العابدینی مهرشاد، حاتمی ملکی حمید، خیری عزیزاله. ارزیابی تنوع ژنتیکی سنجد با استفاده از نشانگرهای مرفولوژیکی و مولکولی AFLP. پژوهش های ژنتیک گیاهی. 1397; 5 (2) :54-41

URL: http://pgr.lu.ac.ir/article-1-129-fa.html



بازنشر اطلاعات
Creative Commons License این مقاله تحت شرایط Creative Commons Attribution-NonCommercial 4.0 International License قابل بازنشر است.
دوره 5، شماره 2 - ( 1397 ) برگشت به فهرست نسخه ها
پژوهش های ژنتیک گیاهی Plant Genetic Researches
Persian site map - English site map - Created in 0.15 seconds with 30 queries by YEKTAWEB 4461