[صفحه اصلی ]   [Archive] [ English ]  
:: صفحه اصلي :: درباره نشريه :: آخرين شماره :: تمام شماره‌ها :: جستجو :: ثبت نام :: ارسال مقاله :: تماس با ما ::
:: دوره 5، شماره 2 - ( 1397 ) ::
جلد 5 شماره 2 صفحات 28-17 برگشت به فهرست نسخه ها
بررسی رابطه فیلوژنتیک تعدادی از گونه‌های وحشی بادام ایران بـا بهره‌گیری از تـوالی‌های ناحیه ITS ریبوزمی هسته و trnL کلروپلاستی
سیده زهرا حسینی، بهروز شیران، محمدعلی ابراهیمی*
چکیده:   (9047 مشاهده)

رابطه فیلوژنتیک بین 12 گونه وحشی Prunus، یک رقم زراعی بادام و یک رقم هلو، با استفاده از توالی‌‌های ناحیه ITS1-5.8S rDNA-ITS2 هسته و ناحیه DNA trnL کلروپلاستی و با روش‌‌های حداکثر شباهت و نزدیک‌ترین همسایگی مورد ارزیابی قرار گرفت. نتایج حاصل از داده‌‌های ITS در این پژوهش تنها توانست گونه‌های مورد مطالعه Prunus را به دو گروه تقسیم کند اما در تفکیک بخش‌ها از یکدیگر کارایی لازم را نداشت. گونه P. tenella نسبت به سایر گونه‌‌های مورد مطالعه، در فاصلۀ ژنتیکی دورتری قرار گرفت و به نظر می‌رسد این گونه به Amygdalus تعلق ندارد. همچنین با استفاده از داده‌‌های ITS می‌توان گزارش نمود، Prunus مونوفیلتیک می‌‌باشد. فواصل ژنتیکی برای هرجفت از گونه‌‌ها مشخص شد و میانگین فاصلۀ ژنتیکی در بین گونه‌‌ها تنها کمترین فاصلۀ ژنتیکی را در داخل جنس نشان می‌‌دهد. بر اساس نتایج این تحقیق می‌‌توان Prunus را بصورت تک جنس گزارش نمود و با توجه به شباهت بسیار زیاد ناحیۀ trnL در گونه‌‌های وحشی بادام، احتمالاً جد مادری Prunus یکی بوده و trnL نشانگر خوبی برای جداسازی گونه‌‌های موجود در بادام نیست.

واژه‌های کلیدی: فیلوژنی، ITS1-5.8S rDNA-ITS2، Prunus species، trnL کلروپلاستی
متن کامل [PDF 865 kb]   (879 دریافت)    
نوع مطالعه: پژوهشي | موضوع مقاله: ژنتیک گیاهی
دریافت: 1398/2/23 | پذیرش: 1398/2/23
فهرست منابع
1. Baldwin, B.G. (1993). Molecular phylogenetic of Calycadenia (Compositae) based on ITS sequences of nuclear ribosomal DNA: chromosomal and morphological evolution reexamined. American Journal of Botany, 80: 222-238. [DOI:10.1002/j.1537-2197.1993.tb13792.x]
2. Baldwin, B.G., Sanderson, G.M.J., Porter, J.M., Wojciehowski, M.E., Campbell, C.S. and Donoghue, M.J. (1995). The ITS region of nuclear ribosomal DNA: a valuable source of evidence on angiosperm phylogeny. Annals of the Missouri Botanical Garden, 82: 247-277. [DOI:10.2307/2399880]
3. Bortiri, E., Oh, S.H., Jiang, J., Baggett, S., Granger, A., Weeks, C., Buckingham, M., Potter, D. and Parfitt, D.E. (2001). Phylogeny and systematics of Prunus (Rosaceae) as determined by sequence analysis of ITS and the chloroplast trnL-trnF spacer DNA. Systematic Botany, 26: 797-807.
4. Bortiri, E., Vanden, H. and Potter, D. (2006). Phylogeny and systematics of Prunus (Rosaceae) as determined by sequence analysis of ITS and the chloroplast trnL-trnF spacer DNA. Systematic Botany, 26: 797-807.
5. Bouhadida, M., Martin, J.P., Eremin, G., Pinochet, J., Moreno, M.A. and Gogorcena, Y. (2007). Chloroplast DNA diversity in Prunus and its implication on genetic relationships. Journal of the American Society for Horticultural Science, 132(5): 670-679. [DOI:10.21273/JASHS.132.5.670]
6. Browicz, K. (1969). Amygdalus. In: Rechinger, K.H. (ed.), Flora Iranica: Rosaceae, Akademische Druck und Verlagsanstalt, Graz. 166-187.
7. Gilani, S.A., Qureshi, R.A., Khan, A.M. and Potter, D. (2010). A molecular phylogeny of selected species of genus Prunus L. (Rosaceae) from Pakistan using the internal transcribed spacer (ITS) spacer DNA. African Journal of Biotechnology, 9(31): 4867-4872.
8. Kester, D.E. and Assay, R. (1975). Almond", In: Advance in fruit breeding (ed. Janick J. and J. N. moore), Purdu Univ. Press West Lafayette, Indiana, 387-419.
9. Kester, D.E., Gradziel, T.M. and Grassely, C. (1991). Almonds (Prunus), In: M. Moore and J.R. Ballington. Jr. (eds). Genetic resources of temperate fruit and nut crops. International Journal of Horticultural Science and Technology, 701-758. [DOI:10.17660/ActaHortic.1991.290.16]
10. Khanuja, S.P.S., Shasany, A.K., Darokar, M.P. and Kumar, S. (1999). Rapid Isolation of DNA from Dry and Fresh Samples of Plant Producing Large Amounts of Secondary Metabolites and Essential oils. Kluwer Academic Publishers, The Netherlands.
11. Khatamsaz, M. (1992). Flora of Iran. No. 6: Rosaceae, Research Institute of Forest and rangelands.
12. Lee, S. and Wen, J. (2001). A phylogenetic analysis of Prunus and the Amygdaloideae (Rosaceae) using ITS sequences of nuclear ribosomal DNA. American Journal of Botany, 88: 150-160. [DOI:10.2307/2657135]
13. Martınez-Gomez, P., Arulsekar S., Potter D. and Gradziel, T.M. (2003). An extended inter-specific gene pool available to peach and almond breeding :as char:acterized using simple sequence repeat (SSR) markers. Euphytica, 131: 313-322.
14. Potter, D., Gao, E., Oh, S.H. and Baggett, S. (1999). Molecular phylogenetic studies in Rosaceae. P. 39. in International Botanical Congress-Abstracts.
15. Potter, D., Lubyand, J.J. and Harrison, R.E. (2000). Phylogenetic relationships among species of ragaria (Rosaceae) inferred from non-coding nuclear and chloroplast DNA sequences. Systematic Botany, 25: 337-348. [DOI:10.2307/2666646]
16. Rahemi, A., Fatahi, R., Ebadi, A., Taghavi, T., Hassani, D., Gradziel, T., Folta, K. and Chaparro, J. (2012). Genetic diversity of some wild almonds and related Prunus species revealed by SSR and EST-SSR molecular markers. Plant Systematic and Evolution, 298: 173-192. [DOI:10.1007/s00606-011-0536-x]
17. Socias i Company, R. (1998). La taxonomie de l'amandier. Cahiers Options Mediterr, 33: 91-93.
18. Sorkheh, K, Shiran, B., Gradziel, T.M., Epperson, B.K., Martinez-Gomez, P. and Asadi, E. (2007). Amplified fragment length polymorphism as a tool for molecular characterization of almond germplasm: genetic diversity among cultivated genotypes and related wild species of almond, and its relationships with agronomic traits. Euphytica, 156: 327-344. [DOI:10.1007/s10681-007-9382-x]
19. Taberlet, P., Gielly, L., Pautou, G. and Bouvet, J. (1991). Universal primers for amplification of three non-coding regions of chloroplast DNA. Plant Molecular Biology, 17(5): 1105-1109. [DOI:10.1007/BF00037152]
20. Vadafar, M., Attar, F. and Maroofi, H. (2010). Trichome micromorphology in drupe of Amygdalus L. (Rosaceae) from Iran. Acta Botanica Croatica, 69(1): 93-105.
21. Vadafar, M., Kazempour, S.H. and Attar, F. (2014). Molecular phylogeny of the genus Amygdalus (Rosaceae) based on nrDNA ITS and cpDNA trnS-trnG sequences. Turkish Journal of Botany, 38: 439-452. [DOI:10.3906/bot-1303-46]
22. Wen, J., Berggren, S.T., Lee, C.H., Ickert-Bond, S., Yi, T.S., Yoo, K.O., Xie, J., Shaw, D. and Potter, D. (2008). Phylogenetic inferences in Prunus (Rosaceae) using chloroplast ndhF and nuclear ribosomal ITS sequences. Journal of Systematics and Evolution, 46(3): 322-332.
23. Yazbek, M. And Oh S.H. (2013). Peaches and almonds: phylogeny of Prunus subg. Amygdalus Rosaceae) based on DNA sequence and morphology. Plant Systematics and Evolution, 299: 1403-1418. [DOI:10.1007/s00606-013-0802-1]
24. Murray, M.G. and Thompson, W.F. (1980). Rapid isolation of high molecular weight plant DNA. Nucleic Acids Research, 8(19): 4321-4325. [DOI:10.1093/nar/8.19.4321]
ارسال پیام به نویسنده مسئول

ارسال نظر درباره این مقاله
نام کاربری یا پست الکترونیک شما:

CAPTCHA



XML   English Abstract   Print


Download citation:
BibTeX | RIS | EndNote | Medlars | ProCite | Reference Manager | RefWorks
Send citation to:

Hosseini S Z, Shiran B, Ebrahimi M A. Study on Phylogenetic Relationship among some of Iranian Wild Almond Species using Sequences of ITS1-5.8S rDNA-ITS2 Region and Chloroplastic trnL. pgr. 2019; 5 (2) :17-28
URL: http://pgr.lu.ac.ir/article-1-127-fa.html

حسینی سیده زهرا، شیران بهروز، ابراهیمی محمدعلی. بررسی رابطه فیلوژنتیک تعدادی از گونه‌های وحشی بادام ایران بـا بهره‌گیری از تـوالی‌های ناحیه ITS ریبوزمی هسته و trnL کلروپلاستی. پژوهش های ژنتیک گیاهی. 1397; 5 (2) :28-17

URL: http://pgr.lu.ac.ir/article-1-127-fa.html



بازنشر اطلاعات
Creative Commons License این مقاله تحت شرایط Creative Commons Attribution-NonCommercial 4.0 International License قابل بازنشر است.
دوره 5، شماره 2 - ( 1397 ) برگشت به فهرست نسخه ها
پژوهش های ژنتیک گیاهی Plant Genetic Researches
Persian site map - English site map - Created in 0.14 seconds with 30 queries by YEKTAWEB 4447