[صفحه اصلی ]   [Archive] [ English ]  
:: صفحه اصلي :: درباره نشريه :: آخرين شماره :: تمام شماره‌ها :: جستجو :: ثبت نام :: ارسال مقاله :: تماس با ما ::
بخش‌های اصلی
صفحه اصلی::
اطلاعات نشریه::
آرشیو مجله و مقالات::
برای نویسندگان::
برای داوران::
ثبت نام و اشتراک::
تماس با ما::
تسهیلات پایگاه::
بایگانی مقالات زیر چاپ::
فهرست داوران همکار::
::
جستجو در پایگاه

جستجوی پیشرفته
..
دریافت اطلاعات پایگاه
نشانی پست الکترونیک خود را برای دریافت اطلاعات و اخبار پایگاه، در کادر زیر وارد کنید.
..
ISSN
شاپای آنلاین: ISSN 2676-7309
شاپای چاپی: ISSN 2383-1367
..




 
..
:: دوره 5، شماره 1 - ( 1397 ) ::
جلد 5 شماره 1 صفحات 86-77 برگشت به فهرست نسخه ها
مقایسه تنوع DNA کلروپلاستی برخی ژنوتیپ‌های سیب ایرانی، ارقام تجاری و برخی پایه‌های متداول
شاهین جهانگیرزاده خیاوی* ، ذبیح اله زمانی ، محمدرضا فتاحی ، معصومه عاشورپور
پژوهشکده چای، مؤسسه تحقیقات علوم باغبانی، سازمان تحقیقات، آموزش و ترویج کشاورزی لاهیجان ، sh.jahangirzadeh@ areeo.ac.ir
چکیده:   (12354 مشاهده)
DNA کلروپلاستی 64 نمونه سیب (.spp Malus) (54 ژنوتیپ بومی ایران، پنج رقم تجاری و پنج پایه) برای مشخص کردن هاپلوتایپ‌های آنها با کاربرد روش واکنش زنجیره‌ای پلی‌مراز-تفاوت طول قطعات حاصل از هضم (PCR-RFLP) بررسی شد. تقریبا 4320 bp از ژنوم کلروپلاست با کاربرد دو جفت آغازگر عمومی کلروپلاست و دو آنزیم برشی محدودگر (MseI و EcoRI) بررسی گردید. تمام جهش‌های شناسایی شده، حذف-اضافه در محدوده bp  40- 10 بودند. ترکیب تمام جهش‌ها، شش هاپلوتایپ (H1, H2, H3, H4, H5, H6) را در نمونه‌های مورد بررسی معرفی نمود. مشخص شد که پایه سیب بومی رقم گمی آلماسی هاپلوتایپ اختصاصی خود را دارا بوده و از تمامی نمونه‌های مورد بررسی منطقه خود (آذربایجان) متفاوت است. اطلاعات تنوع DNA کلروپلاستی می‌تواند برای مطالعات فیلوژنتیکی در این گیاه به کار رود و چند شکلی‌های مشخص شده در ژنوم سیتوپلاسمی با روش PCR-RFLP می‌تواند به درک وراثت مادری سیب کمک کند. 
واژه‌های کلیدی: آغازگر عمومی کلروپلاست، آنزیم برشی محدودگر، سیب، هاپلوتایپ، PCR-RFLP
متن کامل [PDF 565 kb]   (1339 دریافت)    
نوع مطالعه: پژوهشي | موضوع مقاله: ژنتیک گیاهی
پذیرش: 1398/1/11
فهرست منابع
1. Bagheri, A., Kochaki, A. and Zand, A. (1996). Plant Breeding in Sustainable Agriculture. Mashhad University Jihad publications. Mashhad, IR (In Persian).
2. Bouhadida, M., Martín. J.P., Eremin, G., Pinochet, J., Moreno, M.Á. and Gogorcena, Y. (2007). Chloroplast DNA diversity in Prunus and its implication on genetic relationships. Journal of the American Society for Horticultural Science, 132(5): 670-679. [DOI:10.21273/JASHS.132.5.670]
3. Coart, E., Van Glabeke, S., De loose, M., Larsen, A.S. and Roldan-ruiz, I. (2006). Chloroplast diversity in the genus Malus: New insights into the relationship between the European wild apples (Malus sylvestris (L.) Mill.) and the domesticated apple (Malus domesticaBorkh.). Molecular Ecology, 15: 2171-2182. [DOI:10.1111/j.1365-294X.2006.02924.x]
4. Cros, J., Combes, M.C., Trouslot, P., Anthony, F., Hamon, S., Charrier, A. and Lashermes, P. (1998). Phylogenetic analysis of chloroplast DNA variation in CoffeaL. Molecular Phylogenetics and Evolution, 9(1): 109-117. [DOI:10.1006/mpev.1997.0453]
5. Curtis, S.E. and Clegg, M.T. (1984). Molecular evolution of chloroplast DNA sequences. Molecular Biology and Evolution, 1: 291-301.
6. Demesure, B., Sodzi, N. and Petit, R.J. (1995). A set of universal primers for amplification of polymorphic non-coding regions of mitochondrial and chloroplast DNA in plants. Molecular Ecology, 4: 129-131. [DOI:10.1111/j.1365-294X.1995.tb00201.x]
7. Dumolin-Lapegue, S., Pemonge, M.H. and Petit, R.J. (1997). An enlarged set of consensus primers for the study of organelle DNA in plants. Molecular Ecology, 6: 393-397. [DOI:10.1046/j.1365-294X.1997.00193.x]
8. Fujii, N., Tomaru, N., Okuyama, K., Koike, T., Mikami, T., and Ueda, K. (2002). Chloroplast DNA phylogeography of Faguscreneta (Fagaceae) in Japan. Plant Systematics Evolution, 232(1-2): 21-33. [DOI:10.1007/s006060200024]
9. Gielly, L. and Taberlet, P. (1994). The use of chloroplast DNA to resolve plant phylogenies. Non-coding vs. Rbcl sequences. Molecular Biology and Evolution, 11: 769-777.
10. Grivet, D., Heinze, B., Vendraminà, G.G. and Petit, R.J. (2001). Genome walking with consensus primers: Application to the large single copy region of chloroplast DNA. Molecular Ecology Notes, 1: 345-349. [DOI:10.1046/j.1471-8278.2001.00107.x]
11. Heuertz, M., Fineschi, S., Anzidei, M., Pastorelli, R., Salvini, D., Paule, L., Frascaria-Lacoste, N., Hardy, O.J., Vekemans, X. and Vendramin, G.G. (2004). Chloroplast DNA variation and postglacial recolonization of common ash (Fraxinus excelsior L.) in Europe. Molecular Ecology, 13: 3437-3452. [DOI:10.1111/j.1365-294X.2004.02333.x]
12. Ishikawa, S., Kato, S., Imakawa, S., Mikami, T. and Shimamoto, Y. (1992). Organel DNA polymorphism in apple cultivars and rootstocks. Theoretical and Applied Genetics, 83: 963-967. [DOI:10.1007/BF00232957]
13. Jahangirzadeh Khiavi, Sh., Zamani, Z., Mardi, M. and Fatahi Moghdam, M. (2013). Evaluation of Chloroplast relationship between some apple genotype from Azerbaijan of Iran and their comparison with other local genotypes, cultivars and rootstocks. African Journal of Agricultural Research, 8(1): 106-112.
14. Katayama, H. and Uematsu, C. (2005). Structural analysis of chloroplast DNA in Prunus (Rosaceae): Evolution, genetic diversity and unequal mutations. Theoretical and Applied Genetics, 111:1430-1439. [DOI:10.1007/s00122-005-0075-3]
15. Kato, S., Ishikawa, S., Imakawa, S., Komori, S., Mikami, T. and Shimamoto, Y. (1993). Mitochondrial DNA restriction fragment length polymorphisms in Malus species. Plant Breeding, 111: 162- 165. [DOI:10.1111/j.1439-0523.1993.tb00623.x]
16. Kucuk, O., Gulbitti-Onarici, S. and Sumer, S. (2006). RFLP of analyses of an intergenic spacer region of chloroplast DNA in some wild wheat species. African Journal of Biotechnology, 5(22): 2058-2061.
17. Manie, A. (2001). Apple and its Culture. Technical Publications Companies in Iran. Tehran, IR (In Persian).
18. Matsumoto, S., Wakita, H. and Soejima, J. (1997). Chloroplast DNA probes as an aid in the molecular classification of Malus species. Scientia Horticulturae, 70: 81-86. [DOI:10.1016/S0304-4238(97)00061-7]
19. Mohanty, A., Martín, J.P. and Aguinagalde, I. (2001). Chloroplast DNA study in wild populations and some cultivars of Prunusavium L. Theoretical and Applied Genetics, 103: 112-117. [DOI:10.1007/s001220000532]
20. Palmer, J.D. (1987). Chloroplast DNA evolution and biosystematic uses of chloroplast DNA variation. American Society of Naturalists, 130: S6-S29. [DOI:10.1086/284689]
21. Panda, S., Pedro Martin, J. and Aguinaglde, I. (2003). Chloroplast DNA study in sweet cherry cultivars (Prunusavium L.) using PCR-RFLP method. Genetic Resources and Crop Evolution, 50: 489-495. [DOI:10.1023/A:1023986416037]
22. Salehi Shanjani, P. (2004). Chloroplast DNA phylogeography of Fagus orrientalisLipsky in Iran. Journal of Iran Biology, 17(2): 117-126 (In Persian).
23. Taberlet, P., Gielly, L., Pautou, G. and Bouvet, J. (1991). Universal primers for amplification of three non-coding regions of chloroplast DNA. Plant Molecular Biology, 17: 1105-1109. [DOI:10.1007/BF00037152]
24. Turkec, A., Sayar, M. and Heinze, B. (2006). Identification of sweet cherry cultivars (Prunusavium L.) and analysis of their genetic relationships by chloroplast sequence-characterised amplified regions (cpSCAR). Genetic Resources and Crop Evolution, 53: 1635-1641. [DOI:10.1007/s10722-005-2285-6]
25. Widmer, A. and Baltisberger, M. (1999). Extensive intraspecific chloroplast DNA (cpDNA) variation in the alpine Drabaaizoides L. (Brassicaceae): Haplotype relationships and population structure. Molecular Ecology, 8: 1405-1415. [DOI:10.1046/j.1365-294x.1999.00700.x]
26. Zeinalabedini, M., Mahjourhat, K., Khayam-Nekoui, M., Grigorian, V., Toorchi, M., Dicenta, F. and Martinez-Gomez, P. (2007). Molecular characterization of almond cultivars and related wild species using nuclear and chloroplast DNA markers. Journal of Food, Agriculture & Environment, 5(3&4): 242-247.
ارسال پیام به نویسنده مسئول

ارسال نظر درباره این مقاله
نام کاربری یا پست الکترونیک شما:

CAPTCHA



XML   English Abstract   Print


Download citation:
BibTeX | RIS | EndNote | Medlars | ProCite | Reference Manager | RefWorks
Send citation to:

Jahangirzadeh Khiavi S, Zamani Z, Fatahi M, Ashourpour M. Comparison of Chloroplast DNA Diversity in Some Iranian Apple Genotypes, Commercial Cultivars and Rootstocks. pgr 2018; 5 (1) :77-86
URL: http://pgr.lu.ac.ir/article-1-124-fa.html

جهانگیرزاده خیاوی شاهین، زمانی ذبیح اله، فتاحی محمدرضا، عاشورپور معصومه. مقایسه تنوع DNA کلروپلاستی برخی ژنوتیپ‌های سیب ایرانی، ارقام تجاری و برخی پایه‌های متداول. پژوهش های ژنتیک گیاهی. 1397; 5 (1) :77-86

URL: http://pgr.lu.ac.ir/article-1-124-fa.html



بازنشر اطلاعات
Creative Commons License این مقاله تحت شرایط Creative Commons Attribution-NonCommercial 4.0 International License قابل بازنشر است.
دوره 5، شماره 1 - ( 1397 ) برگشت به فهرست نسخه ها
پژوهش های ژنتیک گیاهی Plant Genetic Researches
Persian site map - English site map - Created in 0.07 seconds with 41 queries by YEKTAWEB 4642