Plant Genetic Researches
پژوهش های ژنتیک گیاهی
pgr
Agriculture
http://pgr.lu.ac.ir
1
admin
2383-1367
2676-7309
10.22034/pgr
14
1206
fa
jalali
1395
6
1
gregorian
2016
9
1
3
1
online
1
fulltext
fa
ارزیابی تنوع ژنتیکی برخی ارقام بهاره و پائیزه کلزا (Brassica napus L.) با استفاده از
نشانگر مولکولی SSR
Assessment of Genetic Diversity Among some Oilseed Rape (Brassica nupus L.)
Plants, using Single Sequence Repeats (SSR) Molecular Markers
بهنژادی گیاهی
Plant improvement
پژوهشي
Research
کلزا ).L napus Brassica ،)گیاهی روغنی و زراعی متعلق به خانوادهی شببو است. این خانواده دارای حدوداً 350 جنس و بیش از 3000 گونه است. به منظور بررسی تنوع ژنتیکی 21 رقم کلزا با استفاده از نشانگرهای مولکولی، از 11جفت آغازگر اختصاصی ریزماهوارهی SSR استفاده شد. آغازگرها در مجموع 76 باند واضح تولید نمودند که 46 باند از آنها چند شکل )5/60 درصد( بودند. میانگین تعداد باندهای تکثیری به ازای هر جفت آغازگر و ژنوتیپ به ترتیب 9/6 و 6/3 بود. هر جفت آغازگر به طور متوسط 2/4 باند چند شکل تولید نمود. در بین آغازگرها، بیشترین تعداد باند تکثیری مربوط به آغازگرهای Na10A09 وCB10036B با 10 باند و کمترین تعداد باند مربوط به آغازگر CB10403 با 4 باند بود. تجزیه خوشهای به روش UPGMA و با استفاده از ماتریس تشابه دایس، ژنوتیپهای کلزا را به 3 گروه اصلی تقسیم نمود. رقم Licord به تنهایی یک گروه را تشکیل داد، درحالی که از لحاظ خصوصیات مرفولوژیکی با بیشتر ژنوتیپها شباهت باالیی داشت. این موضوع احتماالً به دلیل تفاوت در سطح پلوئیدی این ژنوتیپ و یا نامگذاری اشتباه آن میباشد. براساس نتایج حاصل از ماتریس تشابه، بیشترین شباهت )99/0 )مربوط به ژنوتیپهای Zarfam و Gerinimo و کمترین تشابه )72/0 )مربوط به ژنوتیپهای 11-KS و Licord بود. نتایج گروهبندی ژنوتیپها نشان داد که ژنوتیپهای ایرانی و خارجی در یک گروه قرار گرفتند. این موضوع احتماالً قرابت و خویشاوندی نزدیک ژنوتیپهای ایرانی و خارجی را نشان میدهد. نتایج حاصل از تجزیهی مولکولی (AMOVA (دادهها نشان داد که میزان تنوع درون گروهی )پائیزه- بهاره( بیشتر از تنوع بین گروهی است به طوری که 97 درصد تنوع مربوط به تنوع درون گروهها بود.
Oilseed rape (Brassica nupus L), a member of Brassicaceae family, is an important crop regarding oil production worldwide. Brassicaceae is an economically important family of flowering plants with about 350 genera and more than 3000 species. Eleven pairs of single sequence repeat (SSR) primers were used to identify the genetic diversity among 21 oilseed rape genotypes. Results of SSR molecular marker analysis revealed that SSR primers produced a total number of 76 scorable bands of which 46 (60.5%) bands were polymorphics. The average number of bands for each primer and genotype was 6.9 and 3.6, respectively. Both CB10036B and Na10A09 primers produced 10 and Cb10403 primer produced 4 polymorphic bands, respectively. UPGMA cluster analysis based on Dice similarity matrix showed that Zarfam and Gerinimo genotypes had the highest (0.99%) and Licord and KS-11 genotypes had the lowest (0.72%) similarity. Both Iranian and foreign genotypes were grouped together in one major cluster, indicating presumably they may have the same origin and/or common pedigree. Results of AMOVA analysis within and between groups (spring – Autumn) revealed that almost 97% of total genetic diversity belonged to within group genotypes.
ریزماهواره, کلزا, خوشهبندی, واکنش زنجیرهای پلیمراز
Microsatellite, Canola, Clustering, Polymerase chain reaction
45
56
http://pgr.lu.ac.ir/browse.php?a_code=A-10-25-32&slc_lang=fa&sid=1
Hadi
Karimbeigi
هادی
کریم بیگی
1003194753284600608
1003194753284600608
No
Former M.Sc. Student, Department of Agronomy and Plant Breeding, Faculty of Agriculture, Lorestan University, Khorramabad, Iran
دانشگاه لرستان
Farhad
Nazarian-Firouzabadi
فرهاد
نظریان فیروزآبادی
1003194753284600609
1003194753284600609
Yes
Associate Professor, Department of Agronomy and Plant Breeding, Faculty of Agriculture, Lorestan University, Khorramabad, Iran
دانشگاه لرستان
Mitra
Khademi
میترا
خادمی
1003194753284600610
1003194753284600610
No
Ph.D Student, Department of Agronomy and Plant Breeding, Faculty of Agriculture, Lorestan University, Khorramabad, Iran
دانشگاه لرستان
Elham
Mousav
الهام
موسوی
1003194753284600611
1003194753284600611
No
Former M.Sc. Student, Department of Agronomy and Plant Breeding, Faculty of Agriculture, Lorestan University, Khorramabad, Iran
دانشگاه لرستان