[صفحه اصلی ]   [Archive] [ English ]  
:: صفحه اصلي :: درباره نشريه :: آخرين شماره :: تمام شماره‌ها :: جستجو :: ثبت نام :: ارسال مقاله :: تماس با ما ::
بخش‌های اصلی
صفحه اصلی::
اطلاعات نشریه::
آرشیو مجله و مقالات::
برای نویسندگان::
برای داوران::
ثبت نام و اشتراک::
تماس با ما::
تسهیلات پایگاه::
بایگانی مقالات زیر چاپ::
فهرست داوران همکار::
::
جستجو در پایگاه

جستجوی پیشرفته
..
دریافت اطلاعات پایگاه
نشانی پست الکترونیک خود را برای دریافت اطلاعات و اخبار پایگاه، در کادر زیر وارد کنید.
..
ISSN
شاپای آنلاین: ISSN 2676-7309
شاپای چاپی: ISSN 2383-1367
..




 
..
:: دوره 6، شماره 1 - ( 1398 ) ::
جلد 6 شماره 1 صفحات 98-87 برگشت به فهرست نسخه ها
بررسی تنوع ژنتیکی جمعیت‌های بابونه آلمانی کشت شده در ایران با استفاده از نشانگر SCoT
لیلی طحانی ، مهرآنا کوهی دهکردی* ، حمید دهقان زاده
دانشکده علوم کشاورزی، دانشگاه پیام نور، تهران ، m.kouhi@pnu.ac.ir
چکیده:   (13781 مشاهده)
بابونه آلمانی با نام علمی (chamomilla Matricaria) گیاهی علفی، یکساله از تیره کاسنی است. بابونه از دیرباز عمدتا به منظور استفاده از اسانس و عصاره آن در صنایع دارویی ،آرایشی و بهداشتی، عطرسازی و چاشنی های غذایی به عنوان ستاره ای در میان گیاهان دارویی مطرح بوده است. مطالعه حاضر با هدف بررسی تنوع ژنتیکی در نه جمعیت بابونه آلمانی با استفاده از نشانگر ملکولی SCoT انجام شد. ده آغازگر SCoT مورد استفاده قرار گرفت، آغازگرها نوارهای چندشکل با الگوی نواری واضح ایجاد کردند. در مجموع 141 نوار ایجاد شد که از این بین 140 نوار (5/96 درصد) چندشکلی نشان دادند. تجزیه خوشه‌ای با استفاده از الگوریتم UPGMA و بر اساس ضریب تشابه جاکارد انجام شد، نتایج حاصل از تجزیه خوشه‌ای و تجزیه به مولفه‌های اصلی توانست نمونه‌های جمعیتی بابونه را به چهار گروه تقسیم نماید. نتایج حاصل از تجزیه واریانس مولکولی (AMOVA) نشان داد میزان تنوع بین گروهی بیشتر از تنوع درون گروهی است به طوری که 55 درصد تنوع مربوط به تنوع بین گروه‌ها بود. نتایج این پژوهش نشان داد نشانگرهای SCoT در تعیین میزان تنوع ژنتیکی و روابط خویشاوندی نمونه‌های جمعیتی مورد مطالعه بابونه از کارایی بالایی برخوردار هستند.
واژه‌های کلیدی: قرابت ژنتیکی، چندشکلی، نشانگر مولکولی، تجزیه خوشه‌ای
متن کامل [PDF 1134 kb]   (1818 دریافت)    
نوع مطالعه: پژوهشي | موضوع مقاله: ژنتیک گیاهی
فهرست منابع
1. Ahmadi, H. (2013). Genetic diversity of german chamomile (Matricaria chamomilla) using ISSR and morphological markers. M.Sc. Thesis, Isfahan University of Technology, Isfahan, Iran (In Persian).
2. Amirmoradi, B., Talebi, R. and Karami, E. (2012). Comparison of genetic variation and differentiation among annual Cicer species using start codon targeted (SCoT) polymorphism, DAMD-PCR, and ISSR markers. Plant Systematics and Evolution, 298: 1679-1688 (In Persian). [DOI:10.1007/s00606-012-0669-6]
3. Belokurova, V.B. (2010). Methods of biotechnology in system of efforts aimed at plant biodiversity preservation (Review). Cytology and Genetics, 44: 174-185. [DOI:10.3103/S0095452710030096]
4. Collard, B.C. and Mackill, D.J. (2009). Start codon targeted (SCoT) polymorphism: a simple, novel DNA marker technique for generating gene-targeted markers in plants. Plant Molecular Biology Reporter, 27(1): 86-93. [DOI:10.1007/s11105-008-0060-5]
5. Darvishian, A., Ismaili, A., Nazarian-Firouzabadi, F., MirDrikvand, R. and Hosseinpour, T. (2016). Assessment of genetic diversity among wheat genotypes of west Iran, using randomized markers. Plant Genetic Researches, 2(2): 47-56 (In Persian). [DOI:10.29252/pgr.2.2.47]
6. Ebrahimiyan, M., Mortazavian, S.M., Ebrahimi, M. and Ramshini, H. (2015). Assessment of molecular diversity in some ecotypes of Cumin (Cuminum cyminum L.) by SCoT markers, 2nd International and 14th Iranian Genetics Congress, University of Tehran, Tehran, Iran (In Persian).
7. Golparvar, A.R. (2011). Genetic improvement of essence percent and dry flower yield in German chamomile (Matricaria chamomilla) populations. I International Symposium on Medicinal, Aromatic and Nutraceutical Plants from Mountainous Areas, Saas-Fee, Switzerland. [DOI:10.17660/ActaHortic.2012.955.29]
8. Gorji, A.M., Poczai, P., Polgar, Z. and Taller, J. (2011). Efficiency of arbitrarily amplified dominant markers (SCoT, ISSR and RAPD) for diagnostic fingerprinting in tetraploid potato. American Journal of Potato Research, 88: 226-237. [DOI:10.1007/s12230-011-9187-2]
9. Jiang, L.F., Qi, X., Zhang, X.Q., Huang, L.K., Ma, X. and Xie, W.G. (2014). Analysis of diversity and relationships among orchard grass (Dactylis glomerata L.) accessions using start codon-targeted markers. Genetics and Molecular Research, 13(2): 4406-4418. [DOI:10.4238/2014.June.11.4]
10. Murray, M.G. and Thomson, W.F. (1980). Rapid isolation of high molecular weight plant DNA. Nucleic Acid Research, 8: 4321-4325. [DOI:10.1093/nar/8.19.4321]
11. Omidbaigi, R. (2005). Approaches to Production and Processing of Medicinal Plants. Tarahan Nashr Publication, Tehran, IR (In Persian).
12. Pakseresht, F., Talebi, R. and Karami, E. (2013). Comparative assessment of ISSR, DAMD and SCoT markers for evaluation of genetic diversity and conservation of landrace chickpea (Cicer arietinum L.) genotypes collected from north-west of Iran. Physiology and Molecular Biology of Plants, 19(4): 563-574 (In Persian). [DOI:10.1007/s12298-013-0181-7]
13. Que, Y., Pan, Y., Lu, Y., Yang, C., Yang, Y., Huang, N. and Xu, L. (2014). Genetic analysis of diversity within a Chinese local sugarcane germplasm based on start codon targeted polymorphism. BioMed Research International, 2014: 468375. [DOI:10.1155/2014/468375]
14. Rafizadeh, A. (2016). Evaluation of phylogenetic relationships, population structure and genetic diversity of Silybum marianum populations using SCoT marker. M.Sc. Thesis, Payame Noor University, Tehran, Iran (In Persian).
15. Rahimmalek, M. (2007). Isolation and design of microsatellite markers and study of genetic diversity in Yarrow's Yarn using morphological and molecular properties. Ph.D. Thesis, Isfahan University of Technology, Isfahan, Iran (In Persian).
16. Ramezanpour, M. (2011). Study of genetic structure of chamomile populations using molecular markers. M.Sc. Thesis, University of Guilan, Gilan, Iran (In Persian).
17. Rohlf, F.J. (1998). NTSYS-pc Numerical Taxonomy and Multivariate Analysis System, Version 2.02. Exeter Software. Setauket, New York, USA.
18. Salehi, K. (2010). Evaluation of genetic diversity among Matricaria chamomilla masses in Iran using semi-random markers of ISJ. M.Sc. Thesis, Lorestan University. Khorramabad, Iran (In Persian).
19. Sepahvand, N., Sarhangi, M., Mehrabi, R. and Mostafavi, K. (2015). Study on genetic diversity of Quinoa morphotypes using microsatellite molecular markers. Modern Genetics Journal, 10(1): 115-122 (In Persian).
20. Shahlaei, A., Torabi, S. and Khosroshahli, M. (2014). Efficacy of SCoT and ISSR markers in assessment of tomato (Lycopersicum esculentum Mill.) genetic diversity. International Journal of Biosciences, 5: 14-22. [DOI:10.12692/ijb/5.2.14-22]
21. Shojaifar, S. (2011). Study on the genetic diversity of the traits associated with the production of Iranian Fennel cultivars Foeniculum vulgare Mill. M.Sc. Thesis, Isfahan University of Technology, Isfahan, Iran (In Persian).
22. Shuorvazdi, A., Mohammadi, S.A., Norozi, M. and Sadeghzadeh, B. (2014). Molecular analysis of genetic diversity and relationships of barley landraces based on microsatellite markers. Plant Genetic Researches, 1(1): 51-64 (In Persian). [DOI:10.29252/pgr.1.1.51]
23. Singh, O., Khanam, Z., Misra, N. and Srivastava, M.K. (2011). Chamomile (Matricaria chamomilla L.): an overview. Pharmacognosy Reviews, 5(9): 82-95. [DOI:10.4103/0973-7847.79103]
24. Solouki, M., Mehdikhani, H., Zeinali, H. and Emamjomeh, A.A. (2008). Study of genetic diversity in Chamomile (Matricaria chamomilla) based on morphological traits and molecular markers. Scientia Horticulturae, 117(3): 281-287 (In Persian). [DOI:10.1016/j.scienta.2008.03.029]
25. Sorkheh, K., Amirbakhtiar, N. and Ercisli, S. (2016). Potential start codon targeted (SCoT) and inter-retrotransposon amplified polymorphism (IRAP) markers for evaluation of genetic diversity and conservation of wild Pistacia species population. Biochemical Genetics, 54(4): 368-387. [DOI:10.1007/s10528-016-9725-1]
26. Tahir, M.H.N., Sadaqat, H.A. and Bashir, S. (2002). Correlation and path coefficient analysis of morphological traits in sunflower (Helianthus annuus L.) populations. International Journal of Agricultural Biology, 4(3): 341-343.
27. Thimmappaiah, W., Santhosh, G., Shobha, D. and Melwyn, G.S. (2009). Assessment of genetic diversity in cashew germplasm using RAPD and ISSR markers. Scientia Horticulturae, 120(3): 411-417. [DOI:10.1016/j.scienta.2008.11.022]
28. Zarei, P., Badakhshan, H. and Mirzaghaderi, G. (2013). Investigation of genetic diversity in cultivated and wild oats genotypes using SCoT molecular marker. The 1st International and 12th Congress of Iranian Genetics, Tehran, Iran (In Persian).
29. Zhang, J., Wengang, X., Wang, Y. and Zhao, X. (2015). Potential of start codon targeted (SCoT) markers to estimate genetic diversity and Relationships among Chinese Elymus sibiricus accessions. Molecules, 20: 5987-6001. [DOI:10.3390/molecules20045987]
30. Zirak, R., Soleimani, A., Zeinolabedini, M., Hatami Maleki, H. and Kheiri, A. (2018). Morphological and AFLP-based genetic diversity assessment of Elaeagnus angustifolia L. Plant Genetic Researches, 5(2): 41-54 (In Persian). [DOI:10.29252/pgr.5.2.41]
ارسال پیام به نویسنده مسئول



XML   English Abstract   Print


Download citation:
BibTeX | RIS | EndNote | Medlars | ProCite | Reference Manager | RefWorks
Send citation to:

Tahani L, Koohi Dehkordi M, Dehghanzade H. Evaluation of genetic diversity among Iranian chamomilla Matricaria using Scot Markers. pgr 2019; 6 (1) :87-98
URL: http://pgr.lu.ac.ir/article-1-117-fa.html

طحانی لیلی، کوهی دهکردی مهرآنا، دهقان زاده حمید. بررسی تنوع ژنتیکی جمعیت‌های بابونه آلمانی کشت شده در ایران با استفاده از نشانگر SCoT. پژوهش های ژنتیک گیاهی. 1398; 6 (1) :87-98

URL: http://pgr.lu.ac.ir/article-1-117-fa.html



بازنشر اطلاعات
Creative Commons License این مقاله تحت شرایط Creative Commons Attribution-NonCommercial 4.0 International License قابل بازنشر است.
دوره 6، شماره 1 - ( 1398 ) برگشت به فهرست نسخه ها
پژوهش های ژنتیک گیاهی Plant Genetic Researches
Persian site map - English site map - Created in 0.06 seconds with 40 queries by YEKTAWEB 4657