[صفحه اصلی ]   [Archive] [ English ]  
:: صفحه اصلي :: درباره نشريه :: آخرين شماره :: تمام شماره‌ها :: جستجو :: ثبت نام :: ارسال مقاله :: تماس با ما ::
بخش‌های اصلی
صفحه اصلی::
اطلاعات نشریه::
آرشیو مجله و مقالات::
برای نویسندگان::
برای داوران::
ثبت نام و اشتراک::
تماس با ما::
تسهیلات پایگاه::
بایگانی مقالات زیر چاپ::
فهرست داوران همکار::
::
جستجو در پایگاه

جستجوی پیشرفته
..
دریافت اطلاعات پایگاه
نشانی پست الکترونیک خود را برای دریافت اطلاعات و اخبار پایگاه، در کادر زیر وارد کنید.
..
ISSN
شاپای آنلاین: ISSN 2676-7309
شاپای چاپی: ISSN 2383-1367
..




 
..
:: دوره 4، شماره 2 - ( 1396 ) ::
جلد 4 شماره 2 صفحات 28-17 برگشت به فهرست نسخه ها
بررسی تنوع ژنتیکی جمعیت‌های کدوتخم‌کاغذی (Cucurbita pepo var. styriaca) با استفاده از نشانگر‌های مولکولی ISSR
پریا امیری، احمد اسماعیلی*، جواد هادیان
، ismaili.a@lu.ac.ir
چکیده:   (18381 مشاهده)
مطالعه تنوع ژنتیکی در گیاهان دارویی، یکی از اهداف مهم به‌نژادی است. پیشرفت های اخیر در کاربرد واکنش زنجیر­ه­ای پلیمراز، امکان بررسی افراد یک جمعیت را در تعداد مکان‌های ژنی بیشتری از ژنوم فراهم ساخته است و از میان نشانگرهای مولکولی DNA، نشانگرISSR  نیز به طور موفقیت آمیزی در مطالعات مختلف تنوع ژنتیکی گیاهان استفاده شده است. در این پژوهش، تنوع ژنتیکی 43 نمونه از 5 جمعیت کدوتخم­کاغذی و 4 نمونه از 1 جمعیت کدوتنبل کشت شده در کلکسیون دانشگاه شهید بهشتی توسط 12 نشانگر  ISSRبررسی شد. در مجموع 83 نوار قابل امتیاز­دهی  به­دست آمد و میانگین نوارهای تولیدی توسط نشانگرها 91/6 بود و 100 درصد نوار­های قابل امتیاز­دهی چند شکلی نشان دادند. دندروگرام بر اساس ضریب تشابه جاکارد و روش خوشه­بندی CLink (Complete Linkage)، ترسیم گردید و پنج گروه اصلی به­دست آمد. نتایج به دست آمده از گروه­بندی با دو روش تجزیه به مختصات اصلی و تجزیه خوشه­ای نشان داد که گروه­بندی ارایه شده توسط دو روش مزبور با یکدیگر مشابه بودند. ضریب کوفنتیک محاسبه و 97/0 به­دست آمد. در مجموع نتایج نشان داد که برخی از نشانگرهای ISSR استفاده شده در این تحقیق، برای مطالعات آینده تنوع ژنتیکی در گونه Cucurbita pepo  مفید است.
واژه‌های کلیدی: کدو تخم کاغذی، تجزیه خوشه‌ای، تجزیه به مختصات اصلی، اطلاعات چندشکلی
متن کامل [PDF 880 kb]   (3920 دریافت)    
نوع مطالعه: پژوهشي | موضوع مقاله: ژنتیک گیاهی
فهرست منابع
1. Alikhani, L., Rahmani, M.S., Shabanian, N. and Badakhshan, H. (2014). Genetic diversity assessment of Quercus Infectoria and Q. libani populations in North-Zagros forests based on ISSR and IRAP markers. Iranian Journal of Rangelands and Forests Plant Breeding and Genetic Research, 22:79-90.
2. Anderson, J.A., Churchill, G.A., Autrique, J.E., Thanksley, S.D. and Sorrells, M.E. (1993). Optimizing parental selection for genetic linkage map. Genome, 36: 181-186. [DOI:10.1139/g93-024]
3. Shi, A., Kantartzi, S., Mmbaga, M. and Cen, P. (2010). Development of ISSR PCR markers for diversity study in dogwood. Agriculture and Biology Journal of North America, 1(3): 189-194. [DOI:10.5251/abjna.2010.1.3.189.194]
4. Arab Tajandareh, E., Ismaili, A., Rezaei Nenejad, A.H. and Karami, F. (2016). Assessment of Genetic Diversity and Heritability of Physiological and Phenological Characteristics of some Strawberry (Fragaria × ananassa Duch.) Genotypes under Climatic Conditions of Kurdistan, Iran. Plant Genetic Researches, 3(2): 43-58 (In Persian).
5. Barzegar, R. (2014). Genetic diversity of samples of Iranian pumpkin species using molecular and biochemical morphological characteristics. Ph.D. Thesis, 142p (In Persian).
6. Botstain, D., White, R.L., Skolnick, M. and Davis, R.W. (1980). Construction of a genetic linkage map in man using restriction fragment length polymorphisms. The American Journal of Human Genetics, 32: 314-331.
7. Celka, Z., Szczecinska, M. and Sawicki, J. (2010). Genetic relationship between some of Malva species as determined with ISSR and ISJ markers. Biodiversity Research and Conservation, 19: 23-32. [DOI:10.2478/v10119-010-0006-2]
8. Chen, Y., Zhau, R., Lin, X., Wu, K., Qian, X. and Huang, Sh. (2008). ISSR analysis of genetic diversity in sacred lotus cultivars. Aquatic Botany, 89: 311-316. [DOI:10.1016/j.aquabot.2008.03.006]
9. Chen, Z.W., Lu, R.J., Zou, L., Du, Z.Z., Gao, R.H., He, T. and Huang, J.H. (2012). Genetic diversity analysis of barley landraces and cultivars in the Shanghai region of China. Genetic and Molecular Researches, 11: 644-650. [DOI:10.4238/2012.March.16.2]
10. Denduangboripant, J., Sornsuda, S. and Suwanprasart, W. (2010). Determination of local tobacco cultivars using ISSR Molecular Marker. Chiang Mai Journal of Science, 37: 293-303.
11. Dos Santos, L.F., De Oliveria, E.J., Dos Santos Silva, A., De Carvalho, F.M., Costa, J.L. and Padua, J.G. (2011). ISSR Markers as a tool for the Assessment of Genetic Diversity in Passiflora Biochem, Biochem Genet. 49: 540- 554. [DOI:10.1007/s10528-011-9429-5]
12. Ehteshamnia, A., Sharifani, M., Vahdati, K. and Erfani Moghaddam, V. (2009). Investigation of genetic diversity among some native populations of walnut (Juglans regia L.) in Golestan province by SSR Markers. Journal of Plant Production, 16 (4): 39-58. (In Persian)
13. Esmailnia, E., Arefard, M., Shabani, S., Karimi, M., Vafadar, F. and Dehestani, A. (2015). Genetic diversity and phylogenetic relationship of Iranian indigenous cucurbits investigated by Inter Simple Sequence Repeat (ISSR) markers. Biharean Biologist, 9: 47-54.
14. El-Shawaf, I.I.S., Bekhit, M.M.M., Hassan, A.M., El-saied, F.M. and Masoud, I.M. (2009). Use RAPD and ISSR markers for the identification of Egyptian Henbane (Hyoscyamus muticus L.) genotypes. Genetics Cytology, 38: 17-28.
15. De Girorgio, D., Leo, L., Zacheo, G. and Lamasces, N. (2007). Evaluation of 52 almond (Prunus Amygdalus Batsch) cultivars from the Apulia region in Southern Italy. Horticultural Science and Biotechnology, 82: 541-546. [DOI:10.1080/14620316.2007.11512271]
16. Godwin, I.D., Aitken, E.A.B. and Smith, L.W. (1997). Application of inter simple sequence repeat (ISSR) markers to plant genetics. Electrophoresis, 18: 1524- 1528. [DOI:10.1002/elps.1150180906]
17. Grisales, S.O., García, D.B. and Vallejo Cabrera, F.A.V. (2009). Effect of inbreeding on the quality traits of squash fruit. Acta Agronómica, 9: 58-3.
18. Hatami, T., Kazemitabar, S.K., Kiani., GH. and Ismailzadehkenari, R. (2017). Genetic variation of squash pumpkins population using ISSR markers. Medicinal Plants Biotechnology, 1: 23-29 (In Persian).
19. Kameli, M., Hesamzadeh Hejazi, S.M. and Ebadi, M. (2013). Assessment of genetic diversity on populations of three satureja species in Iran using ISSR markers. Scholars Research Library, 4: 64-72.
20. Karimi, A., Hadian, J., Farzaneh, M. and Kadivi-Khub, A. (2014). Evaluation of genetic variability, rust resistance and marker detection in cultivated Artemisia dracunculus from Iran. Gene, 554(2): 224-232 [DOI:10.1016/j.gene.2014.10.057]
21. Mohammadi, S., Ashraf Mehrabi, A., Arminian, A. and Fazeli, A. (2014). Genetic Diversity Structure of Aegilops cylindrica Accessions Revealed by Genomic ISSR Markers. Plant Genetic Researches, 1:13-26 (In Persian). [DOI:10.29252/pgr.1.1.13]
22. Nee, M. (1990). The domestication of cucurbita (Cucurbitaceae). Economic Botany, 44: 56-68 [DOI:10.1007/BF02860475]
23. Powell, W., Morgante, M., Ander, C., Hanafey, M., Vogel, J., Tingy, S. and Rafalaski, V. (1996). The comparison of RFLP, RAPD, AFLP and SSR (microsatellite) marker for germplasm analysis. Molecular Breeding, 2: 225-238. [DOI:10.1007/BF00564200]
24. Rohlf, F.J. (1987). An empirical comparison of three ordination tech niques in numerical taxonomy. Systematic Biology, 21: 271-280. [DOI:10.1093/sysbio/21.3.271]
25. Shazdehahmadi, M. and Kharrazi, M. (2016). Application of ISSR Molecular Markers for Genetic Diversity Study of Some Tobacco Genotypes. Plant Genetic Researches, 2: 33-46 (In Persian). [DOI:10.29252/pgr.2.2.33]
26. Shinde, K., Shinde, V. and Kurane, J., Harsulkar, A. and Mahadik, K. (2010). Genetic diversity revealed ISSR molecular marker in different species of Ocimum. Planta Medical, 76: 2-5. [DOI:10.1055/s-0030-1264243]
27. Song, Z., Li, X., Wang, H. and Wang, J. (2010). Genetic diversity and population structure of salvia miltiorrhiza Bge. In china revealed by ISSR and SRAP. Genetica, 138: 241-49. [DOI:10.1007/s10709-009-9416-5]
28. Thimmappaiah, W., Santhosh, G., Shobha, D. and Melwyn, G.S. (2009). Assessment of genetic diversity in cashew germplasm using RAPD and ISSR markers. Scientia Horticulturae, 120: 411-417. [DOI:10.1016/j.scienta.2008.11.022]
29. Zargari, A. (2005). Medical Plants. Tehran University Press, Tehran, IR (In Persiaon).
30. Zietkiewicz, E., Rafalski, A. and Labuda, D. (1994). Genome fingerprinting by simple sequence repeat (SSR)-anchored polymerase chain reaction amplification. Genomics, 20: 176-183. [DOI:10.1006/geno.1994.1151]
ارسال پیام به نویسنده مسئول



XML   English Abstract   Print


Download citation:
BibTeX | RIS | EndNote | Medlars | ProCite | Reference Manager | RefWorks
Send citation to:

Evaluation of Genetic Diversity of Styrian Pumpkin (Cucurbita pepo var. styriaca) Populations, Using ISSR Molecular Markers. pgr 2018; 4 (2) :17-28
URL: http://pgr.lu.ac.ir/article-1-115-fa.html

امیری پریا، اسماعیلی احمد، هادیان جواد. بررسی تنوع ژنتیکی جمعیت‌های کدوتخم‌کاغذی (Cucurbita pepo var. styriaca) با استفاده از نشانگر‌های مولکولی ISSR. پژوهش های ژنتیک گیاهی. 1396; 4 (2) :17-28

URL: http://pgr.lu.ac.ir/article-1-115-fa.html



بازنشر اطلاعات
Creative Commons License این مقاله تحت شرایط Creative Commons Attribution-NonCommercial 4.0 International License قابل بازنشر است.
دوره 4، شماره 2 - ( 1396 ) برگشت به فهرست نسخه ها
پژوهش های ژنتیک گیاهی Plant Genetic Researches
Persian site map - English site map - Created in 0.06 seconds with 40 queries by YEKTAWEB 4657